MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 8425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011274	ACCA	2	8	356	363	50 %	0 %	0 %	50 %	205351348
2	NC_011274	GATC	2	8	667	674	25 %	25 %	25 %	25 %	205351348
3	NC_011274	ATGA	2	8	3018	3025	50 %	25 %	25 %	0 %	205351349
4	NC_011274	GATG	2	8	4523	4530	25 %	25 %	50 %	0 %	205351350
5	NC_011274	CAGC	2	8	4532	4539	25 %	0 %	25 %	50 %	205351350
6	NC_011274	CTGA	2	8	4590	4597	25 %	25 %	25 %	25 %	205351350
7	NC_011274	AAAG	2	8	4770	4777	75 %	0 %	25 %	0 %	205351350
8	NC_011274	CTGC	2	8	4860	4867	0 %	25 %	25 %	50 %	205351350
9	NC_011274	GCCA	2	8	6554	6561	25 %	0 %	25 %	50 %	205351352
10	NC_011274	TGAA	2	8	7180	7187	50 %	25 %	25 %	0 %	205351352
11	NC_011274	GCGT	2	8	8046	8053	0 %	25 %	50 %	25 %	205351353
12	NC_011274	AAGA	2	8	8128	8135	75 %	0 %	25 %	0 %	205351353
13	NC_011274	GAAC	2	8	9608	9615	50 %	0 %	25 %	25 %	205351355
14	NC_011274	TGGC	2	8	10894	10901	0 %	25 %	50 %	25 %	205351356
15	NC_011274	TCGT	2	8	11014	11021	0 %	50 %	25 %	25 %	205351356
16	NC_011274	ATGG	2	8	11538	11545	25 %	25 %	50 %	0 %	205351357
17	NC_011274	TGGT	2	8	11629	11636	0 %	50 %	50 %	0 %	205351357
18	NC_011274	CAAC	2	8	12142	12149	50 %	0 %	0 %	50 %	205351357
19	NC_011274	AAGA	2	8	12216	12223	75 %	0 %	25 %	0 %	205351357
20	NC_011274	CCAT	2	8	12793	12800	25 %	25 %	0 %	50 %	205351357
21	NC_011274	GGCT	2	8	13313	13320	0 %	25 %	50 %	25 %	205351357
22	NC_011274	CGGT	2	8	14483	14490	0 %	25 %	50 %	25 %	205351358
23	NC_011274	TCAG	2	8	15135	15142	25 %	25 %	25 %	25 %	205351359
24	NC_011274	TTTG	2	8	15425	15432	0 %	75 %	25 %	0 %	205351359
25	NC_011274	CGAA	2	8	15640	15647	50 %	0 %	25 %	25 %	205351359
26	NC_011274	ATTG	2	8	15652	15659	25 %	50 %	25 %	0 %	205351359
27	NC_011274	ATTA	2	8	16320	16327	50 %	50 %	0 %	0 %	205351360
28	NC_011274	ATAA	2	8	16412	16419	75 %	25 %	0 %	0 %	205351361
29	NC_011274	TTTA	2	8	23387	23394	25 %	75 %	0 %	0 %	205351363
30	NC_011274	TCTG	2	8	23844	23851	0 %	50 %	25 %	25 %	205351363
31	NC_011274	TGAA	2	8	24355	24362	50 %	25 %	25 %	0 %	205351364
32	NC_011274	CCAG	2	8	24626	24633	25 %	0 %	25 %	50 %	205351364
33	NC_011274	ACCG	2	8	25303	25310	25 %	0 %	25 %	50 %	205351365
34	NC_011274	AAAT	2	8	25363	25370	75 %	25 %	0 %	0 %	205351365
35	NC_011274	TCTG	2	8	25820	25827	0 %	50 %	25 %	25 %	205351366
36	NC_011274	GCCT	2	8	26001	26008	0 %	25 %	25 %	50 %	205351366
37	NC_011274	CCTT	2	8	26507	26514	0 %	50 %	0 %	50 %	205351366
38	NC_011274	TCAG	2	8	26866	26873	25 %	25 %	25 %	25 %	205351366
39	NC_011274	ATCA	2	8	27279	27286	50 %	25 %	0 %	25 %	205351366
40	NC_011274	CAGC	2	8	27323	27330	25 %	0 %	25 %	50 %	205351366
41	NC_011274	AGCC	2	8	27813	27820	25 %	0 %	25 %	50 %	205351366
42	NC_011274	CCGA	2	8	28020	28027	25 %	0 %	25 %	50 %	205351366
43	NC_011274	ATTA	2	8	28413	28420	50 %	50 %	0 %	0 %	205351367
44	NC_011274	GGCG	2	8	28655	28662	0 %	0 %	75 %	25 %	205351367
45	NC_011274	ATGA	2	8	29860	29867	50 %	25 %	25 %	0 %	205351368
46	NC_011274	TGCT	2	8	30430	30437	0 %	50 %	25 %	25 %	205351370
47	NC_011274	TATC	2	8	30486	30493	25 %	50 %	0 %	25 %	205351370
48	NC_011274	GTAA	2	8	30523	30530	50 %	25 %	25 %	0 %	205351370
49	NC_011274	TTCG	2	8	30785	30792	0 %	50 %	25 %	25 %	205351370
50	NC_011274	GTCA	2	8	31294	31301	25 %	25 %	25 %	25 %	205351371
51	NC_011274	ACCG	2	8	32114	32121	25 %	0 %	25 %	50 %	205351372
52	NC_011274	AGGC	2	8	32152	32159	25 %	0 %	50 %	25 %	205351372
53	NC_011274	CCTG	2	8	32588	32595	0 %	25 %	25 %	50 %	205351373
54	NC_011274	AACA	2	8	32604	32611	75 %	0 %	0 %	25 %	205351373
55	NC_011274	CGCA	2	8	32778	32785	25 %	0 %	25 %	50 %	205351373
56	NC_011274	TAAA	2	8	32848	32855	75 %	25 %	0 %	0 %	205351373
57	NC_011274	TTAT	2	8	33417	33424	25 %	75 %	0 %	0 %	205351374
58	NC_011274	TTGG	2	8	33801	33808	0 %	50 %	50 %	0 %	205351374
59	NC_011274	CTTT	2	8	34181	34188	0 %	75 %	0 %	25 %	205351374
60	NC_011274	GAAG	2	8	34221	34228	50 %	0 %	50 %	0 %	205351374
61	NC_011274	ATAA	2	8	34552	34559	75 %	25 %	0 %	0 %	205351375
62	NC_011274	GTGC	2	8	34675	34682	0 %	25 %	50 %	25 %	205351375
63	NC_011274	TTAA	2	8	34685	34692	50 %	50 %	0 %	0 %	205351375
64	NC_011274	TGGA	2	8	35437	35444	25 %	25 %	50 %	0 %	205351376
65	NC_011274	GGGA	2	8	36381	36388	25 %	0 %	75 %	0 %	205351376
66	NC_011274	ATAC	2	8	37366	37373	50 %	25 %	0 %	25 %	205351377
67	NC_011274	GAAG	2	8	37438	37445	50 %	0 %	50 %	0 %	205351377
68	NC_011274	CACG	2	8	38001	38008	25 %	0 %	25 %	50 %	205351377
69	NC_011274	TAAT	2	8	38103	38110	50 %	50 %	0 %	0 %	205351377
70	NC_011274	CCAT	2	8	38559	38566	25 %	25 %	0 %	50 %	205351377
71	NC_011274	GCGG	2	8	40424	40431	0 %	0 %	75 %	25 %	205351379
72	NC_011274	CTGG	2	8	40642	40649	0 %	25 %	50 %	25 %	205351379
73	NC_011274	CCGA	2	8	41159	41166	25 %	0 %	25 %	50 %	205351379
74	NC_011274	ATCG	2	8	41315	41322	25 %	25 %	25 %	25 %	205351379
75	NC_011274	TCAA	2	8	41376	41383	50 %	25 %	0 %	25 %	205351379
76	NC_011274	AACC	2	8	41642	41649	50 %	0 %	0 %	50 %	205351380
77	NC_011274	GAAA	2	8	41694	41701	75 %	0 %	25 %	0 %	205351380
78	NC_011274	GGTC	2	8	42266	42273	0 %	25 %	50 %	25 %	205351380
79	NC_011274	TTTG	2	8	42790	42797	0 %	75 %	25 %	0 %	205351380
80	NC_011274	GTAT	2	8	43085	43092	25 %	50 %	25 %	0 %	205351381
81	NC_011274	TCCG	2	8	43479	43486	0 %	25 %	25 %	50 %	205351381
82	NC_011274	ATGA	2	8	45541	45548	50 %	25 %	25 %	0 %	205351382
83	NC_011274	AACG	2	8	45843	45850	50 %	0 %	25 %	25 %	205351382
84	NC_011274	GAAA	2	8	46791	46798	75 %	0 %	25 %	0 %	205351383
85	NC_011274	TCGC	2	8	46806	46813	0 %	25 %	25 %	50 %	205351383
86	NC_011274	GCTG	2	8	46997	47004	0 %	25 %	50 %	25 %	205351383
87	NC_011274	CACG	2	8	47695	47702	25 %	0 %	25 %	50 %	205351384
88	NC_011274	CAGC	2	8	47722	47729	25 %	0 %	25 %	50 %	205351384
89	NC_011274	CTGC	2	8	47859	47866	0 %	25 %	25 %	50 %	205351384
90	NC_011274	CATG	2	8	48427	48434	25 %	25 %	25 %	25 %	205351385
91	NC_011274	AAGT	2	8	49221	49228	50 %	25 %	25 %	0 %	205351385
92	NC_011274	CCAG	2	8	49279	49286	25 %	0 %	25 %	50 %	205351385
93	NC_011274	TTGA	2	8	50060	50067	25 %	50 %	25 %	0 %	205351385
94	NC_011274	GCCC	2	8	52956	52963	0 %	0 %	25 %	75 %	205351388
95	NC_011274	TGGC	2	8	53498	53505	0 %	25 %	50 %	25 %	205351388
96	NC_011274	AGCC	2	8	57325	57332	25 %	0 %	25 %	50 %	205351391
97	NC_011274	AAAG	2	8	57404	57411	75 %	0 %	25 %	0 %	205351391
98	NC_011274	ATGG	2	8	57537	57544	25 %	25 %	50 %	0 %	205351391
99	NC_011274	TGAT	2	8	58209	58216	25 %	50 %	25 %	0 %	205351392
100	NC_011274	TGGA	2	8	58878	58885	25 %	25 %	50 %	0 %	205351393
101	NC_011274	CCTG	2	8	58914	58921	0 %	25 %	25 %	50 %	205351393
102	NC_011274	GATT	2	8	59276	59283	25 %	50 %	25 %	0 %	205351393
103	NC_011274	GATC	2	8	59645	59652	25 %	25 %	25 %	25 %	205351393
104	NC_011274	CTGG	2	8	60770	60777	0 %	25 %	50 %	25 %	205351394
105	NC_011274	GTGG	2	8	60935	60942	0 %	25 %	75 %	0 %	205351394
106	NC_011274	CTGC	2	8	61142	61149	0 %	25 %	25 %	50 %	205351395
107	NC_011274	ACCA	2	8	61778	61785	50 %	0 %	0 %	50 %	205351396
108	NC_011274	CATT	2	8	62003	62010	25 %	50 %	0 %	25 %	205351396
109	NC_011274	TCAA	2	8	63044	63051	50 %	25 %	0 %	25 %	205351396
110	NC_011274	GCCA	2	8	64630	64637	25 %	0 %	25 %	50 %	205351397
111	NC_011274	GCTG	2	8	65015	65022	0 %	25 %	50 %	25 %	205351398
112	NC_011274	ACGT	2	8	65922	65929	25 %	25 %	25 %	25 %	205351398
113	NC_011274	CCAG	2	8	66047	66054	25 %	0 %	25 %	50 %	205351398
114	NC_011274	TTCA	2	8	66763	66770	25 %	50 %	0 %	25 %	205351399
115	NC_011274	GAAG	2	8	67513	67520	50 %	0 %	50 %	0 %	205351400
116	NC_011274	CAGA	2	8	67686	67693	50 %	0 %	25 %	25 %	205351400
117	NC_011274	TTTC	2	8	67959	67966	0 %	75 %	0 %	25 %	205351400
118	NC_011274	AGTC	2	8	68118	68125	25 %	25 %	25 %	25 %	205351400
119	NC_011274	TAAT	2	8	68160	68167	50 %	50 %	0 %	0 %	205351400
120	NC_011274	ATTT	2	8	68546	68553	25 %	75 %	0 %	0 %	205351401
121	NC_011274	GTCG	2	8	68578	68585	0 %	25 %	50 %	25 %	205351401
122	NC_011274	GCAG	2	8	68863	68870	25 %	0 %	50 %	25 %	205351401
123	NC_011274	ACCG	2	8	69089	69096	25 %	0 %	25 %	50 %	205351401
124	NC_011274	GATC	2	8	69235	69242	25 %	25 %	25 %	25 %	205351401
125	NC_011274	GGCA	2	8	69609	69616	25 %	0 %	50 %	25 %	205351402
126	NC_011274	TCCA	2	8	69651	69658	25 %	25 %	0 %	50 %	205351402
127	NC_011274	GAAG	2	8	70487	70494	50 %	0 %	50 %	0 %	205351403
128	NC_011274	AAGG	2	8	70744	70751	50 %	0 %	50 %	0 %	205351403
129	NC_011274	CTGA	2	8	71353	71360	25 %	25 %	25 %	25 %	205351404
130	NC_011274	CAAT	2	8	71787	71794	50 %	25 %	0 %	25 %	205351404
131	NC_011274	ATGG	2	8	72551	72558	25 %	25 %	50 %	0 %	205351405
132	NC_011274	GTTG	2	8	72876	72883	0 %	50 %	50 %	0 %	205351406
133	NC_011274	TGGA	2	8	73009	73016	25 %	25 %	50 %	0 %	205351406
134	NC_011274	CGGG	2	8	74526	74533	0 %	0 %	75 %	25 %	205351407
135	NC_011274	TCCT	2	8	75711	75718	0 %	50 %	0 %	50 %	205351408
136	NC_011274	CTTA	2	8	75739	75746	25 %	50 %	0 %	25 %	205351408
137	NC_011274	GACC	2	8	76908	76915	25 %	0 %	25 %	50 %	205351409
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