MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011295	ATTGC	2	10	3896	3905	20 %	40 %	20 %	20 %	206895113
2	NC_011295	GCTGG	2	10	4004	4013	0 %	20 %	60 %	20 %	206895113
3	NC_011295	GCTAA	2	10	4661	4670	40 %	20 %	20 %	20 %	206895739
4	NC_011295	CAAAT	2	10	4925	4934	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011295	CAACG	2	10	8645	8654	40 %	0 %	20 %	40 %	206896121
6	NC_011295	AGAAC	2	10	9286	9295	60 %	0 %	20 %	20 %	206895327
7	NC_011295	GCTCA	2	10	13873	13882	20 %	20 %	20 %	40 %	206895847
8	NC_011295	CACTT	2	10	14181	14190	20 %	40 %	0 %	40 %	206895847
9	NC_011295	CAGCT	2	10	14290	14299	20 %	20 %	20 %	40 %	206895847
10	NC_011295	AAAAG	2	10	18720	18729	80 %	0 %	20 %	0 %	206895542
11	NC_011295	CCTTG	2	10	18930	18939	0 %	40 %	20 %	40 %	206895542
12	NC_011295	TACGG	2	10	19855	19864	20 %	20 %	40 %	20 %	206895670
13	NC_011295	CCGTT	2	10	20192	20201	0 %	40 %	20 %	40 %	206895088
14	NC_011295	TCGTA	2	10	21437	21446	20 %	40 %	20 %	20 %	206895080
15	NC_011295	CCTTC	2	10	22264	22273	0 %	40 %	0 %	60 %	206895881
16	NC_011295	TTTGC	2	10	23192	23201	0 %	60 %	20 %	20 %	206895172
17	NC_011295	TGCCA	2	10	23856	23865	20 %	20 %	20 %	40 %	206895658
18	NC_011295	GTTGG	2	10	26871	26880	0 %	40 %	60 %	0 %	206895448
19	NC_011295	CTTAA	2	10	27879	27888	40 %	40 %	0 %	20 %	206895448
20	NC_011295	GAAAA	2	10	29525	29534	80 %	0 %	20 %	0 %	206895579
21	NC_011295	CCACT	2	10	30897	30906	20 %	20 %	0 %	60 %	206896272
22	NC_011295	AGATC	2	10	31834	31843	40 %	20 %	20 %	20 %	206896272
23	NC_011295	ACTCC	2	10	33149	33158	20 %	20 %	0 %	60 %	206895272
24	NC_011295	GCCAT	2	10	35199	35208	20 %	20 %	20 %	40 %	206895395
25	NC_011295	GAACT	2	10	36435	36444	40 %	20 %	20 %	20 %	206895489
26	NC_011295	ATATC	2	10	37144	37153	40 %	40 %	0 %	20 %	206896382
27	NC_011295	AGAAA	2	10	38656	38665	80 %	0 %	20 %	0 %	206895806
28	NC_011295	AGTTT	2	10	41203	41212	20 %	60 %	20 %	0 %	206895547
29	NC_011295	GGATG	2	10	41618	41627	20 %	20 %	60 %	0 %	206896367
30	NC_011295	GCCAG	2	10	42110	42119	20 %	0 %	40 %	40 %	206896367
31	NC_011295	GGGCC	2	10	45659	45668	0 %	0 %	60 %	40 %	206895207
32	NC_011295	TGCAG	2	10	45905	45914	20 %	20 %	40 %	20 %	206896042
33	NC_011295	CTTTT	2	10	49581	49590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011295	CCCAT	2	10	50372	50381	20 %	20 %	0 %	60 %	206896426
35	NC_011295	CATAC	2	10	51500	51509	40 %	20 %	0 %	40 %	206896426
36	NC_011295	ATTTC	2	10	54429	54438	20 %	60 %	0 %	20 %	206895812
37	NC_011295	TGGGC	2	10	58367	58376	0 %	20 %	60 %	20 %	206895387
38	NC_011295	AGCAA	2	10	58922	58931	60 %	0 %	20 %	20 %	206895387
39	NC_011295	AAAGA	2	10	59231	59240	80 %	0 %	20 %	0 %	206895387
40	NC_011295	AAGCA	2	10	61757	61766	60 %	0 %	20 %	20 %	206896094
41	NC_011295	GCAAA	2	10	62078	62087	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011295	GCCAG	2	10	63147	63156	20 %	0 %	40 %	40 %	206895447
43	NC_011295	ACATA	2	10	63683	63692	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011295	CGATC	2	10	64473	64482	20 %	20 %	20 %	40 %	206896229
45	NC_011295	GCTAC	2	10	66689	66698	20 %	20 %	20 %	40 %	206896408
46	NC_011295	ATACC	2	10	69245	69254	40 %	20 %	0 %	40 %	206895652
47	NC_011295	CACAA	2	10	70257	70266	60 %	0 %	0 %	40 %	206895652
48	NC_011295	TCAGT	2	10	72454	72463	20 %	40 %	20 %	20 %	206895112
49	NC_011295	ATGAC	2	10	73184	73193	40 %	20 %	20 %	20 %	206895112
50	NC_011295	AGTAC	2	10	74181	74190	40 %	20 %	20 %	20 %	206896449
51	NC_011295	TTGGT	2	10	74766	74775	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011295	TGGAA	2	10	77739	77748	40 %	20 %	40 %	0 %	206896461
53	NC_011295	TGAAG	2	10	79486	79495	40 %	20 %	40 %	0 %	206895251
54	NC_011295	GTGAA	2	10	81702	81711	40 %	20 %	40 %	0 %	206895251
55	NC_011295	TCAGA	2	10	82432	82441	40 %	20 %	20 %	20 %	206895251
56	NC_011295	TGCCA	2	10	92836	92845	20 %	20 %	20 %	40 %	206896030
57	NC_011295	AACAG	2	10	93665	93674	60 %	0 %	20 %	20 %	206896030
58	NC_011295	TCAGT	2	10	93907	93916	20 %	40 %	20 %	20 %	206896030
59	NC_011295	ACTGG	2	10	96425	96434	20 %	20 %	40 %	20 %	206895589
60	NC_011295	TGGGA	2	10	96905	96914	20 %	20 %	60 %	0 %	206896417
61	NC_011295	GGCTC	2	10	97095	97104	0 %	20 %	40 %	40 %	206896417
62	NC_011295	CTTTT	2	10	103804	103813	0 %	80 %	0 %	20 %	206895904
63	NC_011295	AGAAA	2	10	106714	106723	80 %	0 %	20 %	0 %	206896086
64	NC_011295	CAGAA	2	10	108815	108824	60 %	0 %	20 %	20 %	206895465
65	NC_011295	GCCAG	2	10	109538	109547	20 %	0 %	40 %	40 %	206895465
66	NC_011295	TTTCC	2	10	109858	109867	0 %	60 %	0 %	40 %	206895465
67	NC_011295	TTTGT	2	10	111640	111649	0 %	80 %	20 %	0 %	206896505
68	NC_011295	CTCAG	2	10	113424	113433	20 %	20 %	20 %	40 %	206895349
69	NC_011295	ACGTG	2	10	115620	115629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011295	AAGGA	2	10	118594	118603	60 %	0 %	40 %	0 %	206896154
71	NC_011295	CAGCA	2	10	118748	118757	40 %	0 %	20 %	40 %	206896154
72	NC_011295	TGTTT	2	10	119106	119115	0 %	80 %	20 %	0 %	206896039
73	NC_011295	GCATG	2	10	122854	122863	20 %	20 %	40 %	20 %	206895209
74	NC_011295	TCCAA	2	10	123632	123641	40 %	20 %	0 %	40 %	206896525
75	NC_011295	TCCAA	2	10	126181	126190	40 %	20 %	0 %	40 %	206895698
76	NC_011295	AAGAG	2	10	126470	126479	60 %	0 %	40 %	0 %	206895698
77	NC_011295	CATAG	2	10	126840	126849	40 %	20 %	20 %	20 %	206895698
78	NC_011295	GACCA	2	10	132058	132067	40 %	0 %	20 %	40 %	206895761
79	NC_011295	AATGG	2	10	132278	132287	40 %	20 %	40 %	0 %	206895761
80	NC_011295	TAAAG	2	10	134910	134919	60 %	20 %	20 %	0 %	206895586
81	NC_011295	CTGAT	2	10	143202	143211	20 %	40 %	20 %	20 %	206895771
82	NC_011295	TTCTT	2	10	144250	144259	0 %	80 %	0 %	20 %	206896099
83	NC_011295	TGGGA	2	10	146459	146468	20 %	20 %	60 %	0 %	206895425
84	NC_011295	CCTTC	2	10	146578	146587	0 %	40 %	0 %	60 %	206895425
85	NC_011295	CTCTG	2	10	150609	150618	0 %	40 %	20 %	40 %	206895786
86	NC_011295	GCAAG	2	10	151597	151606	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011295	GTTAT	2	10	158079	158088	20 %	60 %	20 %	0 %	206896092
88	NC_011295	GGTAA	2	10	158963	158972	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011295	CATGC	2	10	159380	159389	20 %	20 %	20 %	40 %	206895660
90	NC_011295	GTTTT	2	10	159727	159736	0 %	80 %	20 %	0 %	206896299
91	NC_011295	TTTTC	2	10	159871	159880	0 %	80 %	0 %	20 %	206896299
92	NC_011295	ACGGC	2	10	163394	163403	20 %	0 %	40 %	40 %	206895266
93	NC_011295	TGCCA	2	10	164256	164265	20 %	20 %	20 %	40 %	206895266
94	NC_011295	GCTTT	2	10	164725	164734	0 %	60 %	20 %	20 %	206895803
95	NC_011295	TTTTC	2	10	164844	164853	0 %	80 %	0 %	20 %	206895803
96	NC_011295	TCCGA	2	10	168838	168847	20 %	20 %	20 %	40 %	206896380
97	NC_011295	TGGTG	2	10	168966	168975	0 %	40 %	60 %	0 %	206896380
98	NC_011295	GCCAC	2	10	170237	170246	20 %	0 %	20 %	60 %	206896288
99	NC_011295	TCCAT	2	10	171256	171265	20 %	40 %	0 %	40 %	206895631
100	NC_011295	CATCT	2	10	172936	172945	20 %	40 %	0 %	40 %	206895308
101	NC_011295	TAAAA	2	10	174556	174565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011295	CTTTT	2	10	174781	174790	0 %	80 %	0 %	20 %	206895890
103	NC_011295	TGGTA	2	10	174884	174893	20 %	40 %	40 %	0 %	206895890
104	NC_011295	AAGGA	2	10	177210	177219	60 %	0 %	40 %	0 %	206895457
105	NC_011295	AAAGA	2	10	184106	184115	80 %	0 %	20 %	0 %	206896298
106	NC_011295	CCTTC	2	10	187982	187991	0 %	40 %	0 %	60 %	206895149
107	NC_011295	AAGGT	2	10	188770	188779	40 %	20 %	40 %	0 %	206896159
108	NC_011295	TACTA	2	10	191353	191362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011295	AGTGA	2	10	191603	191612	40 %	20 %	40 %	0 %	206895264
110	NC_011295	TCTTT	2	10	192008	192017	0 %	80 %	0 %	20 %	206895264
111	NC_011295	GCAAA	2	10	193021	193030	60 %	0 %	20 %	20 %	206896219
112	NC_011295	TGCAT	2	10	193776	193785	20 %	40 %	20 %	20 %	206895553
113	NC_011295	TTACA	2	10	193838	193847	40 %	40 %	0 %	20 %	206895553
114	NC_011295	AAGAT	2	10	195208	195217	60 %	20 %	20 %	0 %	206895314
115	NC_011295	TTTCC	2	10	197440	197449	0 %	60 %	0 %	40 %	206895200
116	NC_011295	TTTTG	2	10	198356	198365	0 %	80 %	20 %	0 %	206896143
117	NC_011295	AAGAA	2	10	199965	199974	80 %	0 %	20 %	0 %	206895913
118	NC_011295	AAAGC	2	10	201557	201566	60 %	0 %	20 %	20 %	206895285
119	NC_011295	TTGCT	2	10	204563	204572	0 %	60 %	20 %	20 %	206895725
120	NC_011295	AAAGC	2	10	205677	205686	60 %	0 %	20 %	20 %	206896303
121	NC_011295	TGTGC	2	10	209966	209975	0 %	40 %	40 %	20 %	206895352
122	NC_011295	CAAGC	2	10	210967	210976	40 %	0 %	20 %	40 %	206896393
123	NC_011295	AAAGC	2	10	211961	211970	60 %	0 %	20 %	20 %	206895255
124	NC_011295	CACAT	2	10	212149	212158	40 %	20 %	0 %	40 %	206895255
125	NC_011295	ACCAA	2	10	213560	213569	60 %	0 %	0 %	40 %	206896071
126	NC_011295	CCAAT	2	10	213891	213900	40 %	20 %	0 %	40 %	206896071
127	NC_011295	AAAGG	2	10	217980	217989	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011295	TGCTG	2	10	221251	221260	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011295	GGAAG	2	10	222176	222185	40 %	0 %	60 %	0 %	206896369
130	NC_011295	GCAAG	2	10	224810	224819	40 %	0 %	40 %	20 %	206895441
131	NC_011295	AACCA	2	10	226025	226034	60 %	0 %	0 %	40 %	206895899
132	NC_011295	AAAGG	2	10	226341	226350	60 %	0 %	40 %	0 %	206895899
133	NC_011295	GTCAT	2	10	226501	226510	20 %	40 %	20 %	20 %	206895899
134	NC_011295	ACTTC	2	10	229634	229643	20 %	40 %	0 %	40 %	206895976
135	NC_011295	GTTAG	2	10	230737	230746	20 %	40 %	40 %	0 %	206895697
136	NC_011295	TTTGG	2	10	232955	232964	0 %	60 %	40 %	0 %	206896132
137	NC_011295	ATATG	2	10	235909	235918	40 %	40 %	20 %	0 %	206896246
138	NC_011295	GCCAA	2	10	236077	236086	40 %	0 %	20 %	40 %	206895333
139	NC_011295	TTGTT	2	10	237088	237097	0 %	80 %	20 %	0 %	206895831
140	NC_011295	CACTG	2	10	237703	237712	20 %	20 %	20 %	40 %	206895831
141	NC_011295	CCCAG	2	10	238337	238346	20 %	0 %	20 %	60 %	206895831
142	NC_011295	ATTCC	2	10	242268	242277	20 %	40 %	0 %	40 %	206895808
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147	NC_011295	TGTTT	2	10	252578	252587	0 %	80 %	20 %	0 %	206896135
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158	NC_011295	CTTTA	2	10	273541	273550	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_011295	TTTTA	2	10	275175	275184	20 %	80 %	0 %	0 %	206895246
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164	NC_011295	GCGTG	2	10	282747	282756	0 %	20 %	60 %	20 %	206896252
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167	NC_011295	AAGGA	2	10	288878	288887	60 %	0 %	40 %	0 %	206895941
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187	NC_011295	TTTTG	2	10	324549	324558	0 %	80 %	20 %	0 %	206895337
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189	NC_011295	TGGAT	2	10	327591	327600	20 %	40 %	40 %	0 %	206895592
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244	NC_011295	AGGTG	2	10	418178	418187	20 %	20 %	60 %	0 %	206896557
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249	NC_011295	GCTGC	2	10	427128	427137	0 %	20 %	40 %	40 %	206895978
250	NC_011295	GACAA	2	10	429770	429779	60 %	0 %	20 %	20 %	206896336
251	NC_011295	TCATA	2	10	431501	431510	40 %	40 %	0 %	20 %	206895977
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261	NC_011295	TCGTT	2	10	444791	444800	0 %	60 %	20 %	20 %	206895514
262	NC_011295	AAGAA	2	10	445597	445606	80 %	0 %	20 %	0 %	206895731
263	NC_011295	AGTGG	2	10	449763	449772	20 %	20 %	60 %	0 %	206896274
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