MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 67452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011274	ACA	2	6	71	76	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011274	CAC	3	9	94	102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351347
3	NC_011274	ACC	2	6	107	112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351347
4	NC_011274	AAC	2	6	220	225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011274	CGG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
6	NC_011274	TGG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351348
7	NC_011274	GAT	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351348
8	NC_011274	CGG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
9	NC_011274	CTG	2	6	554	559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
10	NC_011274	CGC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
11	NC_011274	CGC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
12	NC_011274	CCG	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
13	NC_011274	TGG	2	6	822	827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351348
14	NC_011274	CCG	3	9	855	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
15	NC_011274	GCC	2	6	869	874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
16	NC_011274	CTG	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
17	NC_011274	GCT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
18	NC_011274	TTC	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351348
19	NC_011274	CGA	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351348
20	NC_011274	AAC	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351348
21	NC_011274	GAT	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351348
22	NC_011274	GGC	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
23	NC_011274	CGC	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
24	NC_011274	GGT	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351348
25	NC_011274	TCC	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351348
26	NC_011274	CCG	2	6	1336	1341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
27	NC_011274	GCT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
28	NC_011274	TGT	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351348
29	NC_011274	TTC	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351348
30	NC_011274	TCT	2	6	1526	1531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351348
31	NC_011274	TGG	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351348
32	NC_011274	ACG	2	6	1560	1565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351348
33	NC_011274	CCA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351348
34	NC_011274	CGG	2	6	1645	1650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
35	NC_011274	CGG	2	6	1654	1659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
36	NC_011274	GAA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351348
37	NC_011274	GCG	2	6	1728	1733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
38	NC_011274	ATC	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351348
39	NC_011274	TTG	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351348
40	NC_011274	TCG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
41	NC_011274	ACT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351348
42	NC_011274	CGC	2	6	2008	2013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
43	NC_011274	CTG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
44	NC_011274	TGA	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351348
45	NC_011274	GAC	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351348
46	NC_011274	GCC	2	6	2414	2419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
47	NC_011274	TGA	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351348
48	NC_011274	TAT	2	6	2576	2581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351348
49	NC_011274	TGC	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
50	NC_011274	ATG	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351348
51	NC_011274	CGG	3	9	2631	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
52	NC_011274	AGC	2	6	2807	2812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351349
53	NC_011274	GCC	2	6	2858	2863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351349
54	NC_011274	CGT	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351349
55	NC_011274	CGC	2	6	3002	3007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351349
56	NC_011274	GCA	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351349
57	NC_011274	TGA	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351349
58	NC_011274	GAA	2	6	3156	3161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351349
59	NC_011274	ATT	2	6	3168	3173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351349
60	NC_011274	CAG	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351349
61	NC_011274	TGA	2	6	3194	3199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351349
62	NC_011274	GCC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351349
63	NC_011274	TGA	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351349
64	NC_011274	CGG	2	6	3595	3600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351349
65	NC_011274	AGT	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351349
66	NC_011274	CAG	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351350
67	NC_011274	TGA	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351350
68	NC_011274	GCA	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351350
69	NC_011274	CGG	2	6	3950	3955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351350
70	NC_011274	GCG	2	6	3988	3993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351350
71	NC_011274	GTC	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351350
72	NC_011274	GGC	2	6	4143	4148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351350
73	NC_011274	TGA	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351350
74	NC_011274	GAA	2	6	4221	4226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351350
75	NC_011274	GCC	2	6	4273	4278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351350
76	NC_011274	CTA	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351350
77	NC_011274	CTG	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351350
78	NC_011274	CGC	2	6	4433	4438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351350
79	NC_011274	GGA	2	6	4559	4564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351350
80	NC_011274	CCG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351350
81	NC_011274	GCG	2	6	4608	4613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351350
82	NC_011274	ACA	2	6	4631	4636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351350
83	NC_011274	GCG	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351350
84	NC_011274	GCT	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351350
85	NC_011274	CAT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351350
86	NC_011274	GCC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351350
87	NC_011274	TGA	3	9	4891	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351350
88	NC_011274	GTG	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011274	TCA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351351
90	NC_011274	AAT	2	6	5118	5123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351351
91	NC_011274	TCA	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351351
92	NC_011274	ACC	2	6	5167	5172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351351
93	NC_011274	TCA	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351351
94	NC_011274	TTC	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351351
95	NC_011274	CAC	3	9	5274	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351351
96	NC_011274	TGT	2	6	5458	5463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351351
97	NC_011274	CGT	2	6	5483	5488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351351
98	NC_011274	GCG	2	6	5645	5650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351351
99	NC_011274	GCT	2	6	5678	5683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351351
100	NC_011274	CGC	2	6	5821	5826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011274	ACC	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351352
102	NC_011274	CAA	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351352
103	NC_011274	TGA	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351352
104	NC_011274	CGA	2	6	6191	6196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351352
105	NC_011274	CAG	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351352
106	NC_011274	ATC	2	6	6337	6342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351352
107	NC_011274	GAT	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351352
108	NC_011274	ACG	2	6	6425	6430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351352
109	NC_011274	GAT	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351352
110	NC_011274	GCG	2	6	6752	6757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351352
111	NC_011274	CGA	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351352
112	NC_011274	GCC	2	6	6903	6908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351352
113	NC_011274	AGG	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351352
114	NC_011274	ATG	2	6	6985	6990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351352
115	NC_011274	GCG	2	6	7030	7035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351352
116	NC_011274	GCC	2	6	7116	7121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351352
117	NC_011274	AGC	2	6	7222	7227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351352
118	NC_011274	TAA	2	6	7262	7267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351352
119	NC_011274	TTG	2	6	7298	7303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011274	TGA	2	6	7318	7323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011274	ATG	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011274	CGG	2	6	7395	7400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011274	CGT	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011274	ATC	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011274	CAC	2	6	7587	7592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351353
126	NC_011274	AGC	2	6	7733	7738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351353
127	NC_011274	AGC	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351353
128	NC_011274	CAG	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351353
129	NC_011274	GTT	2	6	7762	7767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351353
130	NC_011274	ATG	2	6	7913	7918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351353
131	NC_011274	AAG	2	6	7997	8002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351353
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