MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011311	T	8	8	34	41	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011311	A	6	6	114	119	100 %	0 %	0 %	0 %	215778351
3	NC_011311	A	6	6	429	434	100 %	0 %	0 %	0 %	215778352
4	NC_011311	T	6	6	667	672	0 %	100 %	0 %	0 %	215778352
5	NC_011311	A	7	7	717	723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011311	A	6	6	1392	1397	100 %	0 %	0 %	0 %	215778354
7	NC_011311	A	6	6	1669	1674	100 %	0 %	0 %	0 %	215778355
8	NC_011311	A	6	6	1983	1988	100 %	0 %	0 %	0 %	215778355
9	NC_011311	A	7	7	2355	2361	100 %	0 %	0 %	0 %	215778356
10	NC_011311	A	6	6	2642	2647	100 %	0 %	0 %	0 %	215778356
11	NC_011311	A	8	8	2770	2777	100 %	0 %	0 %	0 %	215778356
12	NC_011311	T	7	7	3568	3574	0 %	100 %	0 %	0 %	215778356
13	NC_011311	A	8	8	4055	4062	100 %	0 %	0 %	0 %	215778357
14	NC_011311	A	6	6	4170	4175	100 %	0 %	0 %	0 %	215778357
15	NC_011311	A	6	6	4209	4214	100 %	0 %	0 %	0 %	215778358
16	NC_011311	T	6	6	4263	4268	0 %	100 %	0 %	0 %	215778358
17	NC_011311	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	215778358
18	NC_011311	T	6	6	5574	5579	0 %	100 %	0 %	0 %	215778358
19	NC_011311	A	6	6	5652	5657	100 %	0 %	0 %	0 %	215778358
20	NC_011311	A	7	7	6722	6728	100 %	0 %	0 %	0 %	215778358
21	NC_011311	A	7	7	7254	7260	100 %	0 %	0 %	0 %	215778360
22	NC_011311	A	6	6	8749	8754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011311	G	6	6	8872	8877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011311	A	8	8	9112	9119	100 %	0 %	0 %	0 %	215778362
25	NC_011311	A	6	6	9578	9583	100 %	0 %	0 %	0 %	215778362
26	NC_011311	A	6	6	10254	10259	100 %	0 %	0 %	0 %	215778363
27	NC_011311	A	8	8	10657	10664	100 %	0 %	0 %	0 %	215778363
28	NC_011311	A	6	6	11120	11125	100 %	0 %	0 %	0 %	215778363
29	NC_011311	A	7	7	11261	11267	100 %	0 %	0 %	0 %	215778363
30	NC_011311	A	7	7	11287	11293	100 %	0 %	0 %	0 %	215778363
31	NC_011311	A	6	6	11945	11950	100 %	0 %	0 %	0 %	215778364
32	NC_011311	T	8	8	12729	12736	0 %	100 %	0 %	0 %	215778365
33	NC_011311	A	7	7	12907	12913	100 %	0 %	0 %	0 %	215778365
34	NC_011311	A	6	6	13007	13012	100 %	0 %	0 %	0 %	215778365
35	NC_011311	A	6	6	13087	13092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011311	T	6	6	13380	13385	0 %	100 %	0 %	0 %	215778366
37	NC_011311	T	6	6	13628	13633	0 %	100 %	0 %	0 %	215778367
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39	NC_011311	A	6	6	15445	15450	100 %	0 %	0 %	0 %	215778368
40	NC_011311	T	6	6	15669	15674	0 %	100 %	0 %	0 %	215778368
41	NC_011311	A	6	6	16655	16660	100 %	0 %	0 %	0 %	215778368
42	NC_011311	T	6	6	17755	17760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011311	A	7	7	17799	17805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011311	T	6	6	17850	17855	0 %	100 %	0 %	0 %	215778369
45	NC_011311	T	7	7	17978	17984	0 %	100 %	0 %	0 %	215778369
46	NC_011311	T	6	6	18401	18406	0 %	100 %	0 %	0 %	215778370
47	NC_011311	A	6	6	18781	18786	100 %	0 %	0 %	0 %	215778370
48	NC_011311	T	6	6	19288	19293	0 %	100 %	0 %	0 %	215778370
49	NC_011311	A	6	6	19335	19340	100 %	0 %	0 %	0 %	215778370
50	NC_011311	A	6	6	20309	20314	100 %	0 %	0 %	0 %	215778370
51	NC_011311	A	6	6	20492	20497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62	NC_011311	A	7	7	23135	23141	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
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66	NC_011311	A	6	6	25171	25176	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
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69	NC_011311	A	6	6	26851	26856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011311	A	6	6	27254	27259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011311	A	6	6	27353	27358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011311	A	7	7	27378	27384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.