MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 18774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011295	TGA	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895191
2	NC_011295	AAT	2	6	169	174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895191
3	NC_011295	CTG	2	6	332	337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895191
4	NC_011295	CGG	2	6	662	667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895191
5	NC_011295	GGA	2	6	672	677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895191
6	NC_011295	TGG	2	6	687	692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895191
7	NC_011295	GTA	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895191
8	NC_011295	AAG	2	6	746	751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895191
9	NC_011295	AGA	2	6	803	808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011295	CTA	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011295	CAC	2	6	832	837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011295	GTC	2	6	897	902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011295	CTT	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896538
14	NC_011295	GAG	2	6	1324	1329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896538
15	NC_011295	GCT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896538
16	NC_011295	TTC	2	6	1441	1446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896538
17	NC_011295	TTA	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896538
18	NC_011295	CAT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896538
19	NC_011295	ATG	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896538
20	NC_011295	AGC	2	6	1653	1658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896538
21	NC_011295	TGA	3	9	1736	1744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896538
22	NC_011295	AAG	2	6	1769	1774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896538
23	NC_011295	GAA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895125
24	NC_011295	ACG	2	6	1913	1918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895125
25	NC_011295	TGA	2	6	1926	1931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895125
26	NC_011295	AAG	2	6	1968	1973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895125
27	NC_011295	ATG	2	6	2192	2197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895125
28	NC_011295	AGC	2	6	2297	2302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895125
29	NC_011295	AGA	2	6	2349	2354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895125
30	NC_011295	TGC	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895125
31	NC_011295	GTA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895125
32	NC_011295	ATA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895125
33	NC_011295	ATA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011295	CAG	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896061
35	NC_011295	ACT	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896061
36	NC_011295	AGG	2	6	3098	3103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896061
37	NC_011295	GAA	2	6	3111	3116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896061
38	NC_011295	CAT	2	6	3192	3197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896061
39	NC_011295	CTG	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896061
40	NC_011295	GGA	2	6	3318	3323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896061
41	NC_011295	AGG	2	6	3396	3401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011295	AGT	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895113
43	NC_011295	GAA	2	6	3565	3570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895113
44	NC_011295	GCA	2	6	3571	3576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895113
45	NC_011295	CAA	2	6	3716	3721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895113
46	NC_011295	CTT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895113
47	NC_011295	GGT	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895113
48	NC_011295	CAC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895113
49	NC_011295	CAG	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895113
50	NC_011295	AGC	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895113
51	NC_011295	TGA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895113
52	NC_011295	GGC	2	6	4023	4028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895113
53	NC_011295	TGC	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895113
54	NC_011295	AGC	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895739
55	NC_011295	AAG	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895739
56	NC_011295	CCT	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895739
57	NC_011295	TAT	2	6	4552	4557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895739
58	NC_011295	CAG	2	6	4566	4571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895739
59	NC_011295	GGC	2	6	4604	4609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895739
60	NC_011295	ACT	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895739
61	NC_011295	CTT	2	6	4707	4712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895739
62	NC_011295	GGA	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895739
63	NC_011295	AAC	2	6	4745	4750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895739
64	NC_011295	GGT	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895739
65	NC_011295	AGG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011295	GTA	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896391
67	NC_011295	GAA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
68	NC_011295	TAG	2	6	5174	5179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896391
69	NC_011295	AAG	2	6	5180	5185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
70	NC_011295	AAC	2	6	5365	5370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896391
71	NC_011295	TCT	2	6	5377	5382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896391
72	NC_011295	GTA	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896391
73	NC_011295	CTT	2	6	5607	5612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896391
74	NC_011295	GCT	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896391
75	NC_011295	TTA	2	6	5681	5686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896391
76	NC_011295	CAC	2	6	5807	5812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896391
77	NC_011295	AAG	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
78	NC_011295	ACA	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896391
79	NC_011295	TCA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896391
80	NC_011295	TGC	2	6	6109	6114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896391
81	NC_011295	GTT	2	6	6159	6164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896391
82	NC_011295	GAT	2	6	6270	6275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896391
83	NC_011295	GAA	2	6	6399	6404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
84	NC_011295	CCA	2	6	6413	6418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896391
85	NC_011295	GAA	2	6	6478	6483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
86	NC_011295	AAG	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
87	NC_011295	AAC	2	6	6556	6561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896391
88	NC_011295	CAG	2	6	6581	6586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896391
89	NC_011295	CTT	2	6	6593	6598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896391
90	NC_011295	AAG	2	6	6665	6670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
91	NC_011295	TGG	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896391
92	NC_011295	AAG	2	6	7024	7029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896391
93	NC_011295	AAG	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011295	ATT	2	6	7086	7091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895496
95	NC_011295	CAG	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895496
96	NC_011295	GAA	2	6	7233	7238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895496
97	NC_011295	TTC	2	6	7252	7257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895496
98	NC_011295	GGC	2	6	7296	7301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895496
99	NC_011295	AAG	2	6	7315	7320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895496
100	NC_011295	TAA	2	6	7528	7533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895496
101	NC_011295	CAC	2	6	7562	7567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895496
102	NC_011295	AGA	2	6	7592	7597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895496
103	NC_011295	CAA	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895496
104	NC_011295	AGG	2	6	7962	7967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011295	CTA	3	9	8100	8108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896121
106	NC_011295	ATG	2	6	8114	8119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896121
107	NC_011295	ATT	2	6	8319	8324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896121
108	NC_011295	TGG	2	6	8457	8462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896121
109	NC_011295	AAG	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896121
110	NC_011295	ATG	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896121
111	NC_011295	CAT	2	6	8587	8592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896121
112	NC_011295	GAG	2	6	8627	8632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896121
113	NC_011295	TGA	2	6	8686	8691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896121
114	NC_011295	AAT	2	6	8724	8729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206896121
115	NC_011295	CTT	2	6	8879	8884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895327
116	NC_011295	TGG	2	6	8947	8952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895327
117	NC_011295	GCT	2	6	8972	8977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895327
118	NC_011295	TGA	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895327
119	NC_011295	CTA	2	6	9017	9022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895327
120	NC_011295	TTA	2	6	9043	9048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895327
121	NC_011295	CAA	2	6	9079	9084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895327
122	NC_011295	TAC	2	6	9159	9164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895327
123	NC_011295	TGC	2	6	9194	9199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895327
124	NC_011295	CTT	2	6	9222	9227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895327
125	NC_011295	AGC	2	6	9239	9244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895327
126	NC_011295	ACC	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895327
127	NC_011295	ACT	2	6	9491	9496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895327
128	NC_011295	TGC	2	6	9527	9532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895327
129	NC_011295	AGA	2	6	9610	9615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895327
130	NC_011295	ACA	2	6	9651	9656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895327
131	NC_011295	CTA	2	6	9822	9827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895327
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134	NC_011295	GCA	2	6	10338	10343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895327
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242	NC_011295	TCT	2	6	19247	19252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896499
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252	NC_011295	GAA	2	6	19665	19670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895670
253	NC_011295	TAC	3	9	19782	19790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895670
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492	NC_011295	TAA	2	6	36815	36820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_011295	AAC	2	6	36828	36833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_011295	AAG	2	6	37255	37260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896382
498	NC_011295	AAT	2	6	37535	37540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206896382
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