MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 1455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011295	AGA	2	6	803	808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011295	CTA	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011295	CAC	2	6	832	837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011295	GTC	2	6	897	902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011295	ATA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011295	AGG	2	6	3396	3401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011295	AGG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011295	AAG	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011295	AGG	2	6	7962	7967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011295	AGG	2	6	17960	17965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011295	CTA	2	6	19082	19087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011295	CAA	2	6	25745	25750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011295	AAG	2	6	25757	25762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011295	AAT	2	6	25785	25790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011295	CTT	2	6	25802	25807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011295	AAG	2	6	25829	25834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011295	AGT	2	6	25954	25959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011295	TTG	2	6	26032	26037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011295	GAA	2	6	26045	26050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011295	TAA	2	6	26063	26068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011295	AAT	2	6	26149	26154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011295	AAG	2	6	26178	26183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011295	TAA	2	6	30280	30285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011295	CCT	2	6	30422	30427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_011295	ATA	2	6	30446	30451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011295	AGG	2	6	31933	31938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011295	GCT	2	6	32845	32850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011295	AGG	2	6	32862	32867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011295	CAA	2	6	33575	33580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011295	GAA	3	9	36660	36668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011295	TAA	2	6	36815	36820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011295	AAC	2	6	36828	36833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011295	AGA	2	6	38385	38390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011295	AAG	2	6	39234	39239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011295	GCG	2	6	39261	39266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011295	GCA	2	6	39303	39308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011295	GTA	2	6	39326	39331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011295	GCG	2	6	39392	39397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011295	GAT	2	6	39455	39460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011295	TGG	2	6	39465	39470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011295	TTC	2	6	39486	39491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011295	GCG	3	9	39510	39518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011295	ATC	2	6	40970	40975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011295	TTC	2	6	41045	41050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011295	CAT	2	6	41197	41202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011295	CTC	2	6	41340	41345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011295	GTA	2	6	42990	42995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011295	GAT	2	6	43097	43102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011295	AGC	2	6	43118	43123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011295	TTA	2	6	43177	43182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011295	TCC	2	6	43183	43188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011295	ATT	2	6	44105	44110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011295	AGA	2	6	44199	44204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011295	GAG	2	6	44205	44210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011295	AGC	2	6	45041	45046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011295	ATG	2	6	45080	45085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011295	GAG	2	6	45154	45159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011295	AAG	2	6	46770	46775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011295	GAA	2	6	46807	46812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011295	CTT	2	6	46822	46827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011295	AGG	2	6	47869	47874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011295	AGG	2	6	47941	47946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011295	TAA	2	6	49441	49446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011295	GAA	2	6	49603	49608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011295	GCT	2	6	49609	49614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011295	TAG	2	6	49682	49687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011295	TTA	2	6	52431	52436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011295	TCT	2	6	52444	52449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011295	TCA	2	6	52490	52495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011295	CTT	2	6	52499	52504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011295	CTA	2	6	52507	52512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011295	TTA	2	6	54872	54877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011295	AAT	2	6	54894	54899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011295	TAC	2	6	59454	59459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011295	GAC	2	6	59460	59465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011295	ATT	2	6	59469	59474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011295	TAG	2	6	59494	59499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011295	CCT	2	6	60334	60339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011295	TTA	2	6	60348	60353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011295	GAA	2	6	60563	60568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011295	ACC	2	6	62013	62018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011295	GTT	2	6	62029	62034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011295	ATT	2	6	62140	62145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011295	AGG	2	6	62157	62162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011295	CGA	2	6	62167	62172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011295	TTA	2	6	63677	63682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011295	TGA	2	6	65476	65481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011295	TGA	2	6	72431	72436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011295	ATG	2	6	73337	73342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011295	AAG	2	6	74598	74603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011295	AGG	2	6	74717	74722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011295	TGT	2	6	74723	74728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011295	TGC	3	9	74782	74790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011295	GAG	2	6	75565	75570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011295	TTG	2	6	76817	76822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011295	GTG	2	6	76866	76871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011295	CAT	2	6	77869	77874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011295	TAA	2	6	77914	77919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011295	TAT	2	6	77982	77987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011295	TGT	3	9	83624	83632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011295	AGA	2	6	83712	83717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011295	ACC	2	6	83770	83775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011295	GAC	2	6	83817	83822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011295	AGG	2	6	83949	83954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011295	AGA	2	6	86778	86783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011295	TGT	2	6	86820	86825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011295	ATG	2	6	87311	87316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011295	GAA	2	6	87394	87399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011295	TTC	2	6	87426	87431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011295	GGT	2	6	87438	87443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011295	TGT	2	6	87469	87474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011295	AGC	2	6	87479	87484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011295	TTC	2	6	87575	87580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011295	AGG	2	6	87594	87599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011295	CCT	3	9	89045	89053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011295	GGC	2	6	89093	89098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011295	AGG	2	6	89145	89150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011295	ATA	2	6	89398	89403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011295	TGT	2	6	89460	89465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011295	CTG	2	6	89571	89576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011295	TGG	3	9	91905	91913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011295	AAG	2	6	94064	94069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011295	AGG	2	6	94076	94081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011295	CCT	2	6	94089	94094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011295	TCT	2	6	94357	94362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011295	TTA	2	6	94376	94381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011295	AGG	2	6	94542	94547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011295	CAT	2	6	95238	95243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011295	ACA	3	9	97254	97262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011295	TAC	2	6	102513	102518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011295	CTT	2	6	104065	104070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011295	AGA	2	6	104418	104423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011295	AAT	2	6	104454	104459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011295	TAT	2	6	110889	110894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011295	CTT	2	6	112322	112327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011295	TTC	2	6	112348	112353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011295	TTC	2	6	112356	112361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011295	AGC	2	6	115509	115514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011295	GCT	2	6	115530	115535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011295	TAA	2	6	115543	115548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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