MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 1095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011311	TGA	2	6	38448	38453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778386
502	NC_011311	TTC	2	6	38455	38460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778386
503	NC_011311	AAG	2	6	38481	38486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778386
504	NC_011311	ATT	2	6	38492	38497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778386
505	NC_011311	GTT	2	6	38731	38736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778387
506	NC_011311	TTG	2	6	38761	38766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778387
507	NC_011311	ACC	2	6	38791	38796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778387
508	NC_011311	ATT	2	6	38808	38813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778387
509	NC_011311	CAA	2	6	38828	38833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778387
510	NC_011311	ATT	2	6	38925	38930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778387
511	NC_011311	CGT	2	6	38962	38967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778387
512	NC_011311	ATT	2	6	38969	38974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778387
513	NC_011311	GGT	2	6	39011	39016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778387
514	NC_011311	TAA	2	6	39192	39197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778388
515	NC_011311	ACC	2	6	39211	39216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778388
516	NC_011311	GGT	2	6	39306	39311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778388
517	NC_011311	CCA	2	6	39379	39384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778388
518	NC_011311	AGG	2	6	39398	39403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215778388
519	NC_011311	AGA	2	6	39483	39488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778388
520	NC_011311	CTT	2	6	39529	39534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778388
521	NC_011311	GAA	2	6	39550	39555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778388
522	NC_011311	CAA	2	6	39560	39565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778388
523	NC_011311	GGC	2	6	39612	39617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215778388
524	NC_011311	AAG	2	6	39684	39689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778388
525	NC_011311	TTA	2	6	39865	39870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778388
526	NC_011311	CAA	2	6	39877	39882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778388
527	NC_011311	ATC	2	6	39886	39891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778388
528	NC_011311	ATA	3	9	40124	40132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778388
529	NC_011311	CGT	2	6	40152	40157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778388
530	NC_011311	AAG	2	6	40179	40184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778388
531	NC_011311	AAG	2	6	40258	40263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778388
532	NC_011311	TGG	2	6	40380	40385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778388
533	NC_011311	CTT	2	6	40431	40436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778388
534	NC_011311	CTG	2	6	40580	40585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778388
535	NC_011311	TAG	2	6	40656	40661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778388
536	NC_011311	CTT	2	6	40928	40933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778388
537	NC_011311	GTT	2	6	41076	41081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778388
538	NC_011311	GAG	2	6	41128	41133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215778388
539	NC_011311	TTA	2	6	41344	41349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778388
540	NC_011311	ATT	2	6	41436	41441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778388
541	NC_011311	AGC	2	6	41480	41485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778388
542	NC_011311	TGA	2	6	41581	41586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778388
543	NC_011311	TAA	2	6	41617	41622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011311	AAT	2	6	41720	41725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778389
545	NC_011311	TTC	2	6	41743	41748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778389
546	NC_011311	CTC	2	6	41774	41779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215778389
547	NC_011311	ATT	2	6	41791	41796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778389
548	NC_011311	ATT	2	6	41889	41894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778389
549	NC_011311	CTT	2	6	41969	41974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778389
550	NC_011311	GTT	2	6	42009	42014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778389
551	NC_011311	AAG	2	6	42027	42032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778389
552	NC_011311	ATT	2	6	42045	42050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778389
553	NC_011311	TAA	2	6	42058	42063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778389
554	NC_011311	GCG	2	6	42274	42279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215778389
555	NC_011311	AAG	2	6	42335	42340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778389
556	NC_011311	TAT	2	6	42374	42379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778389
557	NC_011311	ATG	2	6	42607	42612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778389
558	NC_011311	TGT	2	6	42622	42627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778389
559	NC_011311	TAA	2	6	42684	42689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778389
560	NC_011311	TTC	2	6	42731	42736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_011311	CAA	2	6	42934	42939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011311	TAA	2	6	43031	43036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778390
563	NC_011311	CAA	2	6	43042	43047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778390
564	NC_011311	TAC	2	6	43056	43061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778390
565	NC_011311	TAT	2	6	43147	43152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778390
566	NC_011311	ATC	2	6	43199	43204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778390
567	NC_011311	TAT	2	6	43271	43276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778390
568	NC_011311	CAA	2	6	43325	43330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778390
569	NC_011311	TGT	2	6	43335	43340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778390
570	NC_011311	AAC	2	6	43377	43382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778390
571	NC_011311	TAC	2	6	43476	43481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778390
572	NC_011311	CGA	2	6	43503	43508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778390
573	NC_011311	ATT	2	6	43511	43516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778390
574	NC_011311	GAA	2	6	43552	43557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778390
575	NC_011311	CTC	2	6	43709	43714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215778390
576	NC_011311	AGA	2	6	43896	43901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778390
577	NC_011311	TTC	2	6	43983	43988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778390
578	NC_011311	AAC	2	6	44032	44037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778390
579	NC_011311	TTG	2	6	44180	44185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778390
580	NC_011311	GAA	2	6	44271	44276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778391
581	NC_011311	GGT	2	6	44358	44363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778391
582	NC_011311	TTA	2	6	44503	44508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778391
583	NC_011311	AAG	2	6	44530	44535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778391
584	NC_011311	GTG	2	6	44566	44571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778391
585	NC_011311	TTA	2	6	44615	44620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778391
586	NC_011311	AAC	2	6	44656	44661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778391
587	NC_011311	ACC	2	6	44682	44687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778391
588	NC_011311	TAA	2	6	44771	44776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778391
589	NC_011311	GCT	2	6	44838	44843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778391
590	NC_011311	ATT	2	6	44868	44873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778391
591	NC_011311	ATT	2	6	44904	44909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778391
592	NC_011311	AGT	2	6	44957	44962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778391
593	NC_011311	ATT	2	6	44963	44968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778391
594	NC_011311	CTA	2	6	44971	44976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778391
595	NC_011311	TGT	2	6	45041	45046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778391
596	NC_011311	ATA	2	6	45067	45072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778391
597	NC_011311	TGA	2	6	45179	45184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778391
598	NC_011311	TTA	2	6	45339	45344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011311	TAC	2	6	45390	45395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011311	ATC	2	6	45554	45559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011311	TTG	2	6	45583	45588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011311	TTG	2	6	45606	45611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011311	ATT	2	6	45632	45637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011311	ATT	2	6	45647	45652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011311	AAG	2	6	45703	45708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011311	TTA	2	6	45846	45851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778392
607	NC_011311	CTT	3	9	45874	45882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778392
608	NC_011311	GTA	2	6	45954	45959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778392
609	NC_011311	ATA	2	6	45963	45968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778392
610	NC_011311	ATC	2	6	46131	46136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778392
611	NC_011311	TGA	3	9	46481	46489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011311	GAA	2	6	46591	46596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011311	CAA	2	6	46605	46610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_011311	AGA	2	6	46643	46648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011311	ATT	2	6	46659	46664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011311	TTG	2	6	46724	46729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778393
617	NC_011311	CAT	2	6	46748	46753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778393
618	NC_011311	GAA	2	6	46795	46800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778393
619	NC_011311	TAA	2	6	46845	46850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778393
620	NC_011311	ATT	3	9	46891	46899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778393
621	NC_011311	TCT	2	6	47054	47059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778394
622	NC_011311	GTC	3	9	47078	47086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778394
623	NC_011311	TCT	3	9	47136	47144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778394
624	NC_011311	GCA	2	6	47170	47175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778394
625	NC_011311	CAT	2	6	47187	47192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778394
626	NC_011311	GTT	2	6	47193	47198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778394
627	NC_011311	ATC	2	6	47226	47231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778394
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