MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae 342 plasmid pKP91

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011281	GCCC	2	8	195	202	0 %	0 %	25 %	75 %	206575435
2	NC_011281	GTAG	2	8	1146	1153	25 %	25 %	50 %	0 %	206575468
3	NC_011281	CTCG	2	8	2134	2141	0 %	25 %	25 %	50 %	206575376
4	NC_011281	GGAA	2	8	2314	2321	50 %	0 %	50 %	0 %	206575376
5	NC_011281	CGAT	2	8	2411	2418	25 %	25 %	25 %	25 %	206575376
6	NC_011281	GATC	2	8	2851	2858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011281	TTTC	2	8	3815	3822	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011281	TTTC	2	8	5276	5283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011281	GCCA	2	8	5480	5487	25 %	0 %	25 %	50 %	206575429
10	NC_011281	CCGC	2	8	5502	5509	0 %	0 %	25 %	75 %	206575429
11	NC_011281	TCAG	2	8	5835	5842	25 %	25 %	25 %	25 %	206575429
12	NC_011281	GCCG	2	8	6116	6123	0 %	0 %	50 %	50 %	206575429
13	NC_011281	GGAT	2	8	6329	6336	25 %	25 %	50 %	0 %	206575448
14	NC_011281	ATTC	2	8	6649	6656	25 %	50 %	0 %	25 %	206575448
15	NC_011281	GGCA	2	8	6950	6957	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011281	GGCA	2	8	7222	7229	25 %	0 %	50 %	25 %	206575454
17	NC_011281	TGGC	2	8	7451	7458	0 %	25 %	50 %	25 %	206575454
18	NC_011281	AGGG	2	8	7595	7602	25 %	0 %	75 %	0 %	206575454
19	NC_011281	CTGG	2	8	8396	8403	0 %	25 %	50 %	25 %	206575397
20	NC_011281	GGCG	2	8	9356	9363	0 %	0 %	75 %	25 %	206575445
21	NC_011281	GTAA	2	8	9764	9771	50 %	25 %	25 %	0 %	206575475
22	NC_011281	TCGC	2	8	10057	10064	0 %	25 %	25 %	50 %	206575388
23	NC_011281	ACTG	2	8	11382	11389	25 %	25 %	25 %	25 %	206575410
24	NC_011281	TAAC	2	8	11690	11697	50 %	25 %	0 %	25 %	206575410
25	NC_011281	CGGG	2	8	11869	11876	0 %	0 %	75 %	25 %	206575410
26	NC_011281	GGCT	2	8	12149	12156	0 %	25 %	50 %	25 %	206575373
27	NC_011281	TCGT	2	8	13001	13008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011281	TCTG	2	8	13050	13057	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011281	TGCC	2	8	13325	13332	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011281	CGCC	2	8	13472	13479	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_011281	CTGG	2	8	14191	14198	0 %	25 %	50 %	25 %	206575456
32	NC_011281	TCCC	2	8	14754	14761	0 %	25 %	0 %	75 %	206575456
33	NC_011281	GCGT	2	8	15021	15028	0 %	25 %	50 %	25 %	206575456
34	NC_011281	CTCC	2	8	15208	15215	0 %	25 %	0 %	75 %	206575374
35	NC_011281	AGGC	2	8	15290	15297	25 %	0 %	50 %	25 %	206575374
36	NC_011281	GCTG	2	8	15641	15648	0 %	25 %	50 %	25 %	206575374
37	NC_011281	TCAG	2	8	16335	16342	25 %	25 %	25 %	25 %	206575377
38	NC_011281	CGAT	2	8	16548	16555	25 %	25 %	25 %	25 %	206575377
39	NC_011281	CTGC	2	8	16657	16664	0 %	25 %	25 %	50 %	206575377
40	NC_011281	GATA	2	8	17027	17034	50 %	25 %	25 %	0 %	206575377
41	NC_011281	ATAC	2	8	17146	17153	50 %	25 %	0 %	25 %	206575377
42	NC_011281	GCCA	2	8	17388	17395	25 %	0 %	25 %	50 %	206575377
43	NC_011281	GTCA	2	8	18843	18850	25 %	25 %	25 %	25 %	206575436
44	NC_011281	AGCG	2	8	18900	18907	25 %	0 %	50 %	25 %	206575436
45	NC_011281	TCAT	2	8	19159	19166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011281	GCTG	2	8	19196	19203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011281	GCCT	2	8	19446	19453	0 %	25 %	25 %	50 %	206575441
48	NC_011281	TCGA	2	8	19579	19586	25 %	25 %	25 %	25 %	206575441
49	NC_011281	AGTG	2	8	19892	19899	25 %	25 %	50 %	0 %	206575441
50	NC_011281	GTCT	2	8	20058	20065	0 %	50 %	25 %	25 %	206575441
51	NC_011281	GACA	2	8	20857	20864	50 %	0 %	25 %	25 %	206575467
52	NC_011281	ACTC	2	8	21033	21040	25 %	25 %	0 %	50 %	206575467
53	NC_011281	CGTG	2	8	21175	21182	0 %	25 %	50 %	25 %	206575416
54	NC_011281	TTCT	2	8	21264	21271	0 %	75 %	0 %	25 %	206575416
55	NC_011281	TCAT	2	8	21513	21520	25 %	50 %	0 %	25 %	206575416
56	NC_011281	TTCA	2	8	22033	22040	25 %	50 %	0 %	25 %	206575417
57	NC_011281	AGCC	2	8	22246	22253	25 %	0 %	25 %	50 %	206575368
58	NC_011281	ATGA	2	8	22966	22973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011281	AATA	2	8	22993	23000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011281	GTTC	2	8	23107	23114	0 %	50 %	25 %	25 %	206575381
61	NC_011281	GGCA	2	8	23343	23350	25 %	0 %	50 %	25 %	206575381
62	NC_011281	TTGA	2	8	24002	24009	25 %	50 %	25 %	0 %	206575431
63	NC_011281	AAGA	2	8	24164	24171	75 %	0 %	25 %	0 %	206575431
64	NC_011281	TGCG	2	8	25278	25285	0 %	25 %	50 %	25 %	206575461
65	NC_011281	ACCA	2	8	25526	25533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011281	ACTG	2	8	25592	25599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011281	CTCC	2	8	26041	26048	0 %	25 %	0 %	75 %	206575386
68	NC_011281	CATT	2	8	26428	26435	25 %	50 %	0 %	25 %	206575386
69	NC_011281	CGAC	2	8	26506	26513	25 %	0 %	25 %	50 %	206575386
70	NC_011281	GCTG	2	8	26627	26634	0 %	25 %	50 %	25 %	206575386
71	NC_011281	TTCC	2	8	26695	26702	0 %	50 %	0 %	50 %	206575386
72	NC_011281	GCCA	2	8	27058	27065	25 %	0 %	25 %	50 %	206575386
73	NC_011281	ATCG	2	8	27119	27126	25 %	25 %	25 %	25 %	206575386
74	NC_011281	TTGA	2	8	27928	27935	25 %	50 %	25 %	0 %	206575395
75	NC_011281	TTCT	2	8	28122	28129	0 %	75 %	0 %	25 %	206575395
76	NC_011281	AGTA	2	8	28132	28139	50 %	25 %	25 %	0 %	206575395
77	NC_011281	TCAG	2	8	28245	28252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011281	CAGC	2	8	28691	28698	25 %	0 %	25 %	50 %	206575439
79	NC_011281	CACC	2	8	29964	29971	25 %	0 %	0 %	75 %	206575444
80	NC_011281	AAGG	2	8	30053	30060	50 %	0 %	50 %	0 %	206575444
81	NC_011281	CTTT	2	8	30582	30589	0 %	75 %	0 %	25 %	206575406
82	NC_011281	GCAT	2	8	30861	30868	25 %	25 %	25 %	25 %	206575406
83	NC_011281	TGGT	2	8	31174	31181	0 %	50 %	50 %	0 %	206575406
84	NC_011281	CGAT	2	8	31380	31387	25 %	25 %	25 %	25 %	206575406
85	NC_011281	TTTG	2	8	31589	31596	0 %	75 %	25 %	0 %	206575406
86	NC_011281	CGTC	2	8	32020	32027	0 %	25 %	25 %	50 %	206575400
87	NC_011281	CTGC	2	8	32267	32274	0 %	25 %	25 %	50 %	206575400
88	NC_011281	GTAG	2	8	32300	32307	25 %	25 %	50 %	0 %	206575400
89	NC_011281	GATG	2	8	32330	32337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011281	TCTG	2	8	32744	32751	0 %	50 %	25 %	25 %	206575433
91	NC_011281	GTTA	2	8	32806	32813	25 %	50 %	25 %	0 %	206575433
92	NC_011281	ATGA	2	8	33151	33158	50 %	25 %	25 %	0 %	206575440
93	NC_011281	CCAG	2	8	33840	33847	25 %	0 %	25 %	50 %	206575440
94	NC_011281	GGCA	2	8	34508	34515	25 %	0 %	50 %	25 %	206575415
95	NC_011281	GTTG	2	8	34551	34558	0 %	50 %	50 %	0 %	206575415
96	NC_011281	TGAT	2	8	34679	34686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011281	AGAT	2	8	35281	35288	50 %	25 %	25 %	0 %	206575428
98	NC_011281	TTTA	2	8	36280	36287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011281	CGTT	2	8	36749	36756	0 %	50 %	25 %	25 %	206575412
100	NC_011281	ATTT	2	8	37163	37170	25 %	75 %	0 %	0 %	206575426
101	NC_011281	TATT	3	12	37500	37511	25 %	75 %	0 %	0 %	206575426
102	NC_011281	ATTT	2	8	37635	37642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011281	AAAC	2	8	37643	37650	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011281	TGGC	2	8	37756	37763	0 %	25 %	50 %	25 %	206575385
105	NC_011281	TCCT	2	8	37801	37808	0 %	50 %	0 %	50 %	206575385
106	NC_011281	CGCT	2	8	38377	38384	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011281	AAGG	2	8	38815	38822	50 %	0 %	50 %	0 %	206575462
108	NC_011281	CCGT	2	8	39515	39522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011281	ACGC	2	8	40309	40316	25 %	0 %	25 %	50 %	206575405
110	NC_011281	ATCA	2	8	40930	40937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011281	ATCA	2	8	41403	41410	50 %	25 %	0 %	25 %	206575455
112	NC_011281	CACC	2	8	41507	41514	25 %	0 %	0 %	75 %	206575455
113	NC_011281	TTTC	2	8	41768	41775	0 %	75 %	0 %	25 %	206575421
114	NC_011281	AATC	2	8	42107	42114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011281	TGCA	2	8	42338	42345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011281	AGCC	2	8	42409	42416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011281	AGTG	2	8	42875	42882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011281	TGAA	2	8	43479	43486	50 %	25 %	25 %	0 %	206575478
119	NC_011281	TCAG	2	8	43519	43526	25 %	25 %	25 %	25 %	206575478
120	NC_011281	GGCT	2	8	44297	44304	0 %	25 %	50 %	25 %	206575401
121	NC_011281	TGCA	2	8	44596	44603	25 %	25 %	25 %	25 %	206575401
122	NC_011281	AGCC	2	8	44667	44674	25 %	0 %	25 %	50 %	206575401
123	NC_011281	CGCT	2	8	45122	45129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011281	CAGA	2	8	45333	45340	50 %	0 %	25 %	25 %	206575471
125	NC_011281	TCGC	2	8	45427	45434	0 %	25 %	25 %	50 %	206575471
126	NC_011281	CTGA	2	8	45943	45950	25 %	25 %	25 %	25 %	206575471
127	NC_011281	TCTT	2	8	46063	46070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011281	ACAG	2	8	46378	46385	50 %	0 %	25 %	25 %	206575453
129	NC_011281	GGCT	2	8	46777	46784	0 %	25 %	50 %	25 %	206575453
130	NC_011281	CAGC	2	8	47678	47685	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011281	GCCA	2	8	47686	47693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011281	TACA	2	8	48432	48439	50 %	25 %	0 %	25 %	206575450
133	NC_011281	AGCC	2	8	48440	48447	25 %	0 %	25 %	50 %	206575450
134	NC_011281	GGGT	2	8	49374	49381	0 %	25 %	75 %	0 %	206575451
135	NC_011281	CCTC	2	8	50835	50842	0 %	25 %	0 %	75 %	206575480
136	NC_011281	GAAA	2	8	51640	51647	75 %	0 %	25 %	0 %	206575369
137	NC_011281	CAAC	2	8	51710	51717	50 %	0 %	0 %	50 %	206575369
138	NC_011281	CTGC	2	8	51818	51825	0 %	25 %	25 %	50 %	206575369
139	NC_011281	TTAA	2	8	52030	52037	50 %	50 %	0 %	0 %	206575369
140	NC_011281	GGCG	2	8	54254	54261	0 %	0 %	75 %	25 %	206575434
141	NC_011281	CCTG	2	8	55024	55031	0 %	25 %	25 %	50 %	206575469
142	NC_011281	CGGA	2	8	55257	55264	25 %	0 %	50 %	25 %	206575469
143	NC_011281	TATT	2	8	55545	55552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.