MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011311	AGTA	2	8	57	64	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011311	AATA	2	8	293	300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011311	TTAA	2	8	8949	8956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011311	TATT	2	8	17791	17798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011311	ACAA	2	8	26891	26898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011311	AAGG	2	8	27332	27339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011311	ATGA	2	8	29474	29481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011311	CTTT	2	8	29578	29585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011311	GCTT	2	8	29633	29640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011311	TAAA	2	8	29728	29735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011311	CCAA	2	8	29845	29852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011311	TAAC	2	8	30068	30075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011311	CAAC	2	8	31156	31163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011311	TTTA	2	8	31335	31342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011311	CAAT	2	8	31648	31655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011311	ATGG	2	8	32088	32095	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011311	CTTT	2	8	34538	34545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011311	TAAT	2	8	34930	34937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011311	TAAC	2	8	34944	34951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011311	ATCA	2	8	35113	35120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011311	AACT	2	8	35431	35438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011311	TTAT	2	8	35534	35541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011311	TAAA	2	8	35558	35565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011311	ATTT	2	8	35580	35587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011311	GAAA	2	8	41600	41607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011311	CTGT	2	8	42819	42826	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011311	ATTA	2	8	46329	46336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011311	ATTT	2	8	46542	46549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011311	TGTT	2	8	47808	47815	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011311	ATTT	2	8	49145	49152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011311	CTTT	2	8	51964	51971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011311	ACCA	2	8	52073	52080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011311	TTTA	2	8	52182	52189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011311	ATTG	2	8	54333	54340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011311	ATTA	2	8	54365	54372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011311	GTAT	2	8	56834	56841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011311	TTTC	2	8	58038	58045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011311	CATT	2	8	59321	59328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011311	TTTA	2	8	61812	61819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011311	ATTA	2	8	62108	62115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011311	ATAA	2	8	67322	67329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011311	TTTA	2	8	67376	67383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011311	ATAG	2	8	74667	74674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011311	TTAG	2	8	74684	74691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011311	ACCA	2	8	74741	74748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011311	TCAA	2	8	74753	74760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011311	TTAA	2	8	77032	77039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011311	TCAC	2	8	78172	78179	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011311	TTGT	2	8	78190	78197	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011311	AGAA	2	8	78208	78215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011311	GAAA	2	8	78314	78321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011311	CTGG	2	8	78374	78381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011311	AATG	2	8	78435	78442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011311	ATTT	2	8	78476	78483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011311	TTAT	2	8	78486	78493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011311	ATTA	2	8	80001	80008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011311	CGTG	2	8	80182	80189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011311	TGAT	2	8	80535	80542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.