MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl27

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011265	AG	3	6	774	779	50 %	0 %	50 %	0 %	203288912
2	NC_011265	AT	3	6	1154	1159	50 %	50 %	0 %	0 %	203288912
3	NC_011265	GT	3	6	1430	1435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011265	GA	3	6	1725	1730	50 %	0 %	50 %	0 %	203288913
5	NC_011265	AT	3	6	2045	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	203288914
6	NC_011265	AT	3	6	2863	2868	50 %	50 %	0 %	0 %	203288915
7	NC_011265	TC	3	6	3542	3547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011265	GA	3	6	3717	3722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011265	TC	3	6	4164	4169	0 %	50 %	0 %	50 %	203288916
10	NC_011265	AT	3	6	4358	4363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011265	GA	5	10	4828	4837	50 %	0 %	50 %	0 %	203288917
12	NC_011265	AT	3	6	5016	5021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011265	AT	3	6	5659	5664	50 %	50 %	0 %	0 %	203288918
14	NC_011265	TA	3	6	7151	7156	50 %	50 %	0 %	0 %	203288920
15	NC_011265	TG	3	6	7406	7411	0 %	50 %	50 %	0 %	203288920
16	NC_011265	AT	3	6	7442	7447	50 %	50 %	0 %	0 %	203288920
17	NC_011265	AT	3	6	7520	7525	50 %	50 %	0 %	0 %	203288920
18	NC_011265	GT	3	6	12790	12795	0 %	50 %	50 %	0 %	203288928
19	NC_011265	AC	4	8	14535	14542	50 %	0 %	0 %	50 %	203288931
20	NC_011265	AT	3	6	14714	14719	50 %	50 %	0 %	0 %	203288931
21	NC_011265	AC	3	6	14982	14987	50 %	0 %	0 %	50 %	203288932
22	NC_011265	AT	3	6	15138	15143	50 %	50 %	0 %	0 %	203288932
23	NC_011265	AT	3	6	15246	15251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011265	GT	3	6	16489	16494	0 %	50 %	50 %	0 %	203288933
25	NC_011265	TA	3	6	17240	17245	50 %	50 %	0 %	0 %	203288934
26	NC_011265	TA	3	6	17257	17262	50 %	50 %	0 %	0 %	203288934
27	NC_011265	TA	3	6	17755	17760	50 %	50 %	0 %	0 %	203288934
28	NC_011265	AT	3	6	17992	17997	50 %	50 %	0 %	0 %	203288934
29	NC_011265	TA	3	6	18490	18495	50 %	50 %	0 %	0 %	203288935
30	NC_011265	CA	3	6	18550	18555	50 %	0 %	0 %	50 %	203288935
31	NC_011265	CA	3	6	18936	18941	50 %	0 %	0 %	50 %	203288936
32	NC_011265	CT	3	6	19392	19397	0 %	50 %	0 %	50 %	203288937
33	NC_011265	AC	3	6	19417	19422	50 %	0 %	0 %	50 %	203288937
34	NC_011265	AT	3	6	19979	19984	50 %	50 %	0 %	0 %	203288937
35	NC_011265	TA	3	6	21530	21535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011265	TA	3	6	21546	21551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011265	TA	3	6	21874	21879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011265	AT	4	8	22368	22375	50 %	50 %	0 %	0 %	203288940
39	NC_011265	TA	3	6	22414	22419	50 %	50 %	0 %	0 %	203288940
40	NC_011265	TA	3	6	22779	22784	50 %	50 %	0 %	0 %	203288941
41	NC_011265	AT	3	6	22943	22948	50 %	50 %	0 %	0 %	203288942
42	NC_011265	CT	3	6	23679	23684	0 %	50 %	0 %	50 %	203288942
43	NC_011265	TA	3	6	23892	23897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011265	TA	3	6	23933	23938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011265	AT	4	8	24155	24162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011265	TA	3	6	24180	24185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011265	TA	3	6	24947	24952	50 %	50 %	0 %	0 %	203288944
48	NC_011265	TA	3	6	25262	25267	50 %	50 %	0 %	0 %	203288944
49	NC_011265	AT	3	6	26373	26378	50 %	50 %	0 %	0 %	203288946
50	NC_011265	AG	3	6	26731	26736	50 %	0 %	50 %	0 %	203288946
51	NC_011265	TC	3	6	27045	27050	0 %	50 %	0 %	50 %	203288946
52	NC_011265	TA	3	6	27214	27219	50 %	50 %	0 %	0 %	203288946

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.