MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae 342 chromosome

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011283	TAAGCG	2	12	35033	35044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011283	GTTATT	2	12	60620	60631	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011283	AGGGAG	2	12	84829	84840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011283	CAGGAA	2	12	124230	124241	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011283	TTTTTA	2	12	193240	193251	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011283	AAAGAT	2	12	208185	208196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011283	AATAAA	2	12	215010	215021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011283	AGCCAC	2	12	256918	256929	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011283	CGCAGG	2	12	292842	292853	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011283	GAATGA	2	12	336165	336176	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011283	GGTCCG	2	12	441592	441603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011283	GAAAGG	2	12	444877	444888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011283	AAAAAT	2	12	448239	448250	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011283	CTTTTG	2	12	459811	459822	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011283	CAAAAA	2	12	465132	465143	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011283	GGCAGC	2	12	500597	500608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011283	GCACAG	2	12	518633	518644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011283	AATTTA	2	12	555438	555449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011283	GCAAAC	2	12	578023	578034	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011283	AGAGGG	2	12	616928	616939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011283	ATCATT	2	12	628038	628049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011283	GAAAAG	2	12	655689	655700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011283	TACAAC	2	12	660410	660421	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011283	CGGACT	2	12	721715	721726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011283	CGGACT	2	12	721878	721889	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011283	AGATAC	2	12	755547	755558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011283	TAGCAA	2	12	845380	845391	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011283	GATCGC	2	12	857127	857138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011283	GTTAAC	2	12	857150	857161	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011283	CGGTAC	2	12	958096	958107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011283	CGCTTA	2	12	1007107	1007118	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011283	GTCGAT	2	12	1079141	1079152	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011283	CACTGA	2	12	1111693	1111704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011283	GCGCTG	2	12	1155250	1155261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011283	CGATAA	2	12	1160638	1160649	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011283	GGCTGC	2	12	1171176	1171187	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011283	GTACGG	2	12	1316913	1316924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011283	GTGGCT	2	12	1378761	1378772	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011283	TCTCCC	2	12	1390734	1390745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011283	AATCAT	2	12	1398057	1398068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011283	GTTTTT	2	12	1413361	1413372	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011283	TTTTCT	2	12	1465178	1465189	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011283	TTAATG	2	12	1488886	1488897	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011283	GGATTG	2	12	1500976	1500987	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011283	TGTCGC	2	12	1555750	1555761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011283	ACGAGA	2	12	1581371	1581382	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011283	CGCGCC	2	12	1587606	1587617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011283	ACTTTC	2	12	1603973	1603984	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011283	CTCATT	2	12	1697631	1697642	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011283	TCCCTC	2	12	1748718	1748729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011283	TCCCTC	2	12	1749164	1749175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011283	TCCCTC	2	12	1749610	1749621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011283	TCCCTC	2	12	1750056	1750067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011283	AGGGAG	2	12	1764980	1764991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011283	GCAGCC	2	12	1774682	1774693	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011283	CGAATC	2	12	1782183	1782194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011283	GGCCCT	2	12	1800736	1800747	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011283	GATACC	2	12	1805847	1805858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011283	GCGACG	2	12	1812029	1812040	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011283	ACTTCC	2	12	1831863	1831874	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011283	TTTCTG	2	12	1832111	1832122	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011283	GCAGCG	2	12	1881207	1881218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011283	TGCGGG	2	12	1906751	1906762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011283	TAAAAA	2	12	2008477	2008488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011283	CGGGCG	2	12	2056489	2056500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011283	ATTTGC	2	12	2073811	2073822	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011283	AGGCAG	2	12	2103532	2103543	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011283	TTATAA	2	12	2141099	2141110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011283	TTATTT	2	12	2250282	2250293	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011283	GGAAGG	2	12	2287919	2287930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011283	GGAAGG	2	12	2288054	2288065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011283	CGGCAG	2	12	2308529	2308540	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011283	ATGACG	2	12	2310911	2310922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011283	CTTACA	2	12	2337338	2337349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011283	AAAGGG	2	12	2380712	2380723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011283	GCGCTG	2	12	2430138	2430149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011283	CTTTTT	2	12	2431551	2431562	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011283	AACATA	2	12	2464945	2464956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011283	GTGAGC	2	12	2488741	2488752	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011283	AATGAC	2	12	2578294	2578305	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011283	GAGGGT	2	12	2609125	2609136	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011283	CCTGAA	2	12	2780253	2780264	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011283	GACACT	2	12	2877288	2877299	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011283	ATAAAG	2	12	2880100	2880111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011283	GCCGAC	2	12	2881515	2881526	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011283	TTGTGC	2	12	2906970	2906981	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011283	ATCCTG	2	12	2932217	2932228	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011283	TGGTTT	2	12	2956180	2956191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011283	AGGGAG	2	12	3034199	3034210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011283	CCGCCT	2	12	3083944	3083955	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011283	GCTGCG	2	12	3086593	3086604	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011283	AAGAGC	2	12	3093084	3093095	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011283	CCAAAC	2	12	3191983	3191994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011283	CCCTGC	2	12	3259337	3259348	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_011283	CTTTCC	2	12	3261731	3261742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011283	TCCCTC	2	12	3292677	3292688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011283	CCTTGC	2	12	3297801	3297812	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011283	CCCCTC	2	12	3299035	3299046	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
99	NC_011283	CCTCAA	2	12	3350041	3350052	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011283	AAGCGT	2	12	3388715	3388726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011283	TGGCAA	2	12	3389260	3389271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011283	GAACCA	2	12	3394740	3394751	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011283	CAAGAT	2	12	3414196	3414207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_011283	GCTGGT	2	12	3420715	3420726	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_011283	GCTTTA	2	12	3508730	3508741	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011283	AGGTGA	2	12	3589932	3589943	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011283	GGAGAT	2	12	3700210	3700221	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011283	CACGTC	2	12	3725040	3725051	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011283	TTAATC	2	12	3773677	3773688	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011283	TCCCTC	2	12	3802988	3802999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011283	CATCGG	2	12	3816544	3816555	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011283	GCTGGC	2	12	3816739	3816750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011283	ATTTTC	2	12	3847781	3847792	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_011283	TAAAAA	2	12	3854173	3854184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011283	AAGCGC	2	12	3882493	3882504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011283	TGAGCA	2	12	3929457	3929468	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011283	TTATCA	2	12	3949237	3949248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_011283	GCCCGG	2	12	3995257	3995268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011283	AGGGAG	2	12	3997671	3997682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011283	AGGGAG	2	12	3997753	3997764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011283	CGATAA	2	12	4016473	4016484	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_011283	TATCAT	2	12	4016489	4016500	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_011283	ATTTGC	2	12	4024776	4024787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011283	CATCCG	2	12	4060387	4060398	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011283	TCTCCC	2	12	4089510	4089521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011283	CCAGTA	2	12	4092937	4092948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011283	TCTCCC	2	12	4117909	4117920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_011283	GCAAAC	2	12	4157900	4157911	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.