MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011311	AGTA	2	8	57	64	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011311	AAAT	2	8	276	283	75 %	25 %	0 %	0 %	215778351
3	NC_011311	AATA	2	8	293	300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011311	CACG	2	8	969	976	25 %	0 %	25 %	50 %	215778353
5	NC_011311	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	215778353
6	NC_011311	GATT	2	8	1052	1059	25 %	50 %	25 %	0 %	215778354
7	NC_011311	TTGA	2	8	2072	2079	25 %	50 %	25 %	0 %	215778355
8	NC_011311	TCAA	2	8	2199	2206	50 %	25 %	0 %	25 %	215778355
9	NC_011311	CAAT	2	8	2576	2583	50 %	25 %	0 %	25 %	215778356
10	NC_011311	CAAT	2	8	3692	3699	50 %	25 %	0 %	25 %	215778356
11	NC_011311	CAAC	2	8	4029	4036	50 %	0 %	0 %	50 %	215778357
12	NC_011311	GCCT	2	8	4153	4160	0 %	25 %	25 %	50 %	215778357
13	NC_011311	TTTG	2	8	4601	4608	0 %	75 %	25 %	0 %	215778358
14	NC_011311	TTTG	2	8	5942	5949	0 %	75 %	25 %	0 %	215778358
15	NC_011311	CGAC	2	8	5972	5979	25 %	0 %	25 %	50 %	215778358
16	NC_011311	CGTG	2	8	6564	6571	0 %	25 %	50 %	25 %	215778358
17	NC_011311	CCCG	2	8	7950	7957	0 %	0 %	25 %	75 %	215778361
18	NC_011311	GCGT	2	8	8320	8327	0 %	25 %	50 %	25 %	215778361
19	NC_011311	CCAT	2	8	8625	8632	25 %	25 %	0 %	50 %	215778361
20	NC_011311	TTAA	2	8	8949	8956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011311	TCGC	2	8	9543	9550	0 %	25 %	25 %	50 %	215778362
22	NC_011311	GCTC	2	8	10236	10243	0 %	25 %	25 %	50 %	215778363
23	NC_011311	CAAC	2	8	10716	10723	50 %	0 %	0 %	50 %	215778363
24	NC_011311	GAAG	2	8	10736	10743	50 %	0 %	50 %	0 %	215778363
25	NC_011311	CCTT	2	8	10777	10784	0 %	50 %	0 %	50 %	215778363
26	NC_011311	TCAA	2	8	11802	11809	50 %	25 %	0 %	25 %	215778364
27	NC_011311	CAAT	2	8	11818	11825	50 %	25 %	0 %	25 %	215778364
28	NC_011311	AGAC	2	8	11890	11897	50 %	0 %	25 %	25 %	215778364
29	NC_011311	ATTT	2	8	12220	12227	25 %	75 %	0 %	0 %	215778364
30	NC_011311	ATCA	2	8	12341	12348	50 %	25 %	0 %	25 %	215778365
31	NC_011311	TTTC	2	8	12574	12581	0 %	75 %	0 %	25 %	215778365
32	NC_011311	TTTC	2	8	13220	13227	0 %	75 %	0 %	25 %	215778366
33	NC_011311	TTAA	2	8	13422	13429	50 %	50 %	0 %	0 %	215778366
34	NC_011311	TGTT	2	8	13716	13723	0 %	75 %	25 %	0 %	215778367
35	NC_011311	AATC	2	8	14501	14508	50 %	25 %	0 %	25 %	215778367
36	NC_011311	ATGA	2	8	14513	14520	50 %	25 %	25 %	0 %	215778367
37	NC_011311	TAAG	2	8	14667	14674	50 %	25 %	25 %	0 %	215778367
38	NC_011311	ACTC	2	8	14706	14713	25 %	25 %	0 %	50 %	215778367
39	NC_011311	TGAT	2	8	15164	15171	25 %	50 %	25 %	0 %	215778368
40	NC_011311	GCTC	2	8	15245	15252	0 %	25 %	25 %	50 %	215778368
41	NC_011311	ACCT	2	8	15619	15626	25 %	25 %	0 %	50 %	215778368
42	NC_011311	TTAT	2	8	15907	15914	25 %	75 %	0 %	0 %	215778368
43	NC_011311	CTTG	2	8	16383	16390	0 %	50 %	25 %	25 %	215778368
44	NC_011311	TGAG	2	8	16646	16653	25 %	25 %	50 %	0 %	215778368
45	NC_011311	AATC	2	8	17092	17099	50 %	25 %	0 %	25 %	215778368
46	NC_011311	GAAA	2	8	17193	17200	75 %	0 %	25 %	0 %	215778368
47	NC_011311	AATA	2	8	17311	17318	75 %	25 %	0 %	0 %	215778368
48	NC_011311	GGCG	2	8	17358	17365	0 %	0 %	75 %	25 %	215778368
49	NC_011311	ACCG	2	8	17479	17486	25 %	0 %	25 %	50 %	215778368
50	NC_011311	CAAA	2	8	17499	17506	75 %	0 %	0 %	25 %	215778368
51	NC_011311	TATT	2	8	17791	17798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011311	CTTA	2	8	17827	17834	25 %	50 %	0 %	25 %	215778369
53	NC_011311	TCAA	2	8	18067	18074	50 %	25 %	0 %	25 %	215778369
54	NC_011311	GCCC	2	8	18114	18121	0 %	0 %	25 %	75 %	215778369
55	NC_011311	AAGA	2	8	20319	20326	75 %	0 %	25 %	0 %	215778370
56	NC_011311	TGGA	2	8	20741	20748	25 %	25 %	50 %	0 %	215778371
57	NC_011311	ATCA	2	8	21598	21605	50 %	25 %	0 %	25 %	215778371
58	NC_011311	TCAA	2	8	22424	22431	50 %	25 %	0 %	25 %	215778371
59	NC_011311	CAAA	2	8	22524	22531	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
60	NC_011311	GACG	2	8	22950	22957	25 %	0 %	50 %	25 %	215778371
61	NC_011311	CAAC	2	8	23216	23223	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
62	NC_011311	CCAT	2	8	23495	23502	25 %	25 %	0 %	50 %	215778371
63	NC_011311	TCAC	2	8	23561	23568	25 %	25 %	0 %	50 %	215778371
64	NC_011311	ACTC	2	8	23604	23611	25 %	25 %	0 %	50 %	215778371
65	NC_011311	AAAG	2	8	23620	23627	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
66	NC_011311	CAAA	2	8	23747	23754	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
67	NC_011311	AAGC	2	8	24159	24166	50 %	0 %	25 %	25 %	215778371
68	NC_011311	AACA	2	8	24559	24566	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
69	NC_011311	CAAC	2	8	24677	24684	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
70	NC_011311	AAAG	2	8	25078	25085	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
71	NC_011311	CAAA	2	8	25235	25242	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
72	NC_011311	ATTA	2	8	25869	25876	50 %	50 %	0 %	0 %	215778371
73	NC_011311	ACCA	2	8	26038	26045	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
74	NC_011311	AAGA	2	8	26234	26241	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
75	NC_011311	GAAC	2	8	26250	26257	50 %	0 %	25 %	25 %	215778371
76	NC_011311	GAGT	2	8	26514	26521	25 %	25 %	50 %	0 %	215778372
77	NC_011311	TCAC	2	8	26583	26590	25 %	25 %	0 %	50 %	215778372
78	NC_011311	ACAA	2	8	26891	26898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011311	AAGG	2	8	27332	27339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011311	TTCA	2	8	27675	27682	25 %	50 %	0 %	25 %	215778373
81	NC_011311	CAAC	2	8	28395	28402	50 %	0 %	0 %	50 %	215778375
82	NC_011311	GCTT	2	8	28936	28943	0 %	50 %	25 %	25 %	215778375
83	NC_011311	ATGA	2	8	29474	29481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011311	CTTT	2	8	29578	29585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011311	GCTT	2	8	29633	29640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011311	TAAA	2	8	29728	29735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011311	CCAA	2	8	29845	29852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011311	TAAC	2	8	30068	30075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011311	ATAA	2	8	30463	30470	75 %	25 %	0 %	0 %	215778376
90	NC_011311	ACTT	2	8	30643	30650	25 %	50 %	0 %	25 %	215778377
91	NC_011311	TAAC	2	8	30702	30709	50 %	25 %	0 %	25 %	215778377
92	NC_011311	GTTT	2	8	30874	30881	0 %	75 %	25 %	0 %	215778377
93	NC_011311	CAAC	2	8	31156	31163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011311	TTTA	2	8	31335	31342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011311	GCAA	2	8	31577	31584	50 %	0 %	25 %	25 %	215778378
96	NC_011311	TGAA	2	8	31626	31633	50 %	25 %	25 %	0 %	215778378
97	NC_011311	CAAT	2	8	31648	31655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011311	TCAA	2	8	31961	31968	50 %	25 %	0 %	25 %	215778379
99	NC_011311	ATGG	2	8	32088	32095	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011311	GTAA	2	8	32242	32249	50 %	25 %	25 %	0 %	215778380
101	NC_011311	CTTT	2	8	32639	32646	0 %	75 %	0 %	25 %	215778381
102	NC_011311	AATG	2	8	32798	32805	50 %	25 %	25 %	0 %	215778381
103	NC_011311	TAAT	2	8	33051	33058	50 %	50 %	0 %	0 %	215778382
104	NC_011311	ATCC	2	8	33388	33395	25 %	25 %	0 %	50 %	215778383
105	NC_011311	ATCG	2	8	33615	33622	25 %	25 %	25 %	25 %	215778383
106	NC_011311	TTAA	2	8	33893	33900	50 %	50 %	0 %	0 %	215778384
107	NC_011311	GCCT	2	8	34212	34219	0 %	25 %	25 %	50 %	215778384
108	NC_011311	TTGC	2	8	34220	34227	0 %	50 %	25 %	25 %	215778384
109	NC_011311	TGAG	2	8	34298	34305	25 %	25 %	50 %	0 %	215778384
110	NC_011311	CTTT	2	8	34538	34545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011311	TAAT	2	8	34930	34937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011311	TAAC	2	8	34944	34951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011311	ATCA	2	8	35113	35120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011311	AACT	2	8	35431	35438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011311	TTAT	2	8	35534	35541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011311	TAAA	2	8	35558	35565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011311	ATTT	2	8	35580	35587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011311	TTTG	2	8	37335	37342	0 %	75 %	25 %	0 %	215778386
119	NC_011311	CAAT	2	8	37532	37539	50 %	25 %	0 %	25 %	215778386
120	NC_011311	CAAG	2	8	37885	37892	50 %	0 %	25 %	25 %	215778386
121	NC_011311	AAAC	2	8	38012	38019	75 %	0 %	0 %	25 %	215778386
122	NC_011311	AAAC	2	8	38547	38554	75 %	0 %	0 %	25 %	215778386
123	NC_011311	ATTT	2	8	38687	38694	25 %	75 %	0 %	0 %	215778387
124	NC_011311	CAGT	2	8	38838	38845	25 %	25 %	25 %	25 %	215778387
125	NC_011311	TCTT	2	8	38897	38904	0 %	75 %	0 %	25 %	215778387
126	NC_011311	CCTC	2	8	38942	38949	0 %	25 %	0 %	75 %	215778387
127	NC_011311	ACAA	2	8	39690	39697	75 %	0 %	0 %	25 %	215778388
128	NC_011311	TCAG	2	8	39948	39955	25 %	25 %	25 %	25 %	215778388
129	NC_011311	AATA	2	8	40027	40034	75 %	25 %	0 %	0 %	215778388
130	NC_011311	GTGG	2	8	40681	40688	0 %	25 %	75 %	0 %	215778388
131	NC_011311	GGAG	2	8	40909	40916	25 %	0 %	75 %	0 %	215778388
132	NC_011311	TTAA	2	8	41041	41048	50 %	50 %	0 %	0 %	215778388
133	NC_011311	GAAA	2	8	41155	41162	75 %	0 %	25 %	0 %	215778388
134	NC_011311	TTCT	2	8	41195	41202	0 %	75 %	0 %	25 %	215778388
135	NC_011311	GGTA	2	8	41265	41272	25 %	25 %	50 %	0 %	215778388
136	NC_011311	GAAA	2	8	41600	41607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011311	ATCT	2	8	41726	41733	25 %	50 %	0 %	25 %	215778389
138	NC_011311	CACT	2	8	41878	41885	25 %	25 %	0 %	50 %	215778389
139	NC_011311	TGGC	2	8	41921	41928	0 %	25 %	50 %	25 %	215778389
140	NC_011311	GATT	2	8	42443	42450	25 %	50 %	25 %	0 %	215778389
141	NC_011311	ATGT	2	8	42551	42558	25 %	50 %	25 %	0 %	215778389
142	NC_011311	CTGT	2	8	42819	42826	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011311	AAAT	2	8	43290	43297	75 %	25 %	0 %	0 %	215778390
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.