MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011311	AAT	2	6	318	323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011311	CTA	2	6	8826	8831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011311	ACA	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011311	GGT	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011311	ATA	2	6	13109	13114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011311	GTG	2	6	17740	17745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011311	TAT	2	6	17778	17783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011311	GAT	2	6	27033	27038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011311	TCA	2	6	27148	27153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011311	AAG	2	6	27181	27186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011311	ATT	2	6	27210	27215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011311	GAG	2	6	29666	29671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011311	CGA	2	6	29676	29681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011311	ATT	2	6	29705	29710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011311	TTG	2	6	29790	29795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011311	TTA	2	6	29805	29810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011311	TAA	2	6	29884	29889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011311	CTA	2	6	29923	29928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011311	AGT	2	6	29958	29963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011311	ATA	2	6	30505	30510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011311	TCA	2	6	31194	31199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011311	GAA	2	6	31675	31680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011311	ATC	2	6	31771	31776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011311	TCT	2	6	31782	31787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011311	GCT	2	6	32103	32108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011311	TTG	2	6	33326	33331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011311	GCT	2	6	33341	33346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011311	TAT	2	6	33855	33860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011311	CTT	2	6	34710	34715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011311	TAG	2	6	35044	35049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011311	TAG	2	6	35163	35168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011311	AGC	2	6	35189	35194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011311	ATA	2	6	35259	35264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011311	AAT	2	6	35322	35327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011311	TAA	2	6	35455	35460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011311	ATG	2	6	35479	35484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011311	TAA	2	6	35510	35515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011311	CTT	2	6	35526	35531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011311	TAA	2	6	41617	41622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011311	TTC	2	6	42731	42736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011311	CAA	2	6	42934	42939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011311	TTA	2	6	45339	45344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011311	TAC	2	6	45390	45395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011311	ATC	2	6	45554	45559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011311	TTG	2	6	45583	45588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011311	TTG	2	6	45606	45611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011311	ATT	2	6	45632	45637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011311	ATT	2	6	45647	45652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011311	AAG	2	6	45703	45708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011311	TGA	3	9	46481	46489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011311	GAA	2	6	46591	46596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011311	CAA	2	6	46605	46610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011311	AGA	2	6	46643	46648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011311	ATT	2	6	46659	46664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011311	AAT	2	6	47591	47596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011311	TAC	2	6	47604	47609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011311	AAG	2	6	47638	47643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011311	GGT	2	6	47654	47659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011311	CAA	3	9	47723	47731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011311	ATT	2	6	47777	47782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011311	TGT	2	6	49064	49069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011311	CAT	2	6	49136	49141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011311	ATA	2	6	52145	52150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011311	ATT	2	6	52780	52785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011311	AAT	2	6	52798	52803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011311	TAA	2	6	52810	52815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011311	AAC	2	6	52883	52888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011311	TAT	2	6	52933	52938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011311	ATT	2	6	52960	52965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011311	AAG	2	6	52999	53004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011311	TGT	2	6	53151	53156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011311	CAA	2	6	53169	53174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011311	TTC	2	6	53185	53190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011311	TAT	2	6	54155	54160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011311	ATT	2	6	54342	54347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011311	ATA	2	6	54508	54513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011311	GAA	2	6	54659	54664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011311	TAT	2	6	56006	56011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011311	AGG	2	6	56637	56642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011311	GCT	2	6	56662	56667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011311	TAA	2	6	56710	56715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011311	CAT	2	6	56753	56758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011311	AAT	2	6	56854	56859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011311	CAA	2	6	57858	57863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011311	TGG	2	6	58001	58006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011311	TCA	2	6	58055	58060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011311	TGA	2	6	58103	58108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011311	CAA	2	6	58153	58158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011311	TTA	2	6	58166	58171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011311	TAT	2	6	58200	58205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011311	TAA	2	6	59106	59111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011311	CCG	2	6	59166	59171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011311	CAA	2	6	59240	59245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011311	CGG	2	6	59389	59394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011311	GTC	2	6	59431	59436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011311	ATT	2	6	59462	59467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011311	GTA	2	6	61831	61836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011311	TAC	2	6	61904	61909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011311	ATT	2	6	61966	61971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011311	TAA	2	6	61976	61981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011311	TAT	2	6	61993	61998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011311	CGG	2	6	62119	62124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011311	GCA	2	6	67339	67344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011311	GTT	2	6	67347	67352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011311	GAG	2	6	72709	72714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011311	ATT	2	6	74724	74729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011311	ATT	2	6	74735	74740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011311	TAA	2	6	74804	74809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011311	TGT	2	6	74844	74849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011311	TTA	2	6	74909	74914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011311	ATG	3	9	77018	77026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011311	ATT	2	6	77058	77063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011311	TAA	2	6	77065	77070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011311	ATA	2	6	78001	78006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011311	AAG	2	6	78119	78124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011311	GAT	2	6	78144	78149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011311	TAG	2	6	78159	78164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011311	TAA	2	6	78428	78433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011311	AGG	2	6	78612	78617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011311	GTC	3	9	78655	78663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011311	GAT	2	6	79633	79638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011311	CTG	2	6	79661	79666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011311	AAT	2	6	79751	79756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011311	ATA	2	6	79908	79913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011311	AGC	2	6	80122	80127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011311	ACG	2	6	80252	80257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011311	AAT	2	6	83402	83407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011311	ATA	2	6	83445	83450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011311	TAA	2	6	83456	83461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011311	TAA	2	6	83469	83474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.