MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 3228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011294	AGGTA	2	10	2317	2326	40 %	20 %	40 %	0 %	207855517
2	NC_011294	ATTGC	2	10	3160	3169	20 %	40 %	20 %	20 %	207855518
3	NC_011294	CGGCG	2	10	3908	3917	0 %	0 %	60 %	40 %	207855519
4	NC_011294	CCGCG	2	10	6948	6957	0 %	0 %	40 %	60 %	207855521
5	NC_011294	CCTTC	2	10	8438	8447	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_011294	GAAAA	2	10	9825	9834	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011294	TCTTT	2	10	11087	11096	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011294	GCGTG	2	10	13755	13764	0 %	20 %	60 %	20 %	207855528
9	NC_011294	GTGAT	2	10	14678	14687	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011294	TATTG	2	10	17342	17351	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011294	GGCTG	2	10	18617	18626	0 %	20 %	60 %	20 %	207855533
12	NC_011294	AGAGC	2	10	19138	19147	40 %	0 %	40 %	20 %	207855533
13	NC_011294	CCTGA	2	10	19679	19688	20 %	20 %	20 %	40 %	207855533
14	NC_011294	TACCG	2	10	20816	20825	20 %	20 %	20 %	40 %	207855534
15	NC_011294	GGCCG	2	10	21440	21449	0 %	0 %	60 %	40 %	207855534
16	NC_011294	CTTTT	2	10	23159	23168	0 %	80 %	0 %	20 %	207855535
17	NC_011294	CGGTA	2	10	24327	24336	20 %	20 %	40 %	20 %	207855536
18	NC_011294	CTGTT	2	10	24366	24375	0 %	60 %	20 %	20 %	207855536
19	NC_011294	TATTT	2	10	25200	25209	20 %	80 %	0 %	0 %	207855537
20	NC_011294	ATCTG	2	10	30731	30740	20 %	40 %	20 %	20 %	207855542
21	NC_011294	TTACG	2	10	30786	30795	20 %	40 %	20 %	20 %	207855542
22	NC_011294	GGGCG	2	10	31554	31563	0 %	0 %	80 %	20 %	207855543
23	NC_011294	TGCGT	2	10	31933	31942	0 %	40 %	40 %	20 %	207855544
24	NC_011294	AAAAG	2	10	32327	32336	80 %	0 %	20 %	0 %	207855545
25	NC_011294	TATAA	2	10	33922	33931	60 %	40 %	0 %	0 %	207855546
26	NC_011294	ATCGT	2	10	34675	34684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011294	ATTTT	2	10	34719	34728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011294	TTTTA	2	10	34980	34989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011294	AGCGA	2	10	35348	35357	40 %	0 %	40 %	20 %	207855548
30	NC_011294	TCCTG	2	10	35558	35567	0 %	40 %	20 %	40 %	207855548
31	NC_011294	GGTCA	2	10	37793	37802	20 %	20 %	40 %	20 %	207855549
32	NC_011294	TTCAT	2	10	39065	39074	20 %	60 %	0 %	20 %	207855550
33	NC_011294	TGAAA	2	10	39881	39890	60 %	20 %	20 %	0 %	207855551
34	NC_011294	TAAAA	2	10	43945	43954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011294	ACGGC	2	10	44241	44250	20 %	0 %	40 %	40 %	207855554
36	NC_011294	TTTTA	2	10	44567	44576	20 %	80 %	0 %	0 %	207855554
37	NC_011294	GGGCT	2	10	46315	46324	0 %	20 %	60 %	20 %	207855555
38	NC_011294	GCGTA	2	10	48191	48200	20 %	20 %	40 %	20 %	207855557
39	NC_011294	GACCA	2	10	48796	48805	40 %	0 %	20 %	40 %	207855557
40	NC_011294	CCGGC	2	10	48938	48947	0 %	0 %	40 %	60 %	207855557
41	NC_011294	CAGAC	2	10	50128	50137	40 %	0 %	20 %	40 %	207855557
42	NC_011294	TGTGC	2	10	52889	52898	0 %	40 %	40 %	20 %	207855561
43	NC_011294	GTTTG	2	10	55211	55220	0 %	60 %	40 %	0 %	207855562
44	NC_011294	CACTA	2	10	56342	56351	40 %	20 %	0 %	40 %	207855562
45	NC_011294	CGGCG	2	10	56880	56889	0 %	0 %	60 %	40 %	207855563
46	NC_011294	AGCGC	2	10	56988	56997	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_011294	TTCAC	2	10	57135	57144	20 %	40 %	0 %	40 %	207855564
48	NC_011294	AAAAT	2	10	58706	58715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011294	GGAAA	2	10	59493	59502	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011294	CGCTG	2	10	59984	59993	0 %	20 %	40 %	40 %	207855566
51	NC_011294	CGGCG	2	10	63750	63759	0 %	0 %	60 %	40 %	207855569
52	NC_011294	GCCTG	2	10	64543	64552	0 %	20 %	40 %	40 %	207855569
53	NC_011294	GCGCG	2	10	64697	64706	0 %	0 %	60 %	40 %	207855570
54	NC_011294	CGTGC	2	10	71114	71123	0 %	20 %	40 %	40 %	207855576
55	NC_011294	TTGAT	2	10	71284	71293	20 %	60 %	20 %	0 %	207855576
56	NC_011294	ACCGC	2	10	71844	71853	20 %	0 %	20 %	60 %	207855576
57	NC_011294	TTTGA	2	10	75008	75017	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011294	CGATG	2	10	77326	77335	20 %	20 %	40 %	20 %	207855581
59	NC_011294	GCGAA	2	10	78267	78276	40 %	0 %	40 %	20 %	207855581
60	NC_011294	CGTAC	2	10	79157	79166	20 %	20 %	20 %	40 %	207855581
61	NC_011294	TTGCC	2	10	80794	80803	0 %	40 %	20 %	40 %	207855583
62	NC_011294	CGTCC	2	10	80904	80913	0 %	20 %	20 %	60 %	207855583
63	NC_011294	AAGCG	2	10	81268	81277	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011294	TCAGC	2	10	84023	84032	20 %	20 %	20 %	40 %	207855586
65	NC_011294	GGCCA	2	10	84171	84180	20 %	0 %	40 %	40 %	207855586
66	NC_011294	GTACG	2	10	86742	86751	20 %	20 %	40 %	20 %	207855588
67	NC_011294	CAGAA	2	10	87455	87464	60 %	0 %	20 %	20 %	207855588
68	NC_011294	CCGCA	2	10	89574	89583	20 %	0 %	20 %	60 %	207855590
69	NC_011294	CGGTT	2	10	90079	90088	0 %	40 %	40 %	20 %	207855591
70	NC_011294	GCTCC	2	10	91215	91224	0 %	20 %	20 %	60 %	207855591
71	NC_011294	TGGCG	2	10	91859	91868	0 %	20 %	60 %	20 %	207855593
72	NC_011294	TAAAA	2	10	95332	95341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011294	TTTCC	2	10	95771	95780	0 %	60 %	0 %	40 %	207855597
74	NC_011294	GTGGC	2	10	96340	96349	0 %	20 %	60 %	20 %	207855597
75	NC_011294	GCGCT	2	10	97492	97501	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_011294	AGCGC	2	10	97559	97568	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_011294	TGCAC	2	10	98257	98266	20 %	20 %	20 %	40 %	207855598
78	NC_011294	TGGCA	2	10	98326	98335	20 %	20 %	40 %	20 %	207855598
79	NC_011294	TCTGT	2	10	98652	98661	0 %	60 %	20 %	20 %	207855599
80	NC_011294	GCGCT	2	10	98962	98971	0 %	20 %	40 %	40 %	207855599
81	NC_011294	GGCGC	2	10	99376	99385	0 %	0 %	60 %	40 %	207855599
82	NC_011294	AACGT	2	10	102146	102155	40 %	20 %	20 %	20 %	207855602
83	NC_011294	CCCAA	2	10	104296	104305	40 %	0 %	0 %	60 %	207855605
84	NC_011294	TTGTT	2	10	105003	105012	0 %	80 %	20 %	0 %	207855605
85	NC_011294	GCTTC	2	10	106383	106392	0 %	40 %	20 %	40 %	207855606
86	NC_011294	TGCGT	2	10	106670	106679	0 %	40 %	40 %	20 %	207855606
87	NC_011294	TGATC	2	10	108370	108379	20 %	40 %	20 %	20 %	207855607
88	NC_011294	AAGCG	2	10	108866	108875	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011294	TGGCG	2	10	111530	111539	0 %	20 %	60 %	20 %	207855609
90	NC_011294	AGCGC	2	10	112090	112099	20 %	0 %	40 %	40 %	207855609
91	NC_011294	ACGTT	2	10	112907	112916	20 %	40 %	20 %	20 %	207855610
92	NC_011294	CCGCG	2	10	113175	113184	0 %	0 %	40 %	60 %	207855610
93	NC_011294	GGGGT	2	10	114571	114580	0 %	20 %	80 %	0 %	207855610
94	NC_011294	TAATT	2	10	116092	116101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011294	ATTTT	2	10	116118	116127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011294	ACAGA	2	10	116301	116310	60 %	0 %	20 %	20 %	207855612
97	NC_011294	AAATG	2	10	117411	117420	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011294	CAGCG	2	10	117476	117485	20 %	0 %	40 %	40 %	207855614
99	NC_011294	GCCGG	2	10	117776	117785	0 %	0 %	60 %	40 %	207855614
100	NC_011294	CGAGC	2	10	117901	117910	20 %	0 %	40 %	40 %	207855614
101	NC_011294	ATTTG	2	10	118344	118353	20 %	60 %	20 %	0 %	207855614
102	NC_011294	TTGCC	2	10	122847	122856	0 %	40 %	20 %	40 %	207855618
103	NC_011294	AGCAG	2	10	123524	123533	40 %	0 %	40 %	20 %	207855619
104	NC_011294	AGTTT	2	10	125754	125763	20 %	60 %	20 %	0 %	207855620
105	NC_011294	TAGTG	2	10	126172	126181	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011294	TCGAT	2	10	127602	127611	20 %	40 %	20 %	20 %	207855621
107	NC_011294	CGGCG	2	10	130232	130241	0 %	0 %	60 %	40 %	207855625
108	NC_011294	CGTTT	2	10	130694	130703	0 %	60 %	20 %	20 %	207855625
109	NC_011294	ATTGG	2	10	130958	130967	20 %	40 %	40 %	0 %	207855626
110	NC_011294	ATTCC	2	10	135795	135804	20 %	40 %	0 %	40 %	207855630
111	NC_011294	CCCAA	2	10	137864	137873	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_011294	AAAGC	2	10	138092	138101	60 %	0 %	20 %	20 %	207855632
113	NC_011294	CCGCA	2	10	138625	138634	20 %	0 %	20 %	60 %	207855632
114	NC_011294	TTGTT	2	10	139211	139220	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011294	AGTTC	2	10	140996	141005	20 %	40 %	20 %	20 %	207855634
116	NC_011294	TGCCT	2	10	141096	141105	0 %	40 %	20 %	40 %	207855635
117	NC_011294	AAGCG	2	10	145749	145758	40 %	0 %	40 %	20 %	207855638
118	NC_011294	GTTTG	2	10	147652	147661	0 %	60 %	40 %	0 %	207855640
119	NC_011294	CGTAT	2	10	149123	149132	20 %	40 %	20 %	20 %	207855641
120	NC_011294	ATCAG	2	10	150959	150968	40 %	20 %	20 %	20 %	207855643
121	NC_011294	CTGCC	2	10	152968	152977	0 %	20 %	20 %	60 %	207855644
122	NC_011294	CGGCG	2	10	155698	155707	0 %	0 %	60 %	40 %	207855647
123	NC_011294	CGCGG	2	10	158348	158357	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_011294	CCGGC	2	10	159052	159061	0 %	0 %	40 %	60 %	207855650
125	NC_011294	CGCTG	2	10	159944	159953	0 %	20 %	40 %	40 %	207855650
126	NC_011294	GATCA	2	10	164094	164103	40 %	20 %	20 %	20 %	207855654
127	NC_011294	CGTCA	2	10	164840	164849	20 %	20 %	20 %	40 %	207855655
128	NC_011294	ATCCC	2	10	166540	166549	20 %	20 %	0 %	60 %	207855657
129	NC_011294	AGCGC	2	10	167248	167257	20 %	0 %	40 %	40 %	207855657
130	NC_011294	TGAGC	2	10	169097	169106	20 %	20 %	40 %	20 %	207855658
131	NC_011294	CGCAT	2	10	169359	169368	20 %	20 %	20 %	40 %	207855659
132	NC_011294	CGAAC	2	10	170088	170097	40 %	0 %	20 %	40 %	207855660
133	NC_011294	GTTCA	2	10	170354	170363	20 %	40 %	20 %	20 %	207855660
134	NC_011294	ATGAC	2	10	171320	171329	40 %	20 %	20 %	20 %	207855661
135	NC_011294	CTGGA	2	10	171910	171919	20 %	20 %	40 %	20 %	207855662
136	NC_011294	CAGAA	2	10	174029	174038	60 %	0 %	20 %	20 %	207855664
137	NC_011294	CGAAG	2	10	176900	176909	40 %	0 %	40 %	20 %	207855666
138	NC_011294	GACTG	2	10	178701	178710	20 %	20 %	40 %	20 %	207855667
139	NC_011294	AGCAA	2	10	179113	179122	60 %	0 %	20 %	20 %	207855667
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142	NC_011294	CGTTT	2	10	185112	185121	0 %	60 %	20 %	20 %	207855671
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151	NC_011294	GCCGC	2	10	198373	198382	0 %	0 %	40 %	60 %	207855684
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264	NC_011294	GACTG	2	10	361110	361119	20 %	20 %	40 %	20 %	207855820
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266	NC_011294	ATCGG	2	10	365674	365683	20 %	20 %	40 %	20 %	207855824
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282	NC_011294	CCCGT	2	10	387674	387683	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
283	NC_011294	CGTTT	2	10	388001	388010	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_011294	GCTAC	2	10	389103	389112	20 %	20 %	20 %	40 %	207855842
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287	NC_011294	ATTAC	2	10	393183	393192	40 %	40 %	0 %	20 %	207855846
288	NC_011294	CTCTT	2	10	394758	394767	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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291	NC_011294	CTTTG	2	10	397231	397240	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_011294	CGCGC	2	10	397315	397324	0 %	0 %	40 %	60 %	207855850
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