MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011311	ACTCAA	2	12	7629	7640	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	215778360
2	NC_011311	TGGCCG	2	12	15941	15952	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	215778368
3	NC_011311	CACGAG	2	12	17265	17276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778368
4	NC_011311	AAAAGT	2	12	17711	17722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	215778368
5	NC_011311	ACTCAA	2	12	18535	18546	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	215778370
6	NC_011311	ATGGCG	2	12	19143	19154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	215778370
7	NC_011311	AAAAAG	2	12	20277	20288	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	215778370
8	NC_011311	GAGCAA	2	12	20336	20347	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	215778370
9	NC_011311	AGAAAA	2	12	20643	20654	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	215778371
10	NC_011311	GACAAA	2	12	24709	24720	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	215778371
11	NC_011311	TTGATA	2	12	30712	30723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	215778377
12	NC_011311	CGAATA	2	12	31319	31330	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011311	TAATGC	2	12	33462	33473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	215778383
14	NC_011311	TTTTCA	2	12	33811	33822	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	215778383
15	NC_011311	TTTACG	2	12	36302	36313	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	215778386
16	NC_011311	AAAGGC	2	12	39753	39764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	215778388
17	NC_011311	TCCATA	2	12	42310	42321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778389
18	NC_011311	AGCTTA	2	12	43112	43123	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	215778390
19	NC_011311	CATCAC	2	12	46108	46119	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	215778392
20	NC_011311	ATTTCC	2	12	46703	46714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	215778393
21	NC_011311	ATGAAG	2	12	52910	52921	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011311	CCAACG	2	12	53580	53591	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	215778399
23	NC_011311	CTCCCC	2	12	56646	56657	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
24	NC_011311	AAAAAT	2	12	57477	57488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	215778402
25	NC_011311	TTTTTG	2	12	58392	58403	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	215778403
26	NC_011311	GTGATG	2	12	59353	59364	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011311	TGTTCC	2	12	59740	59751	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	215778405
28	NC_011311	TAGTGA	2	12	61309	61320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778405
29	NC_011311	TTTTCA	2	12	71507	71518	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	215778411
30	NC_011311	ATTTTT	2	12	74111	74122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	215778414
31	NC_011311	ATCTAA	2	12	74554	74565	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	215778414
32	NC_011311	ATGCCA	2	12	80820	80831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	215778420
33	NC_011311	ATACAT	2	12	82289	82300	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	215778422
34	NC_011311	TTGATT	2	12	82937	82948	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	215778422
35	NC_011311	AACAAA	2	12	83156	83167	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	215778422

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.