MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 1592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011296	GTT	2	6	2402	2407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011296	AAG	2	6	2450	2455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011296	AGG	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011296	TAA	2	6	10942	10947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011296	CAG	2	6	12706	12711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011296	AGT	2	6	13672	13677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011296	TAA	2	6	13815	13820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011296	GTT	2	6	13974	13979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011296	AGG	2	6	15312	15317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011296	TGT	2	6	22234	22239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011296	TCC	2	6	27811	27816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011296	ATA	2	6	28274	28279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011296	AAT	2	6	28344	28349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011296	CCT	2	6	31508	31513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011296	ATT	2	6	31534	31539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011296	GAA	2	6	37989	37994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011296	ATT	2	6	38006	38011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011296	TTG	2	6	38019	38024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011296	CTT	2	6	38042	38047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011296	GTT	2	6	38069	38074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011296	CCT	2	6	40468	40473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011296	AGA	2	6	41179	41184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011296	ACA	2	6	41250	41255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011296	ACC	2	6	49433	49438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_011296	TAA	3	9	49441	49449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011296	TAT	2	6	49464	49469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011296	CAA	2	6	49517	49522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011296	AGG	2	6	49531	49536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011296	AGC	2	6	55171	55176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011296	TAA	2	6	55316	55321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011296	CTT	2	6	55333	55338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011296	GAT	2	6	55886	55891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011296	TAT	2	6	57140	57145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011296	GGA	2	6	59097	59102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011296	AGG	2	6	59871	59876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011296	TAG	2	6	62127	62132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011296	TAA	2	6	62571	62576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011296	TTA	2	6	62578	62583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011296	ATT	2	6	62630	62635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011296	ACC	2	6	71492	71497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011296	TAA	2	6	80884	80889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011296	AAG	2	6	81331	81336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011296	CCA	2	6	81413	81418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011296	TAA	2	6	81432	81437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011296	ATT	2	6	81562	81567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011296	AGG	2	6	84747	84752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011296	TCC	2	6	86699	86704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011296	GGA	2	6	86767	86772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011296	GCT	2	6	86782	86787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011296	AAG	2	6	86810	86815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011296	ACT	2	6	87643	87648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011296	ATT	2	6	87722	87727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011296	CCT	2	6	90363	90368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011296	GTA	2	6	90449	90454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011296	TAA	2	6	91889	91894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011296	GCT	2	6	91903	91908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011296	ATT	2	6	91933	91938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011296	CAG	2	6	91941	91946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011296	TGC	2	6	92001	92006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011296	ATT	2	6	92032	92037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011296	ATA	2	6	92137	92142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011296	AAG	2	6	92148	92153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011296	AGA	2	6	92315	92320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011296	CAT	2	6	92684	92689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011296	CCT	2	6	94725	94730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011296	TCC	3	9	96300	96308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011296	TAT	2	6	105399	105404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011296	ATA	2	6	105408	105413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011296	ATA	2	6	105503	105508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011296	AGG	2	6	105513	105518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011296	GAA	2	6	107956	107961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011296	GAA	2	6	107993	107998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011296	ATC	2	6	108019	108024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011296	GAG	3	9	108091	108099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011296	AGG	2	6	108582	108587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011296	TAT	2	6	109674	109679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011296	CCT	2	6	111725	111730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011296	TAA	2	6	111741	111746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011296	CCT	2	6	115451	115456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011296	TTA	2	6	118137	118142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011296	AAT	2	6	118144	118149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011296	ACT	2	6	118184	118189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011296	TAG	2	6	118344	118349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011296	TAC	2	6	118351	118356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011296	TAA	2	6	125673	125678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011296	GGC	2	6	125709	125714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011296	AAT	2	6	125779	125784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011296	TCT	2	6	125795	125800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011296	TTG	2	6	125819	125824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011296	TAT	2	6	131167	131172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011296	TCC	3	9	131254	131262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011296	GTA	2	6	131376	131381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011296	TCC	2	6	131395	131400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011296	CTC	2	6	131412	131417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_011296	CTC	2	6	131436	131441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011296	AAT	2	6	131458	131463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011296	AAG	2	6	131479	131484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011296	CTG	2	6	131499	131504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011296	CCT	2	6	134252	134257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011296	TGA	2	6	134260	134265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011296	GAG	2	6	134347	134352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011296	AAC	2	6	135694	135699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011296	TCC	2	6	142368	142373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011296	GTG	2	6	142376	142381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011296	ATT	2	6	142431	142436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011296	CTT	2	6	143113	143118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011296	ACA	2	6	143217	143222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011296	TAT	2	6	143236	143241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011296	GAG	2	6	150302	150307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011296	CTG	2	6	150316	150321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011296	TGT	2	6	154346	154351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011296	ATT	2	6	162282	162287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011296	AGG	2	6	162825	162830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011296	AGG	2	6	164472	164477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011296	GGA	2	6	168516	168521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011296	TCC	2	6	168543	168548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011296	ATA	2	6	177300	177305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011296	TCT	2	6	177322	177327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011296	CTT	2	6	177371	177376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011296	GCA	2	6	177385	177390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011296	TAT	2	6	177565	177570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011296	TCA	2	6	177627	177632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011296	CAG	2	6	177667	177672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011296	AAG	2	6	177872	177877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011296	CAT	2	6	177889	177894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011296	AAT	2	6	177995	178000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011296	GGA	2	6	178107	178112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011296	ATA	2	6	178203	178208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011296	ATG	2	6	178266	178271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011296	ACT	2	6	178398	178403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011296	ATG	2	6	178432	178437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011296	TTC	2	6	178460	178465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011296	ATC	2	6	178559	178564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011296	AAT	2	6	178583	178588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011296	TGT	2	6	178591	178596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011296	TCT	2	6	178677	178682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011296	ATT	2	6	178701	178706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011296	CAA	2	6	178825	178830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_011296	GTC	2	6	179279	179284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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