MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl32

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011264	AATTT	2	10	216	225	40 %	60 %	0 %	0 %	203288889
2	NC_011264	AATAA	2	10	468	477	80 %	20 %	0 %	0 %	203288889
3	NC_011264	AAATA	2	10	1400	1409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011264	CTTTA	2	10	1463	1472	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011264	TCTAC	2	10	4916	4925	20 %	40 %	0 %	40 %	203288891
6	NC_011264	ATAAA	2	10	5862	5871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011264	TATCT	2	10	5896	5905	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011264	TCACA	2	10	6427	6436	40 %	20 %	0 %	40 %	203288892
9	NC_011264	TTCTT	2	10	6732	6741	0 %	80 %	0 %	20 %	203288892
10	NC_011264	TATCT	2	10	9123	9132	20 %	60 %	0 %	20 %	203288893
11	NC_011264	AAATA	2	10	9603	9612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011264	AAAAT	2	10	9625	9634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011264	TTATT	2	10	9689	9698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011264	TCCTC	2	10	10640	10649	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_011264	CTTTT	2	10	10842	10851	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011264	CCTTT	2	10	11727	11736	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011264	TCCCT	2	10	12011	12020	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_011264	TACCT	2	10	13850	13859	20 %	40 %	0 %	40 %	203288895
19	NC_011264	TAAAT	2	10	15281	15290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011264	ATTAT	2	10	15627	15636	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011264	AAAAT	2	10	16389	16398	80 %	20 %	0 %	0 %	203288898
22	NC_011264	ATTTA	2	10	17843	17852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011264	TAAAT	2	10	17880	17889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011264	ATCAA	2	10	18033	18042	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011264	TTATC	2	10	18252	18261	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011264	TTAAG	2	10	18309	18318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011264	TTAGT	2	10	19154	19163	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011264	CATAT	2	10	21603	21612	40 %	40 %	0 %	20 %	203288903
29	NC_011264	ATTAT	2	10	21817	21826	40 %	60 %	0 %	0 %	203288904
30	NC_011264	TAAAT	2	10	24749	24758	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011264	AGATA	2	10	25211	25220	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011264	ATGTA	2	10	26140	26149	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011264	GAAGG	2	10	26240	26249	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011264	AATTT	2	10	27618	27627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011264	ATATT	2	10	28665	28674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011264	TAGTA	2	10	28889	28898	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011264	GTTTT	2	10	28918	28927	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011264	GGATT	2	10	29086	29095	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011264	ATAGT	2	10	31107	31116	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011264	TTTTA	2	10	31138	31147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011264	GGATT	2	10	31305	31314	20 %	40 %	40 %	0 %	203288910
42	NC_011264	TATTT	2	10	31432	31441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011264	TATAT	2	10	31503	31512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.