MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011295	AGCTAC	2	12	949	960	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011295	GATGCG	2	12	25814	25825	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011295	TGGCGC	2	12	30429	30440	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011295	ACGCAA	2	12	33514	33525	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011295	TCGGTT	2	12	39440	39451	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011295	TCTTTG	2	12	46848	46859	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011295	ATACAC	2	12	97753	97764	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011295	AATTGA	2	12	253263	253274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011295	CAAAGC	2	12	253882	253893	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011295	TTTTTC	2	12	296024	296035	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011295	GAAGAC	2	12	563478	563489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011295	CTTTTA	2	12	684103	684114	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011295	CTTCCG	2	12	780761	780772	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011295	ATGTGA	2	12	804898	804909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011295	GGAACA	2	12	871329	871340	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011295	AGGTGA	2	12	928031	928042	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011295	CTTTGT	2	12	930362	930373	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011295	GCATGT	2	12	935426	935437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011295	CTTCCA	2	12	936621	936632	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011295	TTTGTA	2	12	939679	939690	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011295	GGCACA	2	12	944445	944456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011295	ACCCGT	2	12	1039722	1039733	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011295	CTTCCA	2	12	1128685	1128696	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011295	TTTGTA	2	12	1131745	1131756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011295	AACTGT	2	12	1192050	1192061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011295	TGTCAA	2	12	1228486	1228497	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011295	ATTACA	2	12	1237012	1237023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011295	GTAACA	2	12	1243029	1243040	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011295	TATACA	2	12	1344285	1344296	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011295	AAATAG	2	12	1395278	1395289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011295	AGAAAA	2	12	1420771	1420782	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.