MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011311	AAAT	2	8	276	283	75 %	25 %	0 %	0 %	215778351
2	NC_011311	CACG	2	8	969	976	25 %	0 %	25 %	50 %	215778353
3	NC_011311	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	215778353
4	NC_011311	GATT	2	8	1052	1059	25 %	50 %	25 %	0 %	215778354
5	NC_011311	TTGA	2	8	2072	2079	25 %	50 %	25 %	0 %	215778355
6	NC_011311	TCAA	2	8	2199	2206	50 %	25 %	0 %	25 %	215778355
7	NC_011311	CAAT	2	8	2576	2583	50 %	25 %	0 %	25 %	215778356
8	NC_011311	CAAT	2	8	3692	3699	50 %	25 %	0 %	25 %	215778356
9	NC_011311	CAAC	2	8	4029	4036	50 %	0 %	0 %	50 %	215778357
10	NC_011311	GCCT	2	8	4153	4160	0 %	25 %	25 %	50 %	215778357
11	NC_011311	TTTG	2	8	4601	4608	0 %	75 %	25 %	0 %	215778358
12	NC_011311	TTTG	2	8	5942	5949	0 %	75 %	25 %	0 %	215778358
13	NC_011311	CGAC	2	8	5972	5979	25 %	0 %	25 %	50 %	215778358
14	NC_011311	CGTG	2	8	6564	6571	0 %	25 %	50 %	25 %	215778358
15	NC_011311	CCCG	2	8	7950	7957	0 %	0 %	25 %	75 %	215778361
16	NC_011311	GCGT	2	8	8320	8327	0 %	25 %	50 %	25 %	215778361
17	NC_011311	CCAT	2	8	8625	8632	25 %	25 %	0 %	50 %	215778361
18	NC_011311	TCGC	2	8	9543	9550	0 %	25 %	25 %	50 %	215778362
19	NC_011311	GCTC	2	8	10236	10243	0 %	25 %	25 %	50 %	215778363
20	NC_011311	CAAC	2	8	10716	10723	50 %	0 %	0 %	50 %	215778363
21	NC_011311	GAAG	2	8	10736	10743	50 %	0 %	50 %	0 %	215778363
22	NC_011311	CCTT	2	8	10777	10784	0 %	50 %	0 %	50 %	215778363
23	NC_011311	TCAA	2	8	11802	11809	50 %	25 %	0 %	25 %	215778364
24	NC_011311	CAAT	2	8	11818	11825	50 %	25 %	0 %	25 %	215778364
25	NC_011311	AGAC	2	8	11890	11897	50 %	0 %	25 %	25 %	215778364
26	NC_011311	ATTT	2	8	12220	12227	25 %	75 %	0 %	0 %	215778364
27	NC_011311	ATCA	2	8	12341	12348	50 %	25 %	0 %	25 %	215778365
28	NC_011311	TTTC	2	8	12574	12581	0 %	75 %	0 %	25 %	215778365
29	NC_011311	TTTC	2	8	13220	13227	0 %	75 %	0 %	25 %	215778366
30	NC_011311	TTAA	2	8	13422	13429	50 %	50 %	0 %	0 %	215778366
31	NC_011311	TGTT	2	8	13716	13723	0 %	75 %	25 %	0 %	215778367
32	NC_011311	AATC	2	8	14501	14508	50 %	25 %	0 %	25 %	215778367
33	NC_011311	ATGA	2	8	14513	14520	50 %	25 %	25 %	0 %	215778367
34	NC_011311	TAAG	2	8	14667	14674	50 %	25 %	25 %	0 %	215778367
35	NC_011311	ACTC	2	8	14706	14713	25 %	25 %	0 %	50 %	215778367
36	NC_011311	TGAT	2	8	15164	15171	25 %	50 %	25 %	0 %	215778368
37	NC_011311	GCTC	2	8	15245	15252	0 %	25 %	25 %	50 %	215778368
38	NC_011311	ACCT	2	8	15619	15626	25 %	25 %	0 %	50 %	215778368
39	NC_011311	TTAT	2	8	15907	15914	25 %	75 %	0 %	0 %	215778368
40	NC_011311	CTTG	2	8	16383	16390	0 %	50 %	25 %	25 %	215778368
41	NC_011311	TGAG	2	8	16646	16653	25 %	25 %	50 %	0 %	215778368
42	NC_011311	AATC	2	8	17092	17099	50 %	25 %	0 %	25 %	215778368
43	NC_011311	GAAA	2	8	17193	17200	75 %	0 %	25 %	0 %	215778368
44	NC_011311	AATA	2	8	17311	17318	75 %	25 %	0 %	0 %	215778368
45	NC_011311	GGCG	2	8	17358	17365	0 %	0 %	75 %	25 %	215778368
46	NC_011311	ACCG	2	8	17479	17486	25 %	0 %	25 %	50 %	215778368
47	NC_011311	CAAA	2	8	17499	17506	75 %	0 %	0 %	25 %	215778368
48	NC_011311	CTTA	2	8	17827	17834	25 %	50 %	0 %	25 %	215778369
49	NC_011311	TCAA	2	8	18067	18074	50 %	25 %	0 %	25 %	215778369
50	NC_011311	GCCC	2	8	18114	18121	0 %	0 %	25 %	75 %	215778369
51	NC_011311	AAGA	2	8	20319	20326	75 %	0 %	25 %	0 %	215778370
52	NC_011311	TGGA	2	8	20741	20748	25 %	25 %	50 %	0 %	215778371
53	NC_011311	ATCA	2	8	21598	21605	50 %	25 %	0 %	25 %	215778371
54	NC_011311	TCAA	2	8	22424	22431	50 %	25 %	0 %	25 %	215778371
55	NC_011311	CAAA	2	8	22524	22531	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
56	NC_011311	GACG	2	8	22950	22957	25 %	0 %	50 %	25 %	215778371
57	NC_011311	CAAC	2	8	23216	23223	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
58	NC_011311	CCAT	2	8	23495	23502	25 %	25 %	0 %	50 %	215778371
59	NC_011311	TCAC	2	8	23561	23568	25 %	25 %	0 %	50 %	215778371
60	NC_011311	ACTC	2	8	23604	23611	25 %	25 %	0 %	50 %	215778371
61	NC_011311	AAAG	2	8	23620	23627	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
62	NC_011311	CAAA	2	8	23747	23754	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
63	NC_011311	AAGC	2	8	24159	24166	50 %	0 %	25 %	25 %	215778371
64	NC_011311	AACA	2	8	24559	24566	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
65	NC_011311	CAAC	2	8	24677	24684	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
66	NC_011311	AAAG	2	8	25078	25085	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
67	NC_011311	CAAA	2	8	25235	25242	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
68	NC_011311	ATTA	2	8	25869	25876	50 %	50 %	0 %	0 %	215778371
69	NC_011311	ACCA	2	8	26038	26045	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
70	NC_011311	AAGA	2	8	26234	26241	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
71	NC_011311	GAAC	2	8	26250	26257	50 %	0 %	25 %	25 %	215778371
72	NC_011311	GAGT	2	8	26514	26521	25 %	25 %	50 %	0 %	215778372
73	NC_011311	TCAC	2	8	26583	26590	25 %	25 %	0 %	50 %	215778372
74	NC_011311	TTCA	2	8	27675	27682	25 %	50 %	0 %	25 %	215778373
75	NC_011311	CAAC	2	8	28395	28402	50 %	0 %	0 %	50 %	215778375
76	NC_011311	GCTT	2	8	28936	28943	0 %	50 %	25 %	25 %	215778375
77	NC_011311	ATAA	2	8	30463	30470	75 %	25 %	0 %	0 %	215778376
78	NC_011311	ACTT	2	8	30643	30650	25 %	50 %	0 %	25 %	215778377
79	NC_011311	TAAC	2	8	30702	30709	50 %	25 %	0 %	25 %	215778377
80	NC_011311	GTTT	2	8	30874	30881	0 %	75 %	25 %	0 %	215778377
81	NC_011311	GCAA	2	8	31577	31584	50 %	0 %	25 %	25 %	215778378
82	NC_011311	TGAA	2	8	31626	31633	50 %	25 %	25 %	0 %	215778378
83	NC_011311	TCAA	2	8	31961	31968	50 %	25 %	0 %	25 %	215778379
84	NC_011311	GTAA	2	8	32242	32249	50 %	25 %	25 %	0 %	215778380
85	NC_011311	CTTT	2	8	32639	32646	0 %	75 %	0 %	25 %	215778381
86	NC_011311	AATG	2	8	32798	32805	50 %	25 %	25 %	0 %	215778381
87	NC_011311	TAAT	2	8	33051	33058	50 %	50 %	0 %	0 %	215778382
88	NC_011311	ATCC	2	8	33388	33395	25 %	25 %	0 %	50 %	215778383
89	NC_011311	ATCG	2	8	33615	33622	25 %	25 %	25 %	25 %	215778383
90	NC_011311	TTAA	2	8	33893	33900	50 %	50 %	0 %	0 %	215778384
91	NC_011311	GCCT	2	8	34212	34219	0 %	25 %	25 %	50 %	215778384
92	NC_011311	TTGC	2	8	34220	34227	0 %	50 %	25 %	25 %	215778384
93	NC_011311	TGAG	2	8	34298	34305	25 %	25 %	50 %	0 %	215778384
94	NC_011311	TTTG	2	8	37335	37342	0 %	75 %	25 %	0 %	215778386
95	NC_011311	CAAT	2	8	37532	37539	50 %	25 %	0 %	25 %	215778386
96	NC_011311	CAAG	2	8	37885	37892	50 %	0 %	25 %	25 %	215778386
97	NC_011311	AAAC	2	8	38012	38019	75 %	0 %	0 %	25 %	215778386
98	NC_011311	AAAC	2	8	38547	38554	75 %	0 %	0 %	25 %	215778386
99	NC_011311	ATTT	2	8	38687	38694	25 %	75 %	0 %	0 %	215778387
100	NC_011311	CAGT	2	8	38838	38845	25 %	25 %	25 %	25 %	215778387
101	NC_011311	TCTT	2	8	38897	38904	0 %	75 %	0 %	25 %	215778387
102	NC_011311	CCTC	2	8	38942	38949	0 %	25 %	0 %	75 %	215778387
103	NC_011311	ACAA	2	8	39690	39697	75 %	0 %	0 %	25 %	215778388
104	NC_011311	TCAG	2	8	39948	39955	25 %	25 %	25 %	25 %	215778388
105	NC_011311	AATA	2	8	40027	40034	75 %	25 %	0 %	0 %	215778388
106	NC_011311	GTGG	2	8	40681	40688	0 %	25 %	75 %	0 %	215778388
107	NC_011311	GGAG	2	8	40909	40916	25 %	0 %	75 %	0 %	215778388
108	NC_011311	TTAA	2	8	41041	41048	50 %	50 %	0 %	0 %	215778388
109	NC_011311	GAAA	2	8	41155	41162	75 %	0 %	25 %	0 %	215778388
110	NC_011311	TTCT	2	8	41195	41202	0 %	75 %	0 %	25 %	215778388
111	NC_011311	GGTA	2	8	41265	41272	25 %	25 %	50 %	0 %	215778388
112	NC_011311	ATCT	2	8	41726	41733	25 %	50 %	0 %	25 %	215778389
113	NC_011311	CACT	2	8	41878	41885	25 %	25 %	0 %	50 %	215778389
114	NC_011311	TGGC	2	8	41921	41928	0 %	25 %	50 %	25 %	215778389
115	NC_011311	GATT	2	8	42443	42450	25 %	50 %	25 %	0 %	215778389
116	NC_011311	ATGT	2	8	42551	42558	25 %	50 %	25 %	0 %	215778389
117	NC_011311	AAAT	2	8	43290	43297	75 %	25 %	0 %	0 %	215778390
118	NC_011311	AATG	2	8	43582	43589	50 %	25 %	25 %	0 %	215778390
119	NC_011311	AACA	2	8	43688	43695	75 %	0 %	0 %	25 %	215778390
120	NC_011311	TGAG	2	8	43745	43752	25 %	25 %	50 %	0 %	215778390
121	NC_011311	TGAA	2	8	43973	43980	50 %	25 %	25 %	0 %	215778390
122	NC_011311	GAAT	2	8	44942	44949	50 %	25 %	25 %	0 %	215778391
123	NC_011311	TTTC	2	8	45924	45931	0 %	75 %	0 %	25 %	215778392
124	NC_011311	CGAC	2	8	45969	45976	25 %	0 %	25 %	50 %	215778392
125	NC_011311	TCCT	2	8	47097	47104	0 %	50 %	0 %	50 %	215778394
126	NC_011311	TGGT	2	8	47261	47268	0 %	50 %	50 %	0 %	215778394
127	NC_011311	AATA	2	8	47487	47494	75 %	25 %	0 %	0 %	215778394
128	NC_011311	ATAA	2	8	48060	48067	75 %	25 %	0 %	0 %	215778395
129	NC_011311	TGAG	2	8	48649	48656	25 %	25 %	50 %	0 %	215778395
130	NC_011311	AAGA	2	8	48926	48933	75 %	0 %	25 %	0 %	215778395
131	NC_011311	ACTG	2	8	49588	49595	25 %	25 %	25 %	25 %	215778396
132	NC_011311	TTAC	2	8	50780	50787	25 %	50 %	0 %	25 %	215778396
133	NC_011311	TGAT	2	8	50853	50860	25 %	50 %	25 %	0 %	215778396
134	NC_011311	GTAT	2	8	51456	51463	25 %	50 %	25 %	0 %	215778396
135	NC_011311	ATTA	2	8	51520	51527	50 %	50 %	0 %	0 %	215778396
136	NC_011311	ATGT	2	8	51562	51569	25 %	50 %	25 %	0 %	215778397
137	NC_011311	GTAT	2	8	52309	52316	25 %	50 %	25 %	0 %	215778398
138	NC_011311	AGCG	2	8	53291	53298	25 %	0 %	50 %	25 %	215778399
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.