MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae 342 plasmid pKP187

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011282	CCAAG	2	10	12	21	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011282	CTGTG	2	10	1065	1074	0 %	40 %	40 %	20 %	206575669
3	NC_011282	GTCTG	2	10	1884	1893	0 %	40 %	40 %	20 %	206575657
4	NC_011282	TGGGT	2	10	2220	2229	0 %	40 %	60 %	0 %	206575657
5	NC_011282	GGACA	2	10	2713	2722	40 %	0 %	40 %	20 %	206575657
6	NC_011282	CGCTC	2	10	4903	4912	0 %	20 %	20 %	60 %	206575604
7	NC_011282	TTGCA	2	10	6074	6083	20 %	40 %	20 %	20 %	206575507
8	NC_011282	GCAGA	2	10	8386	8395	40 %	0 %	40 %	20 %	206575577
9	NC_011282	ATGAC	2	10	9081	9090	40 %	20 %	20 %	20 %	206575577
10	NC_011282	GCACT	2	10	9141	9150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011282	TATAT	2	10	9959	9968	40 %	60 %	0 %	0 %	206575496
12	NC_011282	ATGTG	2	10	11179	11188	20 %	40 %	40 %	0 %	206575697
13	NC_011282	ATGCG	2	10	11244	11253	20 %	20 %	40 %	20 %	206575697
14	NC_011282	ACTTC	2	10	12909	12918	20 %	40 %	0 %	40 %	206575694
15	NC_011282	ATTGC	2	10	12941	12950	20 %	40 %	20 %	20 %	206575694
16	NC_011282	TGCAG	2	10	13411	13420	20 %	20 %	40 %	20 %	206575574
17	NC_011282	AGGCC	2	10	13666	13675	20 %	0 %	40 %	40 %	206575574
18	NC_011282	GACAA	2	10	14992	15001	60 %	0 %	20 %	20 %	206575644
19	NC_011282	AGGGA	2	10	17765	17774	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011282	ACGCA	2	10	17842	17851	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011282	TAATT	2	10	21930	21939	40 %	60 %	0 %	0 %	206575690
22	NC_011282	TTTCT	2	10	22539	22548	0 %	80 %	0 %	20 %	206575690
23	NC_011282	ACAAA	2	10	22946	22955	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011282	CTTTT	2	10	23399	23408	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011282	TACTG	2	10	26198	26207	20 %	40 %	20 %	20 %	206575634
26	NC_011282	TTTCT	2	10	26344	26353	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011282	ATTTG	2	10	26545	26554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011282	TTTTC	2	10	27776	27785	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011282	TGCAC	2	10	31659	31668	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011282	CTGCA	2	10	33393	33402	20 %	20 %	20 %	40 %	206575710
31	NC_011282	GCCAT	2	10	36662	36671	20 %	20 %	20 %	40 %	206575497
32	NC_011282	CGGAT	2	10	38949	38958	20 %	20 %	40 %	20 %	206575671
33	NC_011282	ATCCC	2	10	42895	42904	20 %	20 %	0 %	60 %	206575675
34	NC_011282	AAACG	2	10	43786	43795	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011282	TCCAG	2	10	44290	44299	20 %	20 %	20 %	40 %	206575573
36	NC_011282	TTAGC	2	10	45400	45409	20 %	40 %	20 %	20 %	206575686
37	NC_011282	TCAGG	2	10	46865	46874	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011282	GCCAT	2	10	47359	47368	20 %	20 %	20 %	40 %	206575672
39	NC_011282	AAAAG	3	15	49321	49335	80 %	0 %	20 %	0 %	206575536
40	NC_011282	ATGAA	2	10	49370	49379	60 %	20 %	20 %	0 %	206575536
41	NC_011282	ATTTA	2	10	50660	50669	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011282	CAAAA	2	10	51468	51477	80 %	0 %	0 %	20 %	206575651
43	NC_011282	CAGCA	2	10	51647	51656	40 %	0 %	20 %	40 %	206575651
44	NC_011282	TGACA	2	10	58470	58479	40 %	20 %	20 %	20 %	206575483
45	NC_011282	TCCGT	2	10	58786	58795	0 %	40 %	20 %	40 %	206575483
46	NC_011282	GCAGA	2	10	59561	59570	40 %	0 %	40 %	20 %	206575569
47	NC_011282	ATGAC	2	10	60256	60265	40 %	20 %	20 %	20 %	206575569
48	NC_011282	GCACT	2	10	60316	60325	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011282	CAACA	2	10	61994	62003	60 %	0 %	0 %	40 %	206575584
50	NC_011282	CAGAA	2	10	62457	62466	60 %	0 %	20 %	20 %	206575584
51	NC_011282	TATTT	2	10	62747	62756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011282	GGGGA	2	10	65529	65538	20 %	0 %	80 %	0 %	206575653
53	NC_011282	TGACC	2	10	66036	66045	20 %	20 %	20 %	40 %	206575570
54	NC_011282	GGCCA	2	10	71449	71458	20 %	0 %	40 %	40 %	206575545
55	NC_011282	TCACC	2	10	72764	72773	20 %	20 %	0 %	60 %	206575547
56	NC_011282	ACCCG	2	10	73633	73642	20 %	0 %	20 %	60 %	206575517
57	NC_011282	CCATC	2	10	73767	73776	20 %	20 %	0 %	60 %	206575517
58	NC_011282	CTGAC	2	10	75571	75580	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_011282	TGTGC	2	10	75753	75762	0 %	40 %	40 %	20 %	206575589
60	NC_011282	GGAGA	2	10	78305	78314	40 %	0 %	60 %	0 %	206575676
61	NC_011282	CATGA	2	10	79313	79322	40 %	20 %	20 %	20 %	206575711
62	NC_011282	ACCTT	2	10	79919	79928	20 %	40 %	0 %	40 %	206575711
63	NC_011282	CCGGC	2	10	80810	80819	0 %	0 %	40 %	60 %	206575572
64	NC_011282	ATGGA	2	10	84101	84110	40 %	20 %	40 %	0 %	206575685
65	NC_011282	TACAC	2	10	84619	84628	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_011282	TTACG	2	10	85275	85284	20 %	40 %	20 %	20 %	206575699
67	NC_011282	TCAGA	2	10	88082	88091	40 %	20 %	20 %	20 %	206575548
68	NC_011282	TAAAT	2	10	88273	88282	60 %	40 %	0 %	0 %	206575548
69	NC_011282	GTAAA	2	10	90461	90470	60 %	20 %	20 %	0 %	206575633
70	NC_011282	AGAAA	2	10	93544	93553	80 %	0 %	20 %	0 %	206575687
71	NC_011282	AATTA	2	10	97851	97860	60 %	40 %	0 %	0 %	206575539
72	NC_011282	ATTCC	2	10	101146	101155	20 %	40 %	0 %	40 %	206575492
73	NC_011282	TTATT	2	10	102023	102032	20 %	80 %	0 %	0 %	206575659
74	NC_011282	CCTGC	2	10	102094	102103	0 %	20 %	20 %	60 %	206575659
75	NC_011282	TCATT	2	10	106775	106784	20 %	60 %	0 %	20 %	206575506
76	NC_011282	GTTGA	2	10	109413	109422	20 %	40 %	40 %	0 %	206575578
77	NC_011282	AACAC	2	10	109474	109483	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011282	CTTTC	2	10	110125	110134	0 %	60 %	0 %	40 %	206575639
79	NC_011282	CGGGG	2	10	111069	111078	0 %	0 %	80 %	20 %	206575551
80	NC_011282	CCTGT	2	10	111728	111737	0 %	40 %	20 %	40 %	206575552
81	NC_011282	ATTTC	2	10	111760	111769	20 %	60 %	0 %	20 %	206575552
82	NC_011282	GGGAC	2	10	111771	111780	20 %	0 %	60 %	20 %	206575552
83	NC_011282	GCATG	2	10	111908	111917	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011282	AGTCC	2	10	112591	112600	20 %	20 %	20 %	40 %	206575658
85	NC_011282	CAGAA	2	10	118993	119002	60 %	0 %	20 %	20 %	206575541
86	NC_011282	GGAAA	2	10	119117	119126	60 %	0 %	40 %	0 %	206575541
87	NC_011282	CGCGG	2	10	119513	119522	0 %	0 %	60 %	40 %	206575707
88	NC_011282	GGACG	2	10	119853	119862	20 %	0 %	60 %	20 %	206575597
89	NC_011282	TTTCG	2	10	121510	121519	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011282	TCGTC	2	10	122502	122511	0 %	40 %	20 %	40 %	206575681
91	NC_011282	TTTAT	2	10	123512	123521	20 %	80 %	0 %	0 %	206575681
92	NC_011282	TGAGT	2	10	123801	123810	20 %	40 %	40 %	0 %	206575681
93	NC_011282	CCGGA	2	10	124424	124433	20 %	0 %	40 %	40 %	206575484
94	NC_011282	GGAAT	2	10	125043	125052	40 %	20 %	40 %	0 %	206575647
95	NC_011282	AACCA	2	10	125751	125760	60 %	0 %	0 %	40 %	206575638
96	NC_011282	CACAT	2	10	131106	131115	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_011282	TAATG	2	10	132418	132427	40 %	40 %	20 %	0 %	206575537
98	NC_011282	GATCA	2	10	132990	132999	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011282	GCAAA	2	10	133032	133041	60 %	0 %	20 %	20 %	206575519
100	NC_011282	ATTAA	2	10	134268	134277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011282	CTCAA	2	10	135032	135041	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011282	TTTCA	2	10	136585	136594	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011282	AACGT	2	10	140395	140404	40 %	20 %	20 %	20 %	206575626
104	NC_011282	TGGCT	2	10	141877	141886	0 %	40 %	40 %	20 %	206575566
105	NC_011282	CCGCG	2	10	142177	142186	0 %	0 %	40 %	60 %	206575566
106	NC_011282	CTGGG	2	10	146331	146340	0 %	20 %	60 %	20 %	206575516
107	NC_011282	GGTTT	2	10	146474	146483	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011282	CCCAG	2	10	146982	146991	20 %	0 %	20 %	60 %	206575601
109	NC_011282	ATCAT	2	10	151112	151121	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_011282	TATTT	2	10	151231	151240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011282	ATATT	2	10	158525	158534	40 %	60 %	0 %	0 %	206575505
112	NC_011282	CAAAA	2	10	158637	158646	80 %	0 %	0 %	20 %	206575505
113	NC_011282	TGCAT	2	10	158778	158787	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011282	CGGCG	2	10	160886	160895	0 %	0 %	60 %	40 %	206575542
115	NC_011282	TAAAG	2	10	163686	163695	60 %	20 %	20 %	0 %	206575670
116	NC_011282	GCATG	2	10	165418	165427	20 %	20 %	40 %	20 %	206575549
117	NC_011282	GTTCA	2	10	166097	166106	20 %	40 %	20 %	20 %	206575498
118	NC_011282	TTTGC	2	10	168570	168579	0 %	60 %	20 %	20 %	206575487
119	NC_011282	TAGTA	2	10	170380	170389	40 %	40 %	20 %	0 %	206575588
120	NC_011282	TATCG	2	10	172963	172972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011282	CTTTC	2	10	173604	173613	0 %	60 %	0 %	40 %	206575662
122	NC_011282	TGAGC	2	10	178756	178765	20 %	20 %	40 %	20 %	206575561
123	NC_011282	TCCAG	2	10	183682	183691	20 %	20 %	20 %	40 %	206575691
124	NC_011282	TCGGT	2	10	185740	185749	0 %	40 %	40 %	20 %	206575600
125	NC_011282	CAGCA	2	10	186192	186201	40 %	0 %	20 %	40 %	206575562

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.