MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl27

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011265	GAT	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011265	TAA	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011265	TAA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011265	ATT	2	6	1465	1470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011265	ACA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011265	ATG	3	9	1573	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011265	AGG	2	6	2032	2037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011265	TAT	2	6	2476	2481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011265	ATT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011265	TAT	2	6	2494	2499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011265	TGT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011265	CTT	2	6	2653	2658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011265	TAT	2	6	2670	2675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011265	GCA	2	6	3612	3617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011265	ATT	2	6	4368	4373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011265	AGT	3	9	5024	5032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011265	TCT	2	6	6943	6948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011265	TAT	2	6	6998	7003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011265	AAT	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011265	ATT	2	6	7034	7039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011265	GAG	2	6	10355	10360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011265	AGG	2	6	14483	14488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011265	AGA	2	6	15382	15387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011265	CGT	2	6	15511	15516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011265	TAT	2	6	15528	15533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011265	GGC	2	6	15555	15560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011265	CGG	2	6	15567	15572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011265	TGC	2	6	15585	15590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011265	AGA	2	6	15693	15698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011265	AGA	2	6	15759	15764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011265	CAA	2	6	15816	15821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011265	GAA	2	6	15823	15828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011265	ATT	2	6	15877	15882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011265	GAT	2	6	15883	15888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011265	TGC	3	9	15891	15899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011265	GTA	2	6	15907	15912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011265	TGA	2	6	16071	16076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011265	AGA	2	6	16113	16118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011265	AAT	2	6	16129	16134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011265	GAC	2	6	16251	16256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011265	CAC	2	6	16276	16281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_011265	ACT	2	6	16287	16292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011265	AGG	2	6	16340	16345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011265	TAT	2	6	18737	18742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011265	TTA	2	6	18751	18756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011265	AGG	2	6	19995	20000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011265	TAT	2	6	21566	21571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011265	ATT	2	6	21572	21577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011265	GAT	2	6	21597	21602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011265	ATT	3	9	21658	21666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011265	ATT	2	6	21693	21698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011265	ACA	2	6	21972	21977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011265	ATT	2	6	22075	22080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011265	TGT	2	6	23816	23821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011265	ATT	2	6	23846	23851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011265	CTT	2	6	24018	24023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011265	TTA	2	6	24033	24038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011265	ACC	2	6	24062	24067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011265	CAA	2	6	24102	24107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011265	TAC	3	9	24108	24116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011265	ATA	2	6	24120	24125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011265	TAA	2	6	24132	24137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011265	TAA	2	6	27325	27330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011265	TAA	2	6	27362	27367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011265	ATT	2	6	27422	27427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.