MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae 342 plasmid pKP187

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011282	CTGTG	2	10	1065	1074	0 %	40 %	40 %	20 %	206575669
2	NC_011282	GTCTG	2	10	1884	1893	0 %	40 %	40 %	20 %	206575657
3	NC_011282	TGGGT	2	10	2220	2229	0 %	40 %	60 %	0 %	206575657
4	NC_011282	GGACA	2	10	2713	2722	40 %	0 %	40 %	20 %	206575657
5	NC_011282	CGCTC	2	10	4903	4912	0 %	20 %	20 %	60 %	206575604
6	NC_011282	TTGCA	2	10	6074	6083	20 %	40 %	20 %	20 %	206575507
7	NC_011282	GCAGA	2	10	8386	8395	40 %	0 %	40 %	20 %	206575577
8	NC_011282	ATGAC	2	10	9081	9090	40 %	20 %	20 %	20 %	206575577
9	NC_011282	TATAT	2	10	9959	9968	40 %	60 %	0 %	0 %	206575496
10	NC_011282	ATGTG	2	10	11179	11188	20 %	40 %	40 %	0 %	206575697
11	NC_011282	ATGCG	2	10	11244	11253	20 %	20 %	40 %	20 %	206575697
12	NC_011282	ACTTC	2	10	12909	12918	20 %	40 %	0 %	40 %	206575694
13	NC_011282	ATTGC	2	10	12941	12950	20 %	40 %	20 %	20 %	206575694
14	NC_011282	TGCAG	2	10	13411	13420	20 %	20 %	40 %	20 %	206575574
15	NC_011282	AGGCC	2	10	13666	13675	20 %	0 %	40 %	40 %	206575574
16	NC_011282	GACAA	2	10	14992	15001	60 %	0 %	20 %	20 %	206575644
17	NC_011282	TAATT	2	10	21930	21939	40 %	60 %	0 %	0 %	206575690
18	NC_011282	TTTCT	2	10	22539	22548	0 %	80 %	0 %	20 %	206575690
19	NC_011282	TACTG	2	10	26198	26207	20 %	40 %	20 %	20 %	206575634
20	NC_011282	CTGCA	2	10	33393	33402	20 %	20 %	20 %	40 %	206575710
21	NC_011282	GCCAT	2	10	36662	36671	20 %	20 %	20 %	40 %	206575497
22	NC_011282	CGGAT	2	10	38949	38958	20 %	20 %	40 %	20 %	206575671
23	NC_011282	ATCCC	2	10	42895	42904	20 %	20 %	0 %	60 %	206575675
24	NC_011282	TCCAG	2	10	44290	44299	20 %	20 %	20 %	40 %	206575573
25	NC_011282	TTAGC	2	10	45400	45409	20 %	40 %	20 %	20 %	206575686
26	NC_011282	GCCAT	2	10	47359	47368	20 %	20 %	20 %	40 %	206575672
27	NC_011282	AAAAG	3	15	49321	49335	80 %	0 %	20 %	0 %	206575536
28	NC_011282	ATGAA	2	10	49370	49379	60 %	20 %	20 %	0 %	206575536
29	NC_011282	CAAAA	2	10	51468	51477	80 %	0 %	0 %	20 %	206575651
30	NC_011282	CAGCA	2	10	51647	51656	40 %	0 %	20 %	40 %	206575651
31	NC_011282	TGACA	2	10	58470	58479	40 %	20 %	20 %	20 %	206575483
32	NC_011282	TCCGT	2	10	58786	58795	0 %	40 %	20 %	40 %	206575483
33	NC_011282	GCAGA	2	10	59561	59570	40 %	0 %	40 %	20 %	206575569
34	NC_011282	ATGAC	2	10	60256	60265	40 %	20 %	20 %	20 %	206575569
35	NC_011282	CAACA	2	10	61994	62003	60 %	0 %	0 %	40 %	206575584
36	NC_011282	CAGAA	2	10	62457	62466	60 %	0 %	20 %	20 %	206575584
37	NC_011282	GGGGA	2	10	65529	65538	20 %	0 %	80 %	0 %	206575653
38	NC_011282	TGACC	2	10	66036	66045	20 %	20 %	20 %	40 %	206575570
39	NC_011282	GGCCA	2	10	71449	71458	20 %	0 %	40 %	40 %	206575545
40	NC_011282	TCACC	2	10	72764	72773	20 %	20 %	0 %	60 %	206575547
41	NC_011282	ACCCG	2	10	73633	73642	20 %	0 %	20 %	60 %	206575517
42	NC_011282	CCATC	2	10	73767	73776	20 %	20 %	0 %	60 %	206575517
43	NC_011282	TGTGC	2	10	75753	75762	0 %	40 %	40 %	20 %	206575589
44	NC_011282	GGAGA	2	10	78305	78314	40 %	0 %	60 %	0 %	206575676
45	NC_011282	CATGA	2	10	79313	79322	40 %	20 %	20 %	20 %	206575711
46	NC_011282	ACCTT	2	10	79919	79928	20 %	40 %	0 %	40 %	206575711
47	NC_011282	CCGGC	2	10	80810	80819	0 %	0 %	40 %	60 %	206575572
48	NC_011282	ATGGA	2	10	84101	84110	40 %	20 %	40 %	0 %	206575685
49	NC_011282	TTACG	2	10	85275	85284	20 %	40 %	20 %	20 %	206575699
50	NC_011282	TCAGA	2	10	88082	88091	40 %	20 %	20 %	20 %	206575548
51	NC_011282	TAAAT	2	10	88273	88282	60 %	40 %	0 %	0 %	206575548
52	NC_011282	GTAAA	2	10	90461	90470	60 %	20 %	20 %	0 %	206575633
53	NC_011282	AGAAA	2	10	93544	93553	80 %	0 %	20 %	0 %	206575687
54	NC_011282	AATTA	2	10	97851	97860	60 %	40 %	0 %	0 %	206575539
55	NC_011282	ATTCC	2	10	101146	101155	20 %	40 %	0 %	40 %	206575492
56	NC_011282	TTATT	2	10	102023	102032	20 %	80 %	0 %	0 %	206575659
57	NC_011282	CCTGC	2	10	102094	102103	0 %	20 %	20 %	60 %	206575659
58	NC_011282	TCATT	2	10	106775	106784	20 %	60 %	0 %	20 %	206575506
59	NC_011282	GTTGA	2	10	109413	109422	20 %	40 %	40 %	0 %	206575578
60	NC_011282	CTTTC	2	10	110125	110134	0 %	60 %	0 %	40 %	206575639
61	NC_011282	CGGGG	2	10	111069	111078	0 %	0 %	80 %	20 %	206575551
62	NC_011282	CCTGT	2	10	111728	111737	0 %	40 %	20 %	40 %	206575552
63	NC_011282	ATTTC	2	10	111760	111769	20 %	60 %	0 %	20 %	206575552
64	NC_011282	GGGAC	2	10	111771	111780	20 %	0 %	60 %	20 %	206575552
65	NC_011282	AGTCC	2	10	112591	112600	20 %	20 %	20 %	40 %	206575658
66	NC_011282	CAGAA	2	10	118993	119002	60 %	0 %	20 %	20 %	206575541
67	NC_011282	GGAAA	2	10	119117	119126	60 %	0 %	40 %	0 %	206575541
68	NC_011282	CGCGG	2	10	119513	119522	0 %	0 %	60 %	40 %	206575707
69	NC_011282	GGACG	2	10	119853	119862	20 %	0 %	60 %	20 %	206575597
70	NC_011282	TCGTC	2	10	122502	122511	0 %	40 %	20 %	40 %	206575681
71	NC_011282	TTTAT	2	10	123512	123521	20 %	80 %	0 %	0 %	206575681
72	NC_011282	TGAGT	2	10	123801	123810	20 %	40 %	40 %	0 %	206575681
73	NC_011282	CCGGA	2	10	124424	124433	20 %	0 %	40 %	40 %	206575484
74	NC_011282	GGAAT	2	10	125043	125052	40 %	20 %	40 %	0 %	206575647
75	NC_011282	AACCA	2	10	125751	125760	60 %	0 %	0 %	40 %	206575638
76	NC_011282	TAATG	2	10	132418	132427	40 %	40 %	20 %	0 %	206575537
77	NC_011282	GCAAA	2	10	133032	133041	60 %	0 %	20 %	20 %	206575519
78	NC_011282	AACGT	2	10	140395	140404	40 %	20 %	20 %	20 %	206575626
79	NC_011282	TGGCT	2	10	141877	141886	0 %	40 %	40 %	20 %	206575566
80	NC_011282	CCGCG	2	10	142177	142186	0 %	0 %	40 %	60 %	206575566
81	NC_011282	CTGGG	2	10	146331	146340	0 %	20 %	60 %	20 %	206575516
82	NC_011282	CCCAG	2	10	146982	146991	20 %	0 %	20 %	60 %	206575601
83	NC_011282	ATATT	2	10	158525	158534	40 %	60 %	0 %	0 %	206575505
84	NC_011282	CAAAA	2	10	158637	158646	80 %	0 %	0 %	20 %	206575505
85	NC_011282	CGGCG	2	10	160886	160895	0 %	0 %	60 %	40 %	206575542
86	NC_011282	TAAAG	2	10	163686	163695	60 %	20 %	20 %	0 %	206575670
87	NC_011282	GCATG	2	10	165418	165427	20 %	20 %	40 %	20 %	206575549
88	NC_011282	GTTCA	2	10	166097	166106	20 %	40 %	20 %	20 %	206575498
89	NC_011282	TTTGC	2	10	168570	168579	0 %	60 %	20 %	20 %	206575487
90	NC_011282	TAGTA	2	10	170380	170389	40 %	40 %	20 %	0 %	206575588
91	NC_011282	CTTTC	2	10	173604	173613	0 %	60 %	0 %	40 %	206575662
92	NC_011282	TGAGC	2	10	178756	178765	20 %	20 %	40 %	20 %	206575561
93	NC_011282	TCCAG	2	10	183682	183691	20 %	20 %	20 %	40 %	206575691
94	NC_011282	TCGGT	2	10	185740	185749	0 %	40 %	40 %	20 %	206575600
95	NC_011282	CAGCA	2	10	186192	186201	40 %	0 %	20 %	40 %	206575562

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.