MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011311	AT	3	6	169	174	50 %	50 %	0 %	0 %	215778351
2	NC_011311	TC	3	6	578	583	0 %	50 %	0 %	50 %	215778352
3	NC_011311	GT	3	6	1989	1994	0 %	50 %	50 %	0 %	215778355
4	NC_011311	AG	3	6	2699	2704	50 %	0 %	50 %	0 %	215778356
5	NC_011311	CT	3	6	5172	5177	0 %	50 %	0 %	50 %	215778358
6	NC_011311	TC	3	6	5327	5332	0 %	50 %	0 %	50 %	215778358
7	NC_011311	AG	3	6	5960	5965	50 %	0 %	50 %	0 %	215778358
8	NC_011311	CT	3	6	6225	6230	0 %	50 %	0 %	50 %	215778358
9	NC_011311	CA	3	6	6877	6882	50 %	0 %	0 %	50 %	215778359
10	NC_011311	GT	3	6	7763	7768	0 %	50 %	50 %	0 %	215778361
11	NC_011311	TG	3	6	8508	8513	0 %	50 %	50 %	0 %	215778361
12	NC_011311	GC	3	6	9205	9210	0 %	0 %	50 %	50 %	215778362
13	NC_011311	AG	3	6	9283	9288	50 %	0 %	50 %	0 %	215778362
14	NC_011311	CT	5	10	9827	9836	0 %	50 %	0 %	50 %	215778363
15	NC_011311	CT	3	6	9857	9862	0 %	50 %	0 %	50 %	215778363
16	NC_011311	AG	3	6	10045	10050	50 %	0 %	50 %	0 %	215778363
17	NC_011311	AG	3	6	12109	12114	50 %	0 %	50 %	0 %	215778364
18	NC_011311	TC	3	6	12430	12435	0 %	50 %	0 %	50 %	215778365
19	NC_011311	GC	3	6	12781	12786	0 %	0 %	50 %	50 %	215778365
20	NC_011311	TC	3	6	13309	13314	0 %	50 %	0 %	50 %	215778366
21	NC_011311	CA	3	6	14068	14073	50 %	0 %	0 %	50 %	215778367
22	NC_011311	AC	3	6	14160	14165	50 %	0 %	0 %	50 %	215778367
23	NC_011311	CA	3	6	14193	14198	50 %	0 %	0 %	50 %	215778367
24	NC_011311	TC	3	6	14233	14238	0 %	50 %	0 %	50 %	215778367
25	NC_011311	CT	3	6	14273	14278	0 %	50 %	0 %	50 %	215778367
26	NC_011311	CT	3	6	15352	15357	0 %	50 %	0 %	50 %	215778368
27	NC_011311	AG	3	6	15373	15378	50 %	0 %	50 %	0 %	215778368
28	NC_011311	CT	3	6	16066	16071	0 %	50 %	0 %	50 %	215778368
29	NC_011311	CT	3	6	16162	16167	0 %	50 %	0 %	50 %	215778368
30	NC_011311	GA	3	6	18195	18200	50 %	0 %	50 %	0 %	215778369
31	NC_011311	TC	3	6	19495	19500	0 %	50 %	0 %	50 %	215778370
32	NC_011311	TC	3	6	19905	19910	0 %	50 %	0 %	50 %	215778370
33	NC_011311	AC	3	6	21436	21441	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
34	NC_011311	TC	3	6	22040	22045	0 %	50 %	0 %	50 %	215778371
35	NC_011311	AC	3	6	22251	22256	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
36	NC_011311	AG	3	6	22912	22917	50 %	0 %	50 %	0 %	215778371
37	NC_011311	CT	3	6	23449	23454	0 %	50 %	0 %	50 %	215778371
38	NC_011311	AC	3	6	24431	24436	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
39	NC_011311	CG	4	8	25522	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	215778371
40	NC_011311	TC	3	6	26454	26459	0 %	50 %	0 %	50 %	215778372
41	NC_011311	GA	3	6	27602	27607	50 %	0 %	50 %	0 %	215778373
42	NC_011311	AT	3	6	28629	28634	50 %	50 %	0 %	0 %	215778375
43	NC_011311	CT	3	6	28834	28839	0 %	50 %	0 %	50 %	215778375
44	NC_011311	GC	3	6	29024	29029	0 %	0 %	50 %	50 %	215778375
45	NC_011311	AC	3	6	30934	30939	50 %	0 %	0 %	50 %	215778377
46	NC_011311	CA	3	6	31383	31388	50 %	0 %	0 %	50 %	215778378
47	NC_011311	AG	3	6	32341	32346	50 %	0 %	50 %	0 %	215778380
48	NC_011311	TC	3	6	32947	32952	0 %	50 %	0 %	50 %	215778382
49	NC_011311	TG	3	6	33539	33544	0 %	50 %	50 %	0 %	215778383
50	NC_011311	TA	3	6	34376	34381	50 %	50 %	0 %	0 %	215778384
51	NC_011311	AC	4	8	34443	34450	50 %	0 %	0 %	50 %	215778384
52	NC_011311	CA	3	6	35795	35800	50 %	0 %	0 %	50 %	215778385
53	NC_011311	GT	4	8	37524	37531	0 %	50 %	50 %	0 %	215778386
54	NC_011311	TA	3	6	37644	37649	50 %	50 %	0 %	0 %	215778386
55	NC_011311	AT	3	6	38526	38531	50 %	50 %	0 %	0 %	215778386
56	NC_011311	GT	3	6	39385	39390	0 %	50 %	50 %	0 %	215778388
57	NC_011311	TG	3	6	39451	39456	0 %	50 %	50 %	0 %	215778388
58	NC_011311	GA	3	6	39458	39463	50 %	0 %	50 %	0 %	215778388
59	NC_011311	AG	3	6	40758	40763	50 %	0 %	50 %	0 %	215778388
60	NC_011311	GA	3	6	41415	41420	50 %	0 %	50 %	0 %	215778388
61	NC_011311	AG	3	6	41695	41700	50 %	0 %	50 %	0 %	215778389
62	NC_011311	AC	3	6	43049	43054	50 %	0 %	0 %	50 %	215778390
63	NC_011311	AG	3	6	43429	43434	50 %	0 %	50 %	0 %	215778390
64	NC_011311	AT	3	6	45205	45210	50 %	50 %	0 %	0 %	215778391
65	NC_011311	GA	3	6	46232	46237	50 %	0 %	50 %	0 %	215778392
66	NC_011311	TC	3	6	48451	48456	0 %	50 %	0 %	50 %	215778395
67	NC_011311	CT	3	6	49823	49828	0 %	50 %	0 %	50 %	215778396
68	NC_011311	TC	3	6	49950	49955	0 %	50 %	0 %	50 %	215778396
69	NC_011311	GA	3	6	50092	50097	50 %	0 %	50 %	0 %	215778396
70	NC_011311	AC	3	6	50259	50264	50 %	0 %	0 %	50 %	215778396
71	NC_011311	TG	3	6	50293	50298	0 %	50 %	50 %	0 %	215778396
72	NC_011311	TG	3	6	50545	50550	0 %	50 %	50 %	0 %	215778396
73	NC_011311	AT	3	6	53318	53323	50 %	50 %	0 %	0 %	215778399
74	NC_011311	AC	3	6	53934	53939	50 %	0 %	0 %	50 %	215778399
75	NC_011311	GA	3	6	53993	53998	50 %	0 %	50 %	0 %	215778399
76	NC_011311	AT	3	6	54006	54011	50 %	50 %	0 %	0 %	215778399
77	NC_011311	GC	3	6	55939	55944	0 %	0 %	50 %	50 %	215778400
78	NC_011311	AT	5	10	56046	56055	50 %	50 %	0 %	0 %	215778401
79	NC_011311	AC	3	6	56126	56131	50 %	0 %	0 %	50 %	215778401
80	NC_011311	AT	3	6	56247	56252	50 %	50 %	0 %	0 %	215778401
81	NC_011311	TC	3	6	57109	57114	0 %	50 %	0 %	50 %	215778402
82	NC_011311	TC	3	6	57495	57500	0 %	50 %	0 %	50 %	215778402
83	NC_011311	TA	3	6	59594	59599	50 %	50 %	0 %	0 %	215778405
84	NC_011311	TA	4	8	60309	60316	50 %	50 %	0 %	0 %	215778405
85	NC_011311	TA	3	6	60839	60844	50 %	50 %	0 %	0 %	215778405
86	NC_011311	GA	3	6	61486	61491	50 %	0 %	50 %	0 %	215778405
87	NC_011311	TA	3	6	61601	61606	50 %	50 %	0 %	0 %	215778405
88	NC_011311	AT	3	6	61659	61664	50 %	50 %	0 %	0 %	215778405
89	NC_011311	AC	3	6	62217	62222	50 %	0 %	0 %	50 %	215778406
90	NC_011311	TA	3	6	62505	62510	50 %	50 %	0 %	0 %	215778406
91	NC_011311	TA	3	6	63567	63572	50 %	50 %	0 %	0 %	215778406
92	NC_011311	AT	3	6	64111	64116	50 %	50 %	0 %	0 %	215778406
93	NC_011311	AT	3	6	64595	64600	50 %	50 %	0 %	0 %	215778406
94	NC_011311	CA	4	8	65453	65460	50 %	0 %	0 %	50 %	215778407
95	NC_011311	GA	3	6	65838	65843	50 %	0 %	50 %	0 %	215778407
96	NC_011311	TC	3	6	66876	66881	0 %	50 %	0 %	50 %	215778407
97	NC_011311	TA	4	8	66980	66987	50 %	50 %	0 %	0 %	215778407
98	NC_011311	TA	3	6	67426	67431	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
99	NC_011311	AT	3	6	67658	67663	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
100	NC_011311	TA	4	8	67699	67706	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
101	NC_011311	AT	3	6	67942	67947	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
102	NC_011311	TA	3	6	68119	68124	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
103	NC_011311	AT	3	6	68170	68175	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
104	NC_011311	AT	3	6	68272	68277	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
105	NC_011311	TC	3	6	68337	68342	0 %	50 %	0 %	50 %	215778408
106	NC_011311	AT	3	6	69052	69057	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
107	NC_011311	GT	3	6	69559	69564	0 %	50 %	50 %	0 %	215778409
108	NC_011311	AC	3	6	70920	70925	50 %	0 %	0 %	50 %	215778410
109	NC_011311	GA	3	6	70974	70979	50 %	0 %	50 %	0 %	215778410
110	NC_011311	CT	3	6	71098	71103	0 %	50 %	0 %	50 %	215778411
111	NC_011311	CT	3	6	71624	71629	0 %	50 %	0 %	50 %	215778411
112	NC_011311	AC	3	6	71641	71646	50 %	0 %	0 %	50 %	215778411
113	NC_011311	AT	3	6	71729	71734	50 %	50 %	0 %	0 %	215778412
114	NC_011311	TC	3	6	72189	72194	0 %	50 %	0 %	50 %	215778412
115	NC_011311	AT	3	6	72310	72315	50 %	50 %	0 %	0 %	215778412
116	NC_011311	AT	3	6	73548	73553	50 %	50 %	0 %	0 %	215778414
117	NC_011311	AG	3	6	74227	74232	50 %	0 %	50 %	0 %	215778414
118	NC_011311	AT	3	6	75052	75057	50 %	50 %	0 %	0 %	215778415
119	NC_011311	CT	3	6	75381	75386	0 %	50 %	0 %	50 %	215778415
120	NC_011311	TG	3	6	76805	76810	0 %	50 %	50 %	0 %	215778415
121	NC_011311	AC	4	8	79037	79044	50 %	0 %	0 %	50 %	215778418
122	NC_011311	CG	3	6	79361	79366	0 %	0 %	50 %	50 %	215778418
123	NC_011311	CA	3	6	79606	79611	50 %	0 %	0 %	50 %	215778418
124	NC_011311	TA	3	6	82708	82713	50 %	50 %	0 %	0 %	215778422

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.