MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl32

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011264	ATTA	2	8	316	323	50 %	50 %	0 %	0 %	203288889
2	NC_011264	CATT	2	8	360	367	25 %	50 %	0 %	25 %	203288889
3	NC_011264	TTGT	2	8	389	396	0 %	75 %	25 %	0 %	203288889
4	NC_011264	TTCT	2	8	441	448	0 %	75 %	0 %	25 %	203288889
5	NC_011264	TAAA	2	8	870	877	75 %	25 %	0 %	0 %	203288889
6	NC_011264	TTAA	2	8	3644	3651	50 %	50 %	0 %	0 %	203288890
7	NC_011264	TTCC	2	8	4548	4555	0 %	50 %	0 %	50 %	203288890
8	NC_011264	ATTC	2	8	4645	4652	25 %	50 %	0 %	25 %	203288890
9	NC_011264	TTAT	2	8	4892	4899	25 %	75 %	0 %	0 %	203288891
10	NC_011264	CTTA	2	8	4957	4964	25 %	50 %	0 %	25 %	203288891
11	NC_011264	ATTT	2	8	5601	5608	25 %	75 %	0 %	0 %	203288891
12	NC_011264	CTTA	2	8	6092	6099	25 %	50 %	0 %	25 %	203288892
13	NC_011264	ATTT	2	8	6694	6701	25 %	75 %	0 %	0 %	203288892
14	NC_011264	ATTC	2	8	7055	7062	25 %	50 %	0 %	25 %	203288892
15	NC_011264	ACTT	2	8	8449	8456	25 %	50 %	0 %	25 %	203288893
16	NC_011264	ACTA	2	8	8832	8839	50 %	25 %	0 %	25 %	203288893
17	NC_011264	CTTC	2	8	9266	9273	0 %	50 %	0 %	50 %	203288893
18	NC_011264	TACT	2	8	12782	12789	25 %	50 %	0 %	25 %	203288894
19	NC_011264	TCCT	2	8	12840	12847	0 %	50 %	0 %	50 %	203288894
20	NC_011264	ATTA	2	8	13135	13142	50 %	50 %	0 %	0 %	203288895
21	NC_011264	TCCT	2	8	13385	13392	0 %	50 %	0 %	50 %	203288895
22	NC_011264	TCTT	2	8	13398	13405	0 %	75 %	0 %	25 %	203288895
23	NC_011264	AAAC	2	8	15003	15010	75 %	0 %	0 %	25 %	203288896
24	NC_011264	ATCC	2	8	15047	15054	25 %	25 %	0 %	50 %	203288896
25	NC_011264	TTCT	2	8	15569	15576	0 %	75 %	0 %	25 %	203288897
26	NC_011264	TATT	2	8	16756	16763	25 %	75 %	0 %	0 %	203288899
27	NC_011264	CTTG	2	8	16789	16796	0 %	50 %	25 %	25 %	203288899
28	NC_011264	TAAT	2	8	16828	16835	50 %	50 %	0 %	0 %	203288899
29	NC_011264	TACT	2	8	17113	17120	25 %	50 %	0 %	25 %	203288899
30	NC_011264	TCCT	2	8	17287	17294	0 %	50 %	0 %	50 %	203288899
31	NC_011264	TAAA	2	8	17476	17483	75 %	25 %	0 %	0 %	203288899
32	NC_011264	TAAG	2	8	20033	20040	50 %	25 %	25 %	0 %	203288901
33	NC_011264	TTTC	2	8	20170	20177	0 %	75 %	0 %	25 %	203288901
34	NC_011264	TTGA	2	8	21034	21041	25 %	50 %	25 %	0 %	203288902
35	NC_011264	GAAT	2	8	21204	21211	50 %	25 %	25 %	0 %	203288903
36	NC_011264	ATCT	2	8	21370	21377	25 %	50 %	0 %	25 %	203288903
37	NC_011264	TAAA	2	8	21394	21401	75 %	25 %	0 %	0 %	203288903
38	NC_011264	TTGT	2	8	21948	21955	0 %	75 %	25 %	0 %	203288904
39	NC_011264	TATT	2	8	21988	21995	25 %	75 %	0 %	0 %	203288904
40	NC_011264	TATG	2	8	22008	22015	25 %	50 %	25 %	0 %	203288904
41	NC_011264	TTAG	2	8	22126	22133	25 %	50 %	25 %	0 %	203288904
42	NC_011264	ATTT	2	8	23348	23355	25 %	75 %	0 %	0 %	203288905
43	NC_011264	GATA	2	8	23397	23404	50 %	25 %	25 %	0 %	203288905
44	NC_011264	TGAT	2	8	23924	23931	25 %	50 %	25 %	0 %	203288905
45	NC_011264	ATTA	2	8	23934	23941	50 %	50 %	0 %	0 %	203288905
46	NC_011264	TGAT	2	8	24254	24261	25 %	50 %	25 %	0 %	203288905
47	NC_011264	TGTT	2	8	27696	27703	0 %	75 %	25 %	0 %	203288906
48	NC_011264	AGAA	2	8	27813	27820	75 %	0 %	25 %	0 %	203288906
49	NC_011264	ATGA	2	8	28163	28170	50 %	25 %	25 %	0 %	203288906
50	NC_011264	GAAG	2	8	29652	29659	50 %	0 %	50 %	0 %	203288907
51	NC_011264	AATT	2	8	30048	30055	50 %	50 %	0 %	0 %	203288908
52	NC_011264	AATA	2	8	30067	30074	75 %	25 %	0 %	0 %	203288908
53	NC_011264	GATT	2	8	30235	30242	25 %	50 %	25 %	0 %	203288908
54	NC_011264	AGAT	2	8	30252	30259	50 %	25 %	25 %	0 %	203288908
55	NC_011264	AGAT	2	8	30285	30292	50 %	25 %	25 %	0 %	203288908
56	NC_011264	AATT	2	8	30487	30494	50 %	50 %	0 %	0 %	203288908
57	NC_011264	AAGT	2	8	30514	30521	50 %	25 %	25 %	0 %	203288908
58	NC_011264	ATTT	2	8	30742	30749	25 %	75 %	0 %	0 %	203288909
59	NC_011264	TGAT	2	8	30773	30780	25 %	50 %	25 %	0 %	203288909

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.