MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae 342 plasmid pKP91

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011281	GCGCG	2	10	1208	1217	0 %	0 %	60 %	40 %	206575468
2	NC_011281	AGCAC	2	10	1960	1969	40 %	0 %	20 %	40 %	206575376
3	NC_011281	CATGC	2	10	2528	2537	20 %	20 %	20 %	40 %	206575376
4	NC_011281	CAGGG	2	10	3477	3486	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011281	GCTTT	2	10	3739	3748	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011281	TGAAA	2	10	5175	5184	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011281	GCCAG	2	10	10406	10415	20 %	0 %	40 %	40 %	206575388
8	NC_011281	AAGAT	2	10	10723	10732	60 %	20 %	20 %	0 %	206575388
9	NC_011281	ACCGG	2	10	10768	10777	20 %	0 %	40 %	40 %	206575388
10	NC_011281	GATCA	2	10	14075	14084	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011281	GCAAA	2	10	14117	14126	60 %	0 %	20 %	20 %	206575456
12	NC_011281	AGTTT	2	10	15480	15489	20 %	60 %	20 %	0 %	206575374
13	NC_011281	TCGCC	2	10	15695	15704	0 %	20 %	20 %	60 %	206575374
14	NC_011281	TGCGG	2	10	17111	17120	0 %	20 %	60 %	20 %	206575377
15	NC_011281	AGAGC	2	10	18160	18169	40 %	0 %	40 %	20 %	206575377
16	NC_011281	CAGAT	2	10	21711	21720	40 %	20 %	20 %	20 %	206575416
17	NC_011281	CTCTA	2	10	22090	22099	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011281	GGAGA	2	10	22155	22164	40 %	0 %	60 %	0 %	206575368
19	NC_011281	AACCC	2	10	22179	22188	40 %	0 %	0 %	60 %	206575368
20	NC_011281	CGGAA	2	10	22333	22342	40 %	0 %	40 %	20 %	206575368
21	NC_011281	CGGTA	2	10	22888	22897	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011281	GACAC	2	10	25941	25950	40 %	0 %	20 %	40 %	206575386
23	NC_011281	GGTCA	2	10	27440	27449	20 %	20 %	40 %	20 %	206575386
24	NC_011281	TTCGC	2	10	29598	29607	0 %	40 %	20 %	40 %	206575444
25	NC_011281	TGAAG	2	10	34433	34442	40 %	20 %	40 %	0 %	206575415
26	NC_011281	AATAA	2	10	34618	34627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011281	CCGCG	2	10	35811	35820	0 %	0 %	40 %	60 %	206575428
28	NC_011281	CCCTT	2	10	38282	38291	0 %	40 %	0 %	60 %	206575392
29	NC_011281	AATGA	2	10	38788	38797	60 %	20 %	20 %	0 %	206575462
30	NC_011281	AAGCG	2	10	42670	42679	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011281	CCCTT	2	10	43927	43936	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_011281	CTCAG	2	10	46815	46824	20 %	20 %	20 %	40 %	206575453
33	NC_011281	GCTGT	2	10	47713	47722	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011281	CTGGC	2	10	53154	53163	0 %	20 %	40 %	40 %	206575443
35	NC_011281	GCAGC	2	10	53659	53668	20 %	0 %	40 %	40 %	206575443
36	NC_011281	ATTTT	2	10	57244	57253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011281	AAAGC	2	10	59752	59761	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011281	ACCGT	2	10	69666	69675	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011281	GTGTC	2	10	71678	71687	0 %	40 %	40 %	20 %	206575419
40	NC_011281	GAAAA	2	10	73880	73889	80 %	0 %	20 %	0 %	206575463
41	NC_011281	TCAGC	2	10	74556	74565	20 %	20 %	20 %	40 %	206575463
42	NC_011281	CCCCG	2	10	75016	75025	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
43	NC_011281	TGGTG	2	10	75987	75996	0 %	40 %	60 %	0 %	206575424
44	NC_011281	TCTGT	2	10	76973	76982	0 %	60 %	20 %	20 %	206575396
45	NC_011281	GAAGG	2	10	79889	79898	40 %	0 %	60 %	0 %	206575465
46	NC_011281	TGGTG	2	10	85724	85733	0 %	40 %	60 %	0 %	206575413
47	NC_011281	CTGTT	2	10	87109	87118	0 %	60 %	20 %	20 %	206575375
48	NC_011281	CTGGA	2	10	89085	89094	20 %	20 %	40 %	20 %	206575427
49	NC_011281	ATTAA	2	10	89436	89445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.