MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Dictyoglomus thermophilum H-6-12

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011297	ATTAA	2	10	2083	2092	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011297	CAAAA	2	10	27214	27223	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011297	GTATA	2	10	34090	34099	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011297	TTTAT	2	10	46113	46122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011297	CTAAA	2	10	48226	48235	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011297	AGGGA	2	10	50015	50024	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011297	CTTTT	2	10	50221	50230	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011297	TTTAT	2	10	64059	64068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011297	AGAGT	2	10	64136	64145	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011297	ATTTT	2	10	70314	70323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011297	TTTAA	2	10	97661	97670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011297	ATATT	2	10	106312	106321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011297	ATTTA	2	10	111858	111867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011297	CTTTA	2	10	131283	131292	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011297	TCGCT	2	10	131948	131957	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011297	ATTTT	2	10	140181	140190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011297	ATTTA	2	10	143069	143078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011297	TATCA	2	10	143614	143623	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011297	ATTTA	2	10	155901	155910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011297	TCTTA	2	10	156173	156182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011297	TTTAT	2	10	178287	178296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011297	ACATA	2	10	182126	182135	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011297	AGATA	2	10	182926	182935	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011297	AATTA	2	10	183669	183678	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011297	TAATT	2	10	194775	194784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011297	TAAAA	2	10	206424	206433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011297	TATAA	2	10	214002	214011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011297	ACAAA	2	10	216969	216978	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011297	TGTAA	2	10	217592	217601	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011297	AAAAG	2	10	235116	235125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011297	GATAT	2	10	241518	241527	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011297	TAAGA	2	10	242369	242378	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011297	TATGT	2	10	245623	245632	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011297	GATAT	2	10	249570	249579	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011297	TTGTT	2	10	253793	253802	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011297	CTTTT	2	10	253896	253905	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011297	TTTAC	2	10	255652	255661	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011297	TTTAA	2	10	259980	259989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011297	TATAA	2	10	260405	260414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011297	TTTAA	2	10	266264	266273	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011297	AAAAT	2	10	275277	275286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011297	TCCTT	2	10	284038	284047	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011297	TAAAG	2	10	285825	285834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011297	TAAAA	2	10	295024	295033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011297	TAAAA	2	10	314609	314618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011297	TCTTA	2	10	322494	322503	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011297	AAAAT	2	10	336807	336816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011297	TAATA	2	10	344609	344618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011297	ATTAC	2	10	344937	344946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011297	AAAGG	2	10	347187	347196	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011297	GTGTT	2	10	354495	354504	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011297	TTTGT	2	10	372430	372439	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011297	GAAGG	2	10	372469	372478	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011297	ATTTT	2	10	392340	392349	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011297	AAAAC	2	10	392393	392402	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011297	TTTTA	2	10	395845	395854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011297	ATTTA	2	10	418271	418280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011297	TTAAG	2	10	437956	437965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011297	GAAAA	2	10	439646	439655	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011297	TTATA	2	10	440401	440410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011297	TCTTT	2	10	440483	440492	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011297	TCCTC	2	10	551752	551761	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_011297	AAGGA	2	10	553151	553160	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011297	TAAAA	2	10	578729	578738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011297	TATAA	2	10	587304	587313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011297	TAATA	2	10	604357	604366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011297	TCTTT	2	10	606698	606707	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011297	TTTTC	2	10	612653	612662	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011297	TTAAA	2	10	612838	612847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011297	ATGAT	2	10	612848	612857	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011297	ATTTA	2	10	617949	617958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011297	AGGAG	2	10	624773	624782	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011297	TCGTG	2	10	625200	625209	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011297	ATTTT	2	10	631167	631176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011297	ATATC	2	10	642320	642329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011297	ATGAT	2	10	643248	643257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011297	TTTAA	2	10	660715	660724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011297	ATATA	2	10	705951	705960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011297	TAATT	2	10	717287	717296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011297	TTTAT	2	10	735063	735072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011297	CATAA	2	10	752962	752971	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011297	CCTAC	2	10	753153	753162	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_011297	ACAAT	2	10	770415	770424	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011297	TAAAT	2	10	770437	770446	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011297	CATTC	2	10	784421	784430	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_011297	GGATG	2	10	812875	812884	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011297	GTGAA	2	10	852374	852383	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011297	CACGG	2	10	872588	872597	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011297	TTAAA	2	10	924635	924644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011297	TATAA	2	10	983349	983358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011297	ATACT	2	10	1004976	1004985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011297	GAGAA	2	10	1011821	1011830	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011297	AAAGC	2	10	1015830	1015839	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011297	TAAAA	2	10	1015956	1015965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011297	TTTTA	2	10	1015987	1015996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011297	TAAAA	2	10	1025102	1025111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011297	TTTTA	2	10	1038312	1038321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011297	CTTAA	2	10	1073596	1073605	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011297	TAAAA	2	10	1073640	1073649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011297	CACGA	2	10	1077784	1077793	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_011297	CTCTC	2	10	1078210	1078219	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
102	NC_011297	TAATT	2	10	1112814	1112823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011297	AGGGA	2	10	1117569	1117578	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011297	TATTT	2	10	1128263	1128272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011297	TTTTC	2	10	1255462	1255471	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011297	CCGCT	2	10	1257823	1257832	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_011297	ATAGA	2	10	1259343	1259352	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011297	TAAAA	2	10	1384786	1384795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011297	ATTCA	2	10	1426817	1426826	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_011297	CAAAA	2	10	1476610	1476619	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011297	ATATA	2	10	1486731	1486740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011297	CCCTT	2	10	1499954	1499963	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_011297	GTAGG	2	10	1506284	1506293	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011297	CTTCT	2	10	1528733	1528742	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_011297	GTTAT	2	10	1530104	1530113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011297	CCTTA	2	10	1535849	1535858	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_011297	ATTTT	2	10	1549958	1549967	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011297	CTATT	2	10	1570618	1570627	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011297	CTTAA	2	10	1578961	1578970	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011297	TTGGG	2	10	1605125	1605134	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011297	TTTCC	2	10	1617950	1617959	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_011297	TAATT	2	10	1620824	1620833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011297	ACTAA	2	10	1649284	1649293	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011297	ATTAT	2	10	1657822	1657831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011297	TCTTA	2	10	1675546	1675555	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011297	AATAA	2	10	1692212	1692221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011297	GAAAA	2	10	1692442	1692451	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011297	TAAAA	2	10	1692571	1692580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011297	TTTTA	2	10	1695759	1695768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011297	TTTTA	2	10	1711866	1711875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011297	CAAAA	2	10	1715872	1715881	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011297	CCATA	2	10	1741382	1741391	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_011297	AAGAT	2	10	1764371	1764380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011297	AATAT	2	10	1764392	1764401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011297	ACAGA	2	10	1764690	1764699	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011297	AAATA	2	10	1767064	1767073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011297	TTTAA	2	10	1770259	1770268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011297	TTCTC	2	10	1771367	1771376	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011297	TAACA	2	10	1771773	1771782	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011297	AAATA	2	10	1771864	1771873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011297	CCTTA	2	10	1777032	1777041	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011297	TAAAA	2	10	1777179	1777188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011297	AAACC	2	10	1779677	1779686	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_011297	ATTTT	2	10	1780262	1780271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011297	TAAAA	2	10	1781650	1781659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011297	AAAAT	2	10	1805848	1805857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.