MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 26295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011296	GTG	2	6	45	50	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206889903
2	NC_011296	AAC	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889903
3	NC_011296	CCT	2	6	209	214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206889903
4	NC_011296	CTG	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889903
5	NC_011296	TAG	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889903
6	NC_011296	TAA	2	6	489	494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889903
7	NC_011296	AGT	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889903
8	NC_011296	AGA	2	6	622	627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889903
9	NC_011296	TAA	2	6	718	723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889903
10	NC_011296	ATG	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889903
11	NC_011296	GAA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889903
12	NC_011296	GAA	2	6	803	808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889903
13	NC_011296	TAA	2	6	928	933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889903
14	NC_011296	TGG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206889903
15	NC_011296	TAA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889903
16	NC_011296	GAA	2	6	1148	1153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889903
17	NC_011296	TAT	2	6	1228	1233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889903
18	NC_011296	TGA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889903
19	NC_011296	TCC	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890635
20	NC_011296	CTT	2	6	1551	1556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890635
21	NC_011296	TCA	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890635
22	NC_011296	GGA	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206890635
23	NC_011296	CTT	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890635
24	NC_011296	GCT	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890635
25	NC_011296	ATA	2	6	2022	2027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890635
26	NC_011296	ATA	2	6	2055	2060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890635
27	NC_011296	AAG	2	6	2111	2116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890635
28	NC_011296	TAA	2	6	2165	2170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890635
29	NC_011296	AGA	2	6	2171	2176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890635
30	NC_011296	TCT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890635
31	NC_011296	ATG	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890635
32	NC_011296	GCA	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890635
33	NC_011296	ATA	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890635
34	NC_011296	TGA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890766
35	NC_011296	TGA	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890766
36	NC_011296	AAC	2	6	2622	2627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206890766
37	NC_011296	TTA	2	6	2637	2642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890766
38	NC_011296	CTT	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890766
39	NC_011296	TAT	2	6	2657	2662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890766
40	NC_011296	ATT	2	6	2758	2763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890766
41	NC_011296	CCT	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890709
42	NC_011296	TAG	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890709
43	NC_011296	GAA	2	6	3098	3103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890709
44	NC_011296	TCC	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890709
45	NC_011296	TGG	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890709
46	NC_011296	TGT	2	6	3548	3553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889259
47	NC_011296	CAA	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889259
48	NC_011296	CAG	2	6	3649	3654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889259
49	NC_011296	CAG	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889259
50	NC_011296	TTA	2	6	3862	3867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889259
51	NC_011296	TGT	2	6	3920	3925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889259
52	NC_011296	TCT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889259
53	NC_011296	GAA	3	9	4015	4023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889259
54	NC_011296	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889259
55	NC_011296	ATT	2	6	4083	4088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889259
56	NC_011296	ATA	2	6	4092	4097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889259
57	NC_011296	ATG	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889259
58	NC_011296	AAC	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889259
59	NC_011296	GAA	2	6	4380	4385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889259
60	NC_011296	AGA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
61	NC_011296	AGA	2	6	4496	4501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
62	NC_011296	TGG	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890334
63	NC_011296	TGA	2	6	4626	4631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890334
64	NC_011296	AGA	2	6	4647	4652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
65	NC_011296	GAA	2	6	4656	4661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
66	NC_011296	CTT	2	6	4764	4769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890334
67	NC_011296	GAA	2	6	4868	4873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
68	NC_011296	GTT	2	6	4952	4957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206890334
69	NC_011296	CAG	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890334
70	NC_011296	AAT	2	6	4998	5003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890334
71	NC_011296	TCT	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890334
72	NC_011296	ATG	2	6	5266	5271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890334
73	NC_011296	TGG	2	6	5421	5426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890334
74	NC_011296	ATA	2	6	5465	5470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890334
75	NC_011296	GAA	2	6	5497	5502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
76	NC_011296	CAG	2	6	5576	5581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890334
77	NC_011296	TAA	2	6	5585	5590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890334
78	NC_011296	GAA	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
79	NC_011296	TGA	2	6	5739	5744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890334
80	NC_011296	CTG	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890334
81	NC_011296	GGT	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890334
82	NC_011296	GAG	2	6	5822	5827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206890334
83	NC_011296	ACC	2	6	5919	5924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206890334
84	NC_011296	AGG	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206890334
85	NC_011296	ATG	2	6	6069	6074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206891022
86	NC_011296	AAT	2	6	6082	6087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206891022
87	NC_011296	TAG	2	6	6096	6101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206891022
88	NC_011296	TAA	2	6	6108	6113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206891022
89	NC_011296	TGA	2	6	6385	6390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206891022
90	NC_011296	AGA	2	6	6472	6477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206891168
91	NC_011296	CTT	2	6	6503	6508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206891168
92	NC_011296	GTG	2	6	6521	6526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206891168
93	NC_011296	TCA	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206891168
94	NC_011296	TGA	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206891168
95	NC_011296	CAG	2	6	6764	6769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206891168
96	NC_011296	AGA	2	6	6783	6788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206891168
97	NC_011296	CTT	2	6	6811	6816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206891168
98	NC_011296	CCA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206891168
99	NC_011296	CAA	2	6	7016	7021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206891168
100	NC_011296	GTT	2	6	7033	7038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206891168
101	NC_011296	TCT	2	6	7077	7082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206891168
102	NC_011296	TAA	2	6	7302	7307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889766
103	NC_011296	ACA	2	6	7367	7372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889766
104	NC_011296	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889766
105	NC_011296	CTG	2	6	7443	7448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889766
106	NC_011296	TTG	2	6	7452	7457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889766
107	NC_011296	TCT	2	6	7626	7631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889766
108	NC_011296	TGG	2	6	7638	7643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206889766
109	NC_011296	TTC	2	6	7689	7694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889766
110	NC_011296	GCA	2	6	7868	7873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889766
111	NC_011296	ATA	2	6	7904	7909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889766
112	NC_011296	GCA	2	6	7936	7941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889766
113	NC_011296	CAA	2	6	7948	7953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889766
114	NC_011296	TAA	2	6	7980	7985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889766
115	NC_011296	TTC	2	6	7994	7999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889766
116	NC_011296	ACT	2	6	8122	8127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889766
117	NC_011296	CTG	2	6	8196	8201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889766
118	NC_011296	GTA	2	6	8246	8251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889766
119	NC_011296	TTG	2	6	8316	8321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889766
120	NC_011296	CTG	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889766
121	NC_011296	TTG	2	6	8427	8432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889766
122	NC_011296	AAC	2	6	8724	8729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206890613
123	NC_011296	TTC	2	6	8736	8741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890613
124	NC_011296	CTT	2	6	8834	8839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890613
125	NC_011296	AAG	2	6	9058	9063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890613
126	NC_011296	TCC	2	6	9129	9134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890613
127	NC_011296	ATA	2	6	9209	9214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890613
128	NC_011296	TTA	2	6	9229	9234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890613
129	NC_011296	TCC	2	6	9240	9245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890613
130	NC_011296	CAC	2	6	9303	9308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206890613
131	NC_011296	TAC	2	6	9348	9353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890613
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