MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae 342 plasmid pKP187

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011282	CTAT	2	8	131	138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011282	AAGG	2	8	3408	3415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011282	CAGT	2	8	5836	5843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011282	GCAG	2	8	7634	7641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011282	CTGC	2	8	7680	7687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011282	TCTT	2	8	8004	8011	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011282	GTAT	2	8	14880	14887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011282	TGAA	2	8	16224	16231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011282	CGGC	2	8	16656	16663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011282	AGTC	2	8	16711	16718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011282	GTAT	2	8	19028	19035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011282	TATG	2	8	21662	21669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011282	AAAG	2	8	21695	21702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011282	ATGA	2	8	22864	22871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011282	TGAA	2	8	22961	22968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011282	AATA	2	8	23007	23014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011282	TAAG	2	8	24944	24951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011282	ATAC	2	8	26453	26460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011282	GAGT	2	8	27831	27838	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011282	ACTG	2	8	28840	28847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011282	GAAC	2	8	29020	29027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011282	GTAA	2	8	31090	31097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011282	GAAA	2	8	31157	31164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011282	AGAA	2	8	31611	31618	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011282	AACC	2	8	31648	31655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011282	TTCG	2	8	32252	32259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011282	CAAT	2	8	42109	42116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011282	TCTG	2	8	42167	42174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011282	TGGA	2	8	42241	42248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011282	AACT	2	8	45383	45390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011282	CTAC	2	8	48099	48106	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011282	TCCT	2	8	53680	53687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011282	TTGA	2	8	53750	53757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011282	TTGA	2	8	53839	53846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011282	TTGA	2	8	53851	53858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011282	TTGA	2	8	53923	53930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011282	AGCA	2	8	57463	57470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011282	CGGT	2	8	58164	58171	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011282	TCTT	2	8	59179	59186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011282	CATT	2	8	71010	71017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011282	AGCT	2	8	71113	71120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011282	GCCG	2	8	71197	71204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011282	TGCC	2	8	75113	75120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011282	ATCA	2	8	75127	75134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011282	CGAT	2	8	75233	75240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011282	GTTG	2	8	75452	75459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011282	TGCC	2	8	75583	75590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011282	ATTA	2	8	81157	81164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011282	CTGG	2	8	82097	82104	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011282	AGAC	2	8	82375	82382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011282	GTAA	2	8	83039	83046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011282	CTAT	2	8	85978	85985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011282	GATA	2	8	93489	93496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011282	ATGA	2	8	94338	94345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011282	AATT	2	8	96255	96262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011282	TTAA	2	8	96528	96535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011282	CGCT	2	8	100461	100468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011282	TGAC	2	8	101718	101725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011282	AGGG	2	8	101815	101822	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011282	AGGA	2	8	104861	104868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011282	GGCT	2	8	104909	104916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011282	AAAG	2	8	105637	105644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011282	TGTC	2	8	106420	106427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011282	CAGG	2	8	108143	108150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011282	TTGC	2	8	108250	108257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011282	TTTC	2	8	108443	108450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011282	AAAT	2	8	108635	108642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011282	TAAT	2	8	108650	108657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011282	GTTG	2	8	109545	109552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011282	AGGG	2	8	112020	112027	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011282	TAAC	2	8	113132	113139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011282	TCCC	2	8	113204	113211	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_011282	TGTC	2	8	120036	120043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011282	CAGT	2	8	120164	120171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011282	CCTT	2	8	120722	120729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011282	GCTC	2	8	121550	121557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011282	TGTA	2	8	127505	127512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011282	AGCC	2	8	128690	128697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011282	CATC	2	8	128721	128728	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011282	ACAG	2	8	129165	129172	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011282	AACA	2	8	130507	130514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011282	TGGT	2	8	130602	130609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011282	TGGT	2	8	131017	131024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011282	TGCG	2	8	131447	131454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011282	TCAG	2	8	131515	131522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011282	GCCC	2	8	131578	131585	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_011282	TCTA	2	8	132276	132283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011282	ATCT	2	8	132671	132678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011282	ACCA	2	8	132687	132694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011282	CTTA	2	8	134374	134381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011282	AGGA	2	8	137153	137160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011282	ATCA	2	8	140703	140710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011282	ATTG	2	8	141019	141026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011282	TTTG	2	8	141155	141162	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011282	ATTC	2	8	151048	151055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011282	CATA	2	8	151203	151210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011282	TAAA	2	8	158284	158291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011282	TTTC	2	8	158725	158732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011282	AACC	2	8	159095	159102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011282	TAAA	2	8	166807	166814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011282	GCCA	2	8	166909	166916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011282	AATG	2	8	167154	167161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011282	GTTG	2	8	167265	167272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011282	GAGG	2	8	167563	167570	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011282	GGTA	2	8	168187	168194	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011282	TCAA	2	8	171181	171188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011282	CAGC	2	8	171537	171544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011282	GACA	2	8	171599	171606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011282	TCAT	2	8	172986	172993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011282	TTTG	2	8	173009	173016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011282	AATC	2	8	173106	173113	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011282	TGGT	2	8	173126	173133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011282	TGTT	2	8	174012	174019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011282	TACT	2	8	174025	174032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011282	AATC	2	8	175859	175866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011282	GACA	2	8	176550	176557	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011282	CAGC	2	8	176667	176674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011282	CATC	2	8	176768	176775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011282	TCCT	2	8	180454	180461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011282	TTAG	2	8	180498	180505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011282	CCAT	2	8	180525	180532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011282	TCCG	2	8	181032	181039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011282	GATG	2	8	182740	182747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011282	CCGT	2	8	186178	186185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.