MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae 342 plasmid pKP187

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011282	CT	3	6	60	65	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011282	CT	3	6	222	227	0 %	50 %	0 %	50 %	206575669
3	NC_011282	CA	3	6	1354	1359	50 %	0 %	0 %	50 %	206575521
4	NC_011282	TC	3	6	1546	1551	0 %	50 %	0 %	50 %	206575521
5	NC_011282	TC	3	6	1993	1998	0 %	50 %	0 %	50 %	206575657
6	NC_011282	GA	3	6	2192	2197	50 %	0 %	50 %	0 %	206575657
7	NC_011282	AT	3	6	2890	2895	50 %	50 %	0 %	0 %	206575657
8	NC_011282	GA	3	6	2906	2911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011282	TC	3	6	3215	3220	0 %	50 %	0 %	50 %	206575603
10	NC_011282	AG	3	6	3573	3578	50 %	0 %	50 %	0 %	206575513
11	NC_011282	AC	3	6	4862	4867	50 %	0 %	0 %	50 %	206575604
12	NC_011282	CG	3	6	6943	6948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011282	GT	3	6	7729	7734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011282	AG	3	6	8021	8026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011282	AC	3	6	8540	8545	50 %	0 %	0 %	50 %	206575577
16	NC_011282	GT	3	6	8737	8742	0 %	50 %	50 %	0 %	206575577
17	NC_011282	TC	3	6	9001	9006	0 %	50 %	0 %	50 %	206575577
18	NC_011282	GA	3	6	9059	9064	50 %	0 %	50 %	0 %	206575577
19	NC_011282	TC	3	6	9291	9296	0 %	50 %	0 %	50 %	206575709
20	NC_011282	GT	3	6	9652	9657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011282	TC	3	6	10241	10246	0 %	50 %	0 %	50 %	206575697
22	NC_011282	CG	3	6	10589	10594	0 %	0 %	50 %	50 %	206575697
23	NC_011282	TA	3	6	10682	10687	50 %	50 %	0 %	0 %	206575697
24	NC_011282	TA	3	6	10829	10834	50 %	50 %	0 %	0 %	206575697
25	NC_011282	AG	3	6	12053	12058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011282	GA	3	6	12444	12449	50 %	0 %	50 %	0 %	206575694
27	NC_011282	CA	3	6	12924	12929	50 %	0 %	0 %	50 %	206575694
28	NC_011282	GT	3	6	14219	14224	0 %	50 %	50 %	0 %	206575574
29	NC_011282	TC	3	6	14490	14495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011282	TG	3	6	15320	15325	0 %	50 %	50 %	0 %	206575644
31	NC_011282	CT	3	6	16046	16051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011282	GC	3	6	17590	17595	0 %	0 %	50 %	50 %	206575495
33	NC_011282	AT	3	6	18059	18064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011282	GC	3	6	19445	19450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011282	GA	3	6	20704	20709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011282	AG	3	6	20959	20964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011282	TA	3	6	22160	22165	50 %	50 %	0 %	0 %	206575690
38	NC_011282	TA	3	6	22194	22199	50 %	50 %	0 %	0 %	206575690
39	NC_011282	TC	3	6	22237	22242	0 %	50 %	0 %	50 %	206575690
40	NC_011282	TA	3	6	22268	22273	50 %	50 %	0 %	0 %	206575690
41	NC_011282	TG	3	6	22927	22932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011282	TA	3	6	25381	25386	50 %	50 %	0 %	0 %	206575634
43	NC_011282	AT	3	6	26986	26991	50 %	50 %	0 %	0 %	206575649
44	NC_011282	AT	3	6	27591	27596	50 %	50 %	0 %	0 %	206575598
45	NC_011282	TC	3	6	27611	27616	0 %	50 %	0 %	50 %	206575598
46	NC_011282	TG	3	6	28902	28907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011282	AG	3	6	29558	29563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011282	CT	3	6	29569	29574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011282	AC	3	6	30720	30725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011282	TC	3	6	32041	32046	0 %	50 %	0 %	50 %	206575485
51	NC_011282	GC	3	6	32534	32539	0 %	0 %	50 %	50 %	206575608
52	NC_011282	GT	3	6	33382	33387	0 %	50 %	50 %	0 %	206575710
53	NC_011282	AT	4	8	33653	33660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011282	CG	3	6	34678	34683	0 %	0 %	50 %	50 %	206575620
55	NC_011282	CT	3	6	35009	35014	0 %	50 %	0 %	50 %	206575620
56	NC_011282	GA	3	6	35463	35468	50 %	0 %	50 %	0 %	206575620
57	NC_011282	AG	3	6	35801	35806	50 %	0 %	50 %	0 %	206575620
58	NC_011282	TC	3	6	37137	37142	0 %	50 %	0 %	50 %	206575497
59	NC_011282	AT	4	8	37905	37912	50 %	50 %	0 %	0 %	206575695
60	NC_011282	GA	3	6	38744	38749	50 %	0 %	50 %	0 %	206575671
61	NC_011282	GT	3	6	38927	38932	0 %	50 %	50 %	0 %	206575671
62	NC_011282	GA	3	6	39392	39397	50 %	0 %	50 %	0 %	206575671
63	NC_011282	AG	3	6	39711	39716	50 %	0 %	50 %	0 %	206575671
64	NC_011282	GA	3	6	40981	40986	50 %	0 %	50 %	0 %	206575683
65	NC_011282	GT	3	6	42792	42797	0 %	50 %	50 %	0 %	206575675
66	NC_011282	CT	3	6	42830	42835	0 %	50 %	0 %	50 %	206575675
67	NC_011282	TC	3	6	42935	42940	0 %	50 %	0 %	50 %	206575675
68	NC_011282	GT	3	6	43505	43510	0 %	50 %	50 %	0 %	206575599
69	NC_011282	GT	3	6	43518	43523	0 %	50 %	50 %	0 %	206575599
70	NC_011282	GA	3	6	43883	43888	50 %	0 %	50 %	0 %	206575512
71	NC_011282	CT	3	6	44033	44038	0 %	50 %	0 %	50 %	206575512
72	NC_011282	TC	3	6	46071	46076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011282	AC	3	6	46347	46352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011282	CA	3	6	46559	46564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011282	GC	3	6	47397	47402	0 %	0 %	50 %	50 %	206575672
76	NC_011282	TG	3	6	47446	47451	0 %	50 %	50 %	0 %	206575672
77	NC_011282	AG	3	6	48251	48256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011282	CA	3	6	48615	48620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011282	TA	3	6	48739	48744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011282	GT	3	6	48788	48793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011282	AT	4	8	49115	49122	50 %	50 %	0 %	0 %	206575536
82	NC_011282	CT	3	6	49425	49430	0 %	50 %	0 %	50 %	206575536
83	NC_011282	AT	3	6	49751	49756	50 %	50 %	0 %	0 %	206575536
84	NC_011282	TG	4	8	50129	50136	0 %	50 %	50 %	0 %	206575536
85	NC_011282	CT	3	6	51010	51015	0 %	50 %	0 %	50 %	206575543
86	NC_011282	CT	3	6	51277	51282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011282	GA	3	6	51949	51954	50 %	0 %	50 %	0 %	206575527
88	NC_011282	AC	3	6	52985	52990	50 %	0 %	0 %	50 %	206575527
89	NC_011282	AT	3	6	53196	53201	50 %	50 %	0 %	0 %	206575527
90	NC_011282	GC	3	6	53713	53718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011282	GA	3	6	54860	54865	50 %	0 %	50 %	0 %	206575615
92	NC_011282	GA	3	6	55006	55011	50 %	0 %	50 %	0 %	206575580
93	NC_011282	AT	4	8	55478	55485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011282	GT	3	6	55942	55947	0 %	50 %	50 %	0 %	206575640
95	NC_011282	CT	3	6	56065	56070	0 %	50 %	0 %	50 %	206575640
96	NC_011282	AT	3	6	56262	56267	50 %	50 %	0 %	0 %	206575640
97	NC_011282	CT	3	6	56382	56387	0 %	50 %	0 %	50 %	206575640
98	NC_011282	AT	3	6	56811	56816	50 %	50 %	0 %	0 %	206575520
99	NC_011282	CA	3	6	57052	57057	50 %	0 %	0 %	50 %	206575520
100	NC_011282	GA	3	6	58442	58447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011282	AG	3	6	59196	59201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011282	AC	3	6	59715	59720	50 %	0 %	0 %	50 %	206575569
103	NC_011282	GT	3	6	59912	59917	0 %	50 %	50 %	0 %	206575569
104	NC_011282	TC	3	6	60176	60181	0 %	50 %	0 %	50 %	206575569
105	NC_011282	GA	3	6	60234	60239	50 %	0 %	50 %	0 %	206575569
106	NC_011282	TA	3	6	60722	60727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011282	CG	3	6	61718	61723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011282	GC	3	6	62818	62823	0 %	0 %	50 %	50 %	206575653
109	NC_011282	AG	3	6	63842	63847	50 %	0 %	50 %	0 %	206575653
110	NC_011282	CG	3	6	65119	65124	0 %	0 %	50 %	50 %	206575653
111	NC_011282	TC	3	6	66058	66063	0 %	50 %	0 %	50 %	206575570
112	NC_011282	TA	3	6	67490	67495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011282	AT	3	6	67501	67506	50 %	50 %	0 %	0 %	206575533
114	NC_011282	CG	3	6	67650	67655	0 %	0 %	50 %	50 %	206575533
115	NC_011282	GC	3	6	68092	68097	0 %	0 %	50 %	50 %	206575614
116	NC_011282	CG	3	6	68425	68430	0 %	0 %	50 %	50 %	206575614
117	NC_011282	CT	4	8	68884	68891	0 %	50 %	0 %	50 %	206575614
118	NC_011282	AT	3	6	69321	69326	50 %	50 %	0 %	0 %	206575614
119	NC_011282	GC	3	6	69374	69379	0 %	0 %	50 %	50 %	206575614
120	NC_011282	CG	3	6	69474	69479	0 %	0 %	50 %	50 %	206575614
121	NC_011282	CG	3	6	69807	69812	0 %	0 %	50 %	50 %	206575614
122	NC_011282	AG	3	6	70024	70029	50 %	0 %	50 %	0 %	206575614
123	NC_011282	CG	3	6	70244	70249	0 %	0 %	50 %	50 %	206575614
124	NC_011282	CG	3	6	70352	70357	0 %	0 %	50 %	50 %	206575614
125	NC_011282	TA	3	6	70760	70765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011282	GT	3	6	70868	70873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011282	TG	3	6	70965	70970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011282	CT	3	6	71119	71124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011282	CG	3	6	71558	71563	0 %	0 %	50 %	50 %	206575545
130	NC_011282	GT	3	6	73153	73158	0 %	50 %	50 %	0 %	206575517
131	NC_011282	AC	3	6	73669	73674	50 %	0 %	0 %	50 %	206575517
132	NC_011282	AC	3	6	73697	73702	50 %	0 %	0 %	50 %	206575517
133	NC_011282	AT	3	6	74009	74014	50 %	50 %	0 %	0 %	206575650
134	NC_011282	AC	3	6	75719	75724	50 %	0 %	0 %	50 %	206575589
135	NC_011282	GA	3	6	76475	76480	50 %	0 %	50 %	0 %	206575589
136	NC_011282	TA	3	6	77632	77637	50 %	50 %	0 %	0 %	206575676
137	NC_011282	GC	3	6	78019	78024	0 %	0 %	50 %	50 %	206575676
138	NC_011282	AG	4	8	78082	78089	50 %	0 %	50 %	0 %	206575676
139	NC_011282	CG	3	6	78098	78103	0 %	0 %	50 %	50 %	206575676
140	NC_011282	AT	3	6	80492	80497	50 %	50 %	0 %	0 %	206575572
141	NC_011282	GA	3	6	80615	80620	50 %	0 %	50 %	0 %	206575572
142	NC_011282	GC	3	6	80753	80758	0 %	0 %	50 %	50 %	206575572
143	NC_011282	TC	3	6	82569	82574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011282	TG	3	6	82989	82994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011282	AG	4	8	83069	83076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011282	GA	3	6	83283	83288	50 %	0 %	50 %	0 %	206575593
147	NC_011282	TA	4	8	83523	83530	50 %	50 %	0 %	0 %	206575593
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.