MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 59606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011294	CGG	2	6	118	123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
2	NC_011294	TGG	2	6	240	245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855517
3	NC_011294	GAT	2	6	247	252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855517
4	NC_011294	CGG	2	6	265	270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
5	NC_011294	CTG	2	6	428	433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
6	NC_011294	CGC	2	6	457	462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
7	NC_011294	CGC	2	6	622	627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
8	NC_011294	CCG	2	6	672	677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
9	NC_011294	TGG	2	6	696	701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855517
10	NC_011294	CCG	3	9	729	737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
11	NC_011294	GCC	2	6	743	748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
12	NC_011294	CTG	2	6	763	768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
13	NC_011294	GCT	2	6	832	837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
14	NC_011294	TTC	2	6	891	896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855517
15	NC_011294	CGA	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855517
16	NC_011294	AAC	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855517
17	NC_011294	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855517
18	NC_011294	GGC	2	6	1093	1098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
19	NC_011294	CGC	2	6	1108	1113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
20	NC_011294	GGT	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855517
21	NC_011294	TCC	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	207855517
22	NC_011294	CCG	2	6	1210	1215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
23	NC_011294	GCT	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
24	NC_011294	TGT	2	6	1300	1305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855517
25	NC_011294	TTC	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855517
26	NC_011294	TCT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855517
27	NC_011294	TGG	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855517
28	NC_011294	ACG	2	6	1434	1439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855517
29	NC_011294	CCA	2	6	1443	1448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855517
30	NC_011294	CGG	2	6	1519	1524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
31	NC_011294	CGG	2	6	1528	1533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
32	NC_011294	GAA	2	6	1573	1578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855517
33	NC_011294	GCG	2	6	1602	1607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
34	NC_011294	ATC	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855517
35	NC_011294	TTG	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855517
36	NC_011294	TCG	2	6	1850	1855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
37	NC_011294	ACT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855517
38	NC_011294	CGC	3	9	1882	1890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
39	NC_011294	CTG	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
40	NC_011294	TGA	2	6	1978	1983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855517
41	NC_011294	GAC	2	6	2276	2281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855517
42	NC_011294	GCC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855517
43	NC_011294	TGA	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855517
44	NC_011294	TAT	2	6	2450	2455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855517
45	NC_011294	TGC	2	6	2472	2477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855517
46	NC_011294	ATG	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855517
47	NC_011294	CGG	3	9	2505	2513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855517
48	NC_011294	AGC	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855518
49	NC_011294	GCC	2	6	2732	2737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855518
50	NC_011294	CGT	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855518
51	NC_011294	CGC	2	6	2876	2881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855518
52	NC_011294	GCA	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855518
53	NC_011294	TGA	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855518
54	NC_011294	GAA	2	6	3030	3035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855518
55	NC_011294	ATT	2	6	3042	3047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855518
56	NC_011294	CAG	2	6	3051	3056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855518
57	NC_011294	TGA	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855518
58	NC_011294	GCC	2	6	3228	3233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855518
59	NC_011294	TGA	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855518
60	NC_011294	CGG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855518
61	NC_011294	AGT	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855518
62	NC_011294	CAG	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855519
63	NC_011294	TGA	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855519
64	NC_011294	GCA	2	6	3701	3706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855519
65	NC_011294	CGG	2	6	3824	3829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855519
66	NC_011294	GCG	2	6	3862	3867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855519
67	NC_011294	GTC	2	6	3954	3959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855519
68	NC_011294	GGC	2	6	4017	4022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855519
69	NC_011294	TGA	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855519
70	NC_011294	GAA	2	6	4095	4100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855519
71	NC_011294	GCC	2	6	4147	4152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855519
72	NC_011294	CTA	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855519
73	NC_011294	CTG	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855519
74	NC_011294	CGC	2	6	4307	4312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855519
75	NC_011294	GGA	2	6	4433	4438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855519
76	NC_011294	CCG	2	6	4445	4450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855519
77	NC_011294	GCG	2	6	4482	4487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855519
78	NC_011294	ACA	2	6	4505	4510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855519
79	NC_011294	GCG	2	6	4557	4562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855519
80	NC_011294	GCT	2	6	4718	4723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855519
81	NC_011294	CAT	2	6	4728	4733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855519
82	NC_011294	GCC	2	6	4749	4754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855519
83	NC_011294	TGA	3	9	4765	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855519
84	NC_011294	TCA	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855520
85	NC_011294	AAT	2	6	4992	4997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855520
86	NC_011294	TCA	2	6	5006	5011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855520
87	NC_011294	ACC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855520
88	NC_011294	TCA	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855520
89	NC_011294	TTC	2	6	5104	5109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855520
90	NC_011294	CAC	3	9	5148	5156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855520
91	NC_011294	TGT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855520
92	NC_011294	CGT	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855520
93	NC_011294	GCG	2	6	5519	5524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855520
94	NC_011294	GCT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855520
95	NC_011294	ACC	2	6	5860	5865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855521
96	NC_011294	CAA	2	6	5874	5879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855521
97	NC_011294	TGA	2	6	5951	5956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855521
98	NC_011294	CGA	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855521
99	NC_011294	CAG	2	6	6201	6206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855521
100	NC_011294	ATC	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855521
101	NC_011294	GAT	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855521
102	NC_011294	ACG	2	6	6299	6304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855521
103	NC_011294	GAT	2	6	6528	6533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855521
104	NC_011294	GCG	2	6	6626	6631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855521
105	NC_011294	CGA	2	6	6704	6709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855521
106	NC_011294	GCC	2	6	6777	6782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855521
107	NC_011294	AGG	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855521
108	NC_011294	ATG	2	6	6859	6864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855521
109	NC_011294	GCG	2	6	6904	6909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855521
110	NC_011294	GCC	2	6	6990	6995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855521
111	NC_011294	AGC	2	6	7096	7101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855521
112	NC_011294	TAA	2	6	7136	7141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855521
113	NC_011294	CAC	2	6	7461	7466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855522
114	NC_011294	AGC	2	6	7607	7612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855522
115	NC_011294	AGC	2	6	7615	7620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855522
116	NC_011294	CAG	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855522
117	NC_011294	GTT	2	6	7636	7641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855522
118	NC_011294	ATG	2	6	7787	7792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855522
119	NC_011294	AAG	2	6	7871	7876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855522
120	NC_011294	GCT	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855522
121	NC_011294	TAC	2	6	8062	8067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855522
122	NC_011294	CGT	2	6	8088	8093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855522
123	NC_011294	GCA	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855522
124	NC_011294	CTG	2	6	8374	8379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855522
125	NC_011294	GCG	2	6	8542	8547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855523
126	NC_011294	GAG	2	6	8577	8582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855523
127	NC_011294	GCG	2	6	8621	8626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855523
128	NC_011294	TGA	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855523
129	NC_011294	TGA	2	6	8678	8683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855523
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254	NC_011294	ACT	2	6	17675	17680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855533
255	NC_011294	CAA	2	6	17706	17711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855533
256	NC_011294	GAT	2	6	17714	17719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855533
257	NC_011294	TTA	2	6	17803	17808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855533
258	NC_011294	TTG	2	6	17922	17927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855533
259	NC_011294	AGA	2	6	17956	17961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855533
260	NC_011294	CTG	2	6	18125	18130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855533
261	NC_011294	CGG	2	6	18199	18204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855533
262	NC_011294	CCG	2	6	18234	18239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855533
263	NC_011294	GTG	2	6	18275	18280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855533
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266	NC_011294	ACT	2	6	18473	18478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855533
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278	NC_011294	TTC	2	6	19243	19248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855533
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282	NC_011294	GAT	2	6	19535	19540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855533
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