MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011295	CAAAT	2	10	4925	4934	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011295	CTTTT	2	10	49581	49590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011295	GCAAA	2	10	62078	62087	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011295	ACATA	2	10	63683	63692	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011295	TTGGT	2	10	74766	74775	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011295	ACGTG	2	10	115620	115629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011295	GCAAG	2	10	151597	151606	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011295	GGTAA	2	10	158963	158972	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011295	TAAAA	2	10	174556	174565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011295	TACTA	2	10	191353	191362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011295	AAAGG	2	10	217980	217989	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011295	TGCTG	2	10	221251	221260	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011295	CTTTA	2	10	273541	273550	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011295	ACGGC	2	10	329155	329164	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011295	CTTTT	2	10	333392	333401	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011295	TGCTT	2	10	352278	352287	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011295	AAAAG	2	10	378634	378643	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011295	TGTTA	2	10	379226	379235	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011295	TAATT	2	10	392199	392208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011295	TTAGG	2	10	420075	420084	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011295	TATTT	2	10	476527	476536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011295	GAAAC	2	10	479855	479864	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011295	GAAAA	2	10	482337	482346	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011295	GTTAT	2	10	491490	491499	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011295	AGGGG	2	10	491517	491526	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011295	TTCTT	2	10	494332	494341	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011295	TAGAC	2	10	501468	501477	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011295	TTAAC	2	10	506225	506234	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011295	ATTAT	2	10	510392	510401	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011295	TGCGC	2	10	563149	563158	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011295	AAGGG	2	10	583973	583982	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011295	TTTTG	2	10	588308	588317	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011295	GACAA	2	10	694071	694080	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011295	TTGAC	2	10	696627	696636	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011295	ATCAC	2	10	733049	733058	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011295	CAAAG	2	10	771523	771532	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011295	TTTCG	2	10	804986	804995	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011295	TGCCA	2	10	870330	870339	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011295	CAGAT	2	10	928003	928012	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011295	AGCTT	2	10	936366	936375	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011295	GCTTC	2	10	940329	940338	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011295	GGTCG	2	10	940576	940585	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011295	TTCGC	2	10	995045	995054	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011295	CAAAC	2	10	1019633	1019642	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_011295	AAACC	2	10	1029019	1029028	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_011295	GCGAC	2	10	1082143	1082152	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_011295	ACCAT	2	10	1085476	1085485	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011295	ACATT	2	10	1096956	1096965	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011295	AAACA	2	10	1120014	1120023	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011295	AGCTT	2	10	1128429	1128438	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011295	GCTTC	2	10	1132126	1132135	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_011295	CTTTC	2	10	1175431	1175440	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_011295	TTCTC	2	10	1181962	1181971	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011295	CATGA	2	10	1201661	1201670	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011295	CTACA	2	10	1211061	1211070	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_011295	GATTA	2	10	1221374	1221383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011295	GAGCC	2	10	1225554	1225563	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_011295	ATTTT	2	10	1227033	1227042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011295	CTTTC	2	10	1229094	1229103	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_011295	GAGCC	2	10	1234152	1234161	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_011295	ATTTT	2	10	1235631	1235640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011295	CGCAA	2	10	1236994	1237003	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_011295	TTGTT	2	10	1239463	1239472	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011295	AACCA	2	10	1243244	1243253	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011295	CTATT	2	10	1261636	1261645	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011295	AAACT	2	10	1276655	1276664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011295	GTTCG	2	10	1281674	1281683	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011295	TAAGG	2	10	1294951	1294960	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011295	CATAC	2	10	1300015	1300024	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_011295	GGGTT	2	10	1322111	1322120	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011295	TGAAT	2	10	1342299	1342308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011295	TTCTT	2	10	1346625	1346634	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011295	TAACC	2	10	1350617	1350626	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_011295	TTTCA	2	10	1394740	1394749	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011295	TTGTT	2	10	1395804	1395813	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011295	CTTGT	2	10	1398211	1398220	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011295	CTAAG	2	10	1399189	1399198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011295	CCATT	2	10	1401427	1401436	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011295	CTTTT	2	10	1401452	1401461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011295	AAGCA	2	10	1406544	1406553	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011295	AATTT	2	10	1406744	1406753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011295	AGATT	2	10	1422167	1422176	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011295	CTTTG	2	10	1422380	1422389	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011295	TATAA	2	10	1422672	1422681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.