MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 398

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011296	ATTT	2	8	2368	2375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011296	TATT	2	8	8489	8496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011296	ATTT	2	8	12561	12568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011296	AATT	2	8	28358	28365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011296	ATAA	2	8	28382	28389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011296	TTAA	2	8	36054	36061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011296	AAAT	2	8	41272	41279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011296	TGGA	2	8	42595	42602	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011296	TTTA	2	8	55350	55357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011296	GAAA	2	8	55860	55867	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011296	TAAG	2	8	62640	62647	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011296	TTTA	2	8	80894	80901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011296	ACTG	2	8	81041	81048	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011296	GAGG	2	8	81081	81088	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011296	ATTT	2	8	81090	81097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011296	TGAA	2	8	81314	81321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011296	CGTG	2	8	81395	81402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011296	GTTT	2	8	81453	81460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011296	ATTT	2	8	90431	90438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011296	TAAA	3	12	92160	92171	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011296	TCCT	2	8	92364	92371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011296	ATAA	2	8	92442	92449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011296	ATTT	2	8	105442	105449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011296	TAGA	2	8	105471	105478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011296	TATT	2	8	108120	108127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011296	TCCC	2	8	125759	125766	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_011296	TATT	2	8	135686	135693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011296	AGGG	2	8	135716	135723	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011296	TTTA	2	8	142386	142393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011296	TTAA	2	8	144330	144337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011296	TAAA	2	8	162810	162817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011296	CTCC	2	8	164989	164996	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_011296	GGAG	2	8	165002	165009	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011296	TGTT	2	8	170041	170048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011296	TTAA	2	8	176601	176608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011296	AGAA	2	8	178070	178077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011296	AATA	2	8	178378	178385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011296	AAAG	2	8	178415	178422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011296	TTAT	2	8	178707	178714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011296	ATAA	2	8	179036	179043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011296	TAAA	2	8	179310	179317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011296	TTCT	2	8	179399	179406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011296	ATGA	2	8	186810	186817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011296	ATTA	2	8	191093	191100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011296	AAAG	2	8	199033	199040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011296	TGAA	2	8	206738	206745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011296	ATTT	2	8	212060	212067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011296	AGAA	2	8	238579	238586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011296	GGGA	2	8	244881	244888	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011296	GAAA	2	8	246864	246871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011296	ATAC	2	8	247078	247085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011296	CAAA	2	8	247086	247093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011296	TTTG	2	8	247318	247325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011296	CAAA	3	12	253000	253011	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011296	AGGG	2	8	256613	256620	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011296	CTTT	2	8	260057	260064	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011296	TGGC	2	8	262054	262061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011296	TATC	2	8	275226	275233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011296	AATC	2	8	284137	284144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011296	TAAC	2	8	287570	287577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011296	AACA	2	8	290141	290148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011296	ATGA	2	8	290151	290158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011296	GATT	2	8	295805	295812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011296	CGCT	2	8	295832	295839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011296	ATTA	2	8	296206	296213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011296	ATTA	2	8	298794	298801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011296	AGGC	2	8	300717	300724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011296	GCCT	2	8	300731	300738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011296	TAGT	2	8	303056	303063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011296	CGCT	2	8	303108	303115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011296	GATT	2	8	303154	303161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011296	CGCT	2	8	303181	303188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011296	ACAT	2	8	303307	303314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011296	CTAT	2	8	306061	306068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011296	ATGA	2	8	306114	306121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011296	CAAG	2	8	306634	306641	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011296	ATTT	2	8	307841	307848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011296	AAAT	2	8	335728	335735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011296	GATA	2	8	338612	338619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011296	CTTT	2	8	339162	339169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011296	CTTA	2	8	343561	343568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011296	TAAT	2	8	345739	345746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011296	CAGC	2	8	349464	349471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011296	TTAT	2	8	372333	372340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011296	TTTC	2	8	372399	372406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011296	GGTT	3	12	378159	378170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011296	TATG	2	8	400220	400227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011296	TATT	2	8	400233	400240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011296	TGCC	2	8	400263	400270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011296	GAAG	2	8	400751	400758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011296	ATTT	3	12	400768	400779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011296	ATAA	2	8	401057	401064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011296	ATAA	2	8	401076	401083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011296	CAGA	2	8	408348	408355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011296	ATTT	3	12	416683	416694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011296	AAAT	2	8	417218	417225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011296	TTCG	2	8	417300	417307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011296	TTTA	2	8	421179	421186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011296	TAAA	2	8	421198	421205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011296	GAAT	2	8	421744	421751	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011296	ATTT	2	8	426185	426192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011296	CAAT	2	8	426246	426253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011296	TTTC	2	8	426266	426273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011296	GATG	2	8	426412	426419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011296	TCCT	2	8	432308	432315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011296	AATA	2	8	432519	432526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011296	AAAG	2	8	451393	451400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011296	TTTC	2	8	452981	452988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011296	GAAA	2	8	453294	453301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011296	GCTT	2	8	454682	454689	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011296	CAGG	2	8	499334	499341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011296	AAAT	2	8	504811	504818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011296	TTGA	2	8	506990	506997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011296	ATTT	2	8	511050	511057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011296	AAAT	2	8	512754	512761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011296	TTTC	2	8	518822	518829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011296	CCTC	2	8	538635	538642	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_011296	CAAA	2	8	538937	538944	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011296	ATTT	2	8	566888	566895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011296	TTCT	2	8	566915	566922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011296	GAGG	2	8	567340	567347	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011296	AAAC	2	8	584782	584789	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011296	TTTA	2	8	613286	613293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011296	AATT	2	8	613337	613344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011296	GTTT	2	8	631676	631683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011296	CAAC	2	8	631856	631863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011296	TTGT	2	8	632099	632106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011296	TTTG	2	8	632579	632586	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011296	AATT	2	8	632645	632652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011296	AATT	2	8	636241	636248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011296	TGAT	2	8	642882	642889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011296	ACAT	2	8	648332	648339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011296	AATT	2	8	655102	655109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011296	GAGG	2	8	677013	677020	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011296	ATAA	2	8	679036	679043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011296	AGAA	2	8	679904	679911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011296	TTTG	2	8	691083	691090	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011296	TTTA	2	8	691900	691907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011296	TAAT	2	8	692887	692894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011296	ATTA	2	8	714488	714495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011296	AGGG	2	8	716696	716703	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011296	TTTA	2	8	717141	717148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011296	TCAA	2	8	717177	717184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011296	AATG	2	8	730724	730731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011296	ACTG	2	8	741398	741405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011296	ATTT	2	8	784231	784238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011296	AATT	2	8	784255	784262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011296	TAAA	2	8	797364	797371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011296	AATG	2	8	802290	802297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011296	ATTT	2	8	802312	802319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_011296	TCCT	2	8	810913	810920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.