MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011296	AAGAGA	2	12	1607	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890635
2	NC_011296	AAAATA	2	12	1807	1818	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	206890635
3	NC_011296	ATTCCT	2	12	2256	2267	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	206890635
4	NC_011296	AGGAGA	2	12	2901	2912	50 %	0 %	50 %	0 %	206890709
5	NC_011296	CAAATC	2	12	9975	9986	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	206890613
6	NC_011296	TCATTT	2	12	10557	10568	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	206889456
7	NC_011296	AAACAG	2	12	14672	14683	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	206889361
8	NC_011296	TTGAGG	2	12	16872	16883	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	206889996
9	NC_011296	CAGATG	2	12	17970	17981	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	206889996
10	NC_011296	GAAAGA	2	12	18823	18834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890029
11	NC_011296	ATTTTG	2	12	19124	19135	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	206890029
12	NC_011296	GACAGG	2	12	19341	19352	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	206890029
13	NC_011296	CTGAAA	2	12	20299	20310	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	206890925
14	NC_011296	GGCTTT	2	12	21531	21542	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	206889647
15	NC_011296	GGAATT	2	12	23747	23758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889393
16	NC_011296	GGATGC	2	12	24041	24052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	206889393
17	NC_011296	AATTGC	2	12	26883	26894	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	206889293
18	NC_011296	TGCTAC	2	12	26931	26942	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	206889293
19	NC_011296	TTGTTC	2	12	32978	32989	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	206890784
20	NC_011296	TCCTAT	2	12	33194	33205	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	206890152
21	NC_011296	GTATTT	2	12	36382	36393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	206890514
22	NC_011296	TTTAAT	2	12	37491	37502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890514
23	NC_011296	ATACAT	2	12	45349	45360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	206891146
24	NC_011296	TGCCTG	2	12	47855	47866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889694
25	NC_011296	AGATTA	2	12	50095	50106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	206890921
26	NC_011296	TATGAT	2	12	53030	53041	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	206889733
27	NC_011296	TCAAGC	2	12	54860	54871	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	206889499
28	NC_011296	TGTATC	2	12	63246	63257	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	206889450
29	NC_011296	CTTATG	2	12	64940	64951	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	206889450
30	NC_011296	AACAAA	2	12	65668	65679	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	206889624
31	NC_011296	ATAAAA	2	12	66992	67003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	206890839
32	NC_011296	TTGGTT	2	12	68161	68172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206891139
33	NC_011296	ATTTAT	2	12	68543	68554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889594
34	NC_011296	TAAAAC	2	12	73404	73415	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	206891046
35	NC_011296	AAAGGC	2	12	73899	73910	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	206890114
36	NC_011296	CTATTT	2	12	74211	74222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	206890114
37	NC_011296	TTAAAA	2	12	75544	75555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890330
38	NC_011296	TATTTC	2	12	75572	75583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	206890330
39	NC_011296	GGATAG	2	12	79403	79414	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	206890451
40	NC_011296	AAAGCA	2	12	81888	81899	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	206889257
41	NC_011296	TTTCCT	2	12	82711	82722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890761
42	NC_011296	TGCACT	2	12	83626	83637	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	206890761
43	NC_011296	CTACTG	2	12	89283	89294	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	206890139
44	NC_011296	ATTTCA	2	12	95701	95712	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	206890404
45	NC_011296	CCAAAT	2	12	96326	96337	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	206891173
46	NC_011296	ATCAGG	2	12	97330	97341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	206891173
47	NC_011296	CAGGAT	2	12	99330	99341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	206889236
48	NC_011296	TTGAAA	2	12	101278	101289	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	206890518
49	NC_011296	AAATCC	2	12	103418	103429	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	206890984
50	NC_011296	CCCTTT	2	12	104281	104292	0 %	50 %	0 %	50 %	206890984
51	NC_011296	GCTCCT	2	12	107342	107353	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	206889208
52	NC_011296	CAAAAA	2	12	108224	108235	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	206889755
53	NC_011296	CAAAGG	2	12	116989	117000	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	206890365
54	NC_011296	TTTTTA	2	12	118964	118975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	206890279
55	NC_011296	ACTCAG	2	12	120168	120179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	206890279
56	NC_011296	TTCAGG	2	12	123878	123889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206890903
57	NC_011296	ATTCTT	2	12	124619	124630	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	206889670
58	NC_011296	GGACAG	2	12	125204	125215	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	206889670
59	NC_011296	AGAGGA	2	12	134635	134646	50 %	0 %	50 %	0 %	206889431
60	NC_011296	TCACTT	2	12	135171	135182	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	206890508
61	NC_011296	AAGATA	2	12	135191	135202	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	206890508
62	NC_011296	TTCTTG	2	12	140836	140847	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	206890180
63	NC_011296	TTGTAT	2	12	144412	144423	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	206890055
64	NC_011296	TAAAAA	2	12	144550	144561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	206890055
65	NC_011296	AACCAA	2	12	146064	146075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206890944
66	NC_011296	AAAAGA	2	12	153139	153150	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	206890510
67	NC_011296	AGCAAA	2	12	154510	154521	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	206889732
68	NC_011296	TGCGCT	2	12	156811	156822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890168
69	NC_011296	AGTTTT	2	12	157682	157693	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	206890794
70	NC_011296	AAGGAA	2	12	157768	157779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890794
71	NC_011296	TGTTGA	2	12	158901	158912	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	206890501
72	NC_011296	TTGAAA	2	12	163914	163925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	206890570
73	NC_011296	AAGCAA	2	12	164001	164012	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	206890570
74	NC_011296	CTGACA	2	12	167609	167620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	206890106
75	NC_011296	TTTTAT	2	12	169523	169534	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	206889962
76	NC_011296	AAAGGA	2	12	169770	169781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889962
77	NC_011296	TTCCTC	2	12	170701	170712	0 %	50 %	0 %	50 %	206889219
78	NC_011296	TTACAT	2	12	172411	172422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	206890812
79	NC_011296	GTTTTT	2	12	179947	179958	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	206889398
80	NC_011296	TGCAGG	2	12	185137	185148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	206890504
81	NC_011296	ATAGAG	2	12	187259	187270	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	206889297
82	NC_011296	ATGCAC	2	12	187758	187769	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	206890474
83	NC_011296	AGTCCG	2	12	192323	192334	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206889429
84	NC_011296	ACAATC	2	12	196249	196260	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	206890870
85	NC_011296	AGAGCA	2	12	197512	197523	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	206889735
86	NC_011296	TCTGTG	2	12	198731	198742	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	206889735
87	NC_011296	GAATTT	2	12	200335	200346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	206890271
88	NC_011296	CAATAT	2	12	207088	207099	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	206889218
89	NC_011296	TTTTTC	2	12	209663	209674	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	206889695
90	NC_011296	CTCCTG	2	12	211074	211085	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	206891071
91	NC_011296	CCAACT	2	12	211334	211345	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	206891071
92	NC_011296	ATTGCA	2	12	211826	211837	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	206891071
93	NC_011296	TTTTTG	2	12	214019	214030	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	206890226
94	NC_011296	AGATAC	2	12	216163	216174	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	206889986
95	NC_011296	AGAAAA	2	12	220698	220709	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	206891091
96	NC_011296	ATATGA	2	12	221317	221328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	206889532
97	NC_011296	CCTCAA	2	12	222411	222422	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	206890653
98	NC_011296	TTTTTC	2	12	222988	222999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	206890653
99	NC_011296	AATAAA	2	12	226496	226507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	206890247
100	NC_011296	GCCCGT	2	12	227421	227432	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	206890027
101	NC_011296	TTCCAT	2	12	232077	232088	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	206890196
102	NC_011296	CTATTC	2	12	232298	232309	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	206889291
103	NC_011296	CTTCAA	2	12	235716	235727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890864
104	NC_011296	ATTAAG	2	12	236033	236044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	206890864
105	NC_011296	ACTGGG	2	12	236258	236269	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	206890864
106	NC_011296	AGAATA	2	12	237360	237371	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	206891020
107	NC_011296	TCTTTA	2	12	237513	237524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	206891020
108	NC_011296	ATGTTA	2	12	237543	237554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	206891020
109	NC_011296	ATAGTA	2	12	237635	237646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	206889819
110	NC_011296	TGTATA	2	12	240711	240722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	206889640
111	NC_011296	GCTTAT	2	12	240939	240950	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	206889640
112	NC_011296	ATGCTC	2	12	242123	242134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	206889191
113	NC_011296	GCAAGA	2	12	243799	243810	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	206890586
114	NC_011296	TCTGCT	2	12	248367	248378	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	206890568
115	NC_011296	TTTTTA	2	12	251869	251880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	206889976
116	NC_011296	TAGAAG	2	12	256994	257005	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	206889421
117	NC_011296	GTTTCT	2	12	257659	257670	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	206889421
118	NC_011296	AATATT	2	12	261409	261420	50 %	50 %	0 %	0 %	206890964
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233	NC_011296	GCAATT	2	12	556739	556750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	206889595
234	NC_011296	TACTTC	2	12	557504	557515	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	206890991
235	NC_011296	AAAAGA	2	12	563061	563072	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	206889325
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343	NC_011296	TATTAA	2	12	786058	786069	50 %	50 %	0 %	0 %	206889921
344	NC_011296	TTTATA	2	12	794724	794735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889281
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457	NC_011296	CTGAAC	2	12	1040606	1040617	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	206889397
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