MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae 342 plasmid pKP187

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011282	ATTCAT	2	12	535	546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	206575669
2	NC_011282	TAAAGG	2	12	4715	4726	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	206575604
3	NC_011282	CAGTAC	2	12	15030	15041	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	206575644
4	NC_011282	GGCGGG	2	12	17086	17097	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	206575607
5	NC_011282	AAGTGA	2	12	22365	22376	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	206575690
6	NC_011282	GCTGAC	2	12	23617	23628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206575617
7	NC_011282	GAAAGC	2	12	33863	33874	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	206575557
8	NC_011282	ATAAAG	2	12	37590	37601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	206575565
9	NC_011282	CCCATG	2	12	38468	38479	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	206575671
10	NC_011282	TCTCCT	2	12	45048	45059	0 %	50 %	0 %	50 %	206575528
11	NC_011282	AGACAA	2	12	45175	45186	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	206575528
12	NC_011282	TATTCA	2	12	59666	59677	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	206575569
13	NC_011282	GTCTTG	2	12	61392	61403	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	206575645
14	NC_011282	GCTCAG	2	12	63143	63154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206575653
15	NC_011282	GGATCG	2	12	63462	63473	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	206575653
16	NC_011282	GCAGGC	2	12	63871	63882	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	206575653
17	NC_011282	GGTTAG	2	12	64322	64333	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	206575653
18	NC_011282	ACGATG	2	12	64692	64703	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	206575653
19	NC_011282	ACCAGC	2	12	65409	65420	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	206575653
20	NC_011282	TCAGCA	2	12	69402	69413	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	206575614
21	NC_011282	CTGCGG	2	12	85490	85501	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	206575648
22	NC_011282	GCATAG	2	12	88126	88137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	206575548
23	NC_011282	AACAAA	2	12	104573	104584	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	206575579
24	NC_011282	TCACCT	2	12	106741	106752	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	206575506
25	NC_011282	TGATAT	2	12	114056	114067	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	206575682
26	NC_011282	AATAAA	2	12	114327	114338	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	206575682
27	NC_011282	TTGCTT	2	12	117710	117721	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	206575592
28	NC_011282	ATTGAT	2	12	118537	118548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	206575541
29	NC_011282	CAATAA	2	12	122223	122234	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	206575681
30	NC_011282	AACTGA	2	12	126181	126192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	206575526
31	NC_011282	GTTCAG	2	12	137571	137582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206575680
32	NC_011282	GACTGG	2	12	149957	149968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	206575637
33	NC_011282	GGAAAA	2	12	151432	151443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206575618
34	NC_011282	CCCCTG	2	12	153049	153060	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	206575532
35	NC_011282	TTCAGG	2	12	153227	153238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206575532
36	NC_011282	TCAATT	2	12	159529	159540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	206575582
37	NC_011282	CCACCG	2	12	161241	161252	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	206575542
38	NC_011282	GATGCC	2	12	163867	163878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206575670
39	NC_011282	TTGATG	2	12	164735	164746	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	206575549
40	NC_011282	CTTCAT	2	12	166549	166560	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	206575498
41	NC_011282	TTAGTT	2	12	168226	168237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	206575487
42	NC_011282	TTATAT	2	12	170303	170314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206575588
43	NC_011282	CTGGCG	2	12	172480	172491	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	206575587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.