MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011296	ATTTTA	2	12	22254	22265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011296	GCAACA	2	12	177951	177962	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011296	ATTTTT	2	12	179513	179524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011296	ACATTT	2	12	252177	252188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011296	TGCAGA	2	12	262282	262293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011296	ATTGCT	2	12	275198	275209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011296	ATAGAT	2	12	288178	288189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011296	ATTAAA	2	12	339283	339294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011296	AGCGAA	2	12	453163	453174	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011296	AACATG	2	12	475758	475769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011296	TTTAAA	2	12	486623	486634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011296	AAATAA	2	12	596273	596284	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011296	AATCTC	2	12	631818	631829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011296	CTTTTT	2	12	632425	632436	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011296	AGAAAA	2	12	700573	700584	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011296	AAAATA	2	12	832634	832645	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011296	ATTTTT	2	12	894893	894904	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011296	GAAATA	2	12	894920	894931	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011296	CACTGA	2	12	917190	917201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011296	GGGTTG	2	12	918357	918368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011296	TACTGG	2	12	918700	918711	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011296	TCAGTA	2	12	918772	918783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011296	TAAGGC	2	12	919627	919638	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011296	TTTTAA	2	12	1043923	1043934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011296	CCTGTT	2	12	1186169	1186180	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011296	AATATT	2	12	1216622	1216633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011296	TAAAAA	2	12	1219916	1219927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011296	TACGAA	2	12	1292846	1292857	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011296	AGATAA	2	12	1354471	1354482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011296	AAAAAT	2	12	1365720	1365731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011296	AAATCA	2	12	1420877	1420888	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011296	TAATTT	2	12	1516567	1516578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011296	ATTAAA	2	12	1529626	1529637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011296	AATTAA	2	12	1531318	1531329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011296	TAATTT	2	12	1567770	1567781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011296	ATTAAA	2	12	1580829	1580840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011296	AATTAA	2	12	1582521	1582532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011296	ACCTTC	2	12	1614041	1614052	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011296	TCTTTT	2	12	1683299	1683310	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011296	TGCTTT	2	12	1767401	1767412	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011296	AAAATT	2	12	1777441	1777452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011296	TAAAAA	2	12	1794874	1794885	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011296	AAAAGA	2	12	1851253	1851264	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011296	AAAAAT	2	12	1875103	1875114	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011296	ATTTAT	2	12	1876571	1876582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011296	AACTGT	2	12	1932556	1932567	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011296	TAAAAT	2	12	2000871	2000882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.