MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl32

Total Repeats: 282

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011264	TAT	2	6	49	54	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
2	NC_011264	TAA	2	6	102	107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
3	NC_011264	TCC	2	6	210	215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288889
4	NC_011264	CAA	2	6	270	275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288889
5	NC_011264	CTA	3	9	348	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
6	NC_011264	TCT	2	6	434	439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288889
7	NC_011264	TTA	2	6	491	496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
8	NC_011264	TCA	2	6	497	502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
9	NC_011264	TAA	2	6	604	609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
10	NC_011264	TTA	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
11	NC_011264	TCC	2	6	682	687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288889
12	NC_011264	TAC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
13	NC_011264	TCA	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
14	NC_011264	ACA	2	6	758	763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288889
15	NC_011264	ATT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
16	NC_011264	ACA	2	6	779	784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288889
17	NC_011264	TAT	2	6	813	818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
18	NC_011264	AAT	2	6	821	826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
19	NC_011264	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
20	NC_011264	CTT	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
21	NC_011264	TGC	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
22	NC_011264	CTG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
23	NC_011264	CTT	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
24	NC_011264	TCC	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
25	NC_011264	CTG	3	9	3786	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
26	NC_011264	CCT	2	6	3833	3838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
27	NC_011264	CAT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
28	NC_011264	ATT	2	6	3914	3919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288890
29	NC_011264	TCT	2	6	3932	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
30	NC_011264	CTG	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
31	NC_011264	TAT	2	6	3955	3960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288890
32	NC_011264	CTG	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
33	NC_011264	CTG	2	6	3999	4004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
34	NC_011264	ACT	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
35	NC_011264	TTG	2	6	4332	4337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288890
36	NC_011264	TTA	2	6	4385	4390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288890
37	NC_011264	CTT	2	6	4490	4495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
38	NC_011264	TCC	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
39	NC_011264	TCC	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
40	NC_011264	CAT	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
41	NC_011264	CAT	4	12	4591	4602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
42	NC_011264	AAT	2	6	4604	4609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288890
43	NC_011264	CTA	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288891
44	NC_011264	TCC	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288891
45	NC_011264	ATC	3	9	5116	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288891
46	NC_011264	AGC	3	9	5131	5139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288891
47	NC_011264	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288891
48	NC_011264	ATT	2	6	5179	5184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288891
49	NC_011264	AGC	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288891
50	NC_011264	CAT	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288891
51	NC_011264	TAG	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288891
52	NC_011264	AGC	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288891
53	NC_011264	CTT	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288891
54	NC_011264	TCA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288891
55	NC_011264	TTC	2	6	5579	5584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288891
56	NC_011264	TTC	2	6	5663	5668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288891
57	NC_011264	CAA	2	6	5715	5720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288891
58	NC_011264	ACC	2	6	5785	5790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288891
59	NC_011264	CAA	2	6	5803	5808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288891
60	NC_011264	ATT	7	21	5810	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288891
61	NC_011264	CTG	2	6	6109	6114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288892
62	NC_011264	AAC	2	6	6131	6136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288892
63	NC_011264	ATT	2	6	6140	6145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288892
64	NC_011264	ACC	2	6	6173	6178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288892
65	NC_011264	TCC	2	6	6203	6208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288892
66	NC_011264	TAG	2	6	6262	6267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288892
67	NC_011264	CTC	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288892
68	NC_011264	TGC	2	6	6344	6349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288892
69	NC_011264	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288892
70	NC_011264	ATT	3	9	6395	6403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288892
71	NC_011264	AAT	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288892
72	NC_011264	ATC	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
73	NC_011264	TAC	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
74	NC_011264	CTA	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
75	NC_011264	CAG	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288892
76	NC_011264	TAT	2	6	6665	6670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288892
77	NC_011264	CAG	2	6	6703	6708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288892
78	NC_011264	GCA	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288892
79	NC_011264	TTA	2	6	6762	6767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288892
80	NC_011264	AAT	2	6	6811	6816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288892
81	NC_011264	CTT	2	6	6830	6835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288892
82	NC_011264	ATG	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288892
83	NC_011264	TTC	2	6	6902	6907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288892
84	NC_011264	TTC	2	6	6939	6944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288892
85	NC_011264	CTC	2	6	6955	6960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288892
86	NC_011264	CTC	2	6	6964	6969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288892
87	NC_011264	CAT	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
88	NC_011264	CAT	3	9	6992	7000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
89	NC_011264	TAC	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
90	NC_011264	TCC	2	6	8643	8648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288893
91	NC_011264	CCT	2	6	8674	8679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288893
92	NC_011264	AGC	3	9	8736	8744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288893
93	NC_011264	CAG	2	6	8750	8755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288893
94	NC_011264	CAA	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288893
95	NC_011264	TCA	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
96	NC_011264	GCA	2	6	8816	8821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288893
97	NC_011264	CTA	3	9	8837	8845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
98	NC_011264	GCT	2	6	8857	8862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288893
99	NC_011264	CTT	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288893
100	NC_011264	CAC	2	6	8879	8884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288893
101	NC_011264	AGC	2	6	8895	8900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288893
102	NC_011264	AAT	2	6	8902	8907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288893
103	NC_011264	GCA	2	6	9034	9039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288893
104	NC_011264	CAC	2	6	9065	9070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288893
105	NC_011264	ATC	2	6	9078	9083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
106	NC_011264	TGC	2	6	9099	9104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288893
107	NC_011264	TAA	2	6	9143	9148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288893
108	NC_011264	CTC	2	6	9150	9155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288893
109	NC_011264	TTC	2	6	9187	9192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288893
110	NC_011264	TAG	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288893
111	NC_011264	CTC	2	6	9395	9400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288893
112	NC_011264	CAT	2	6	9414	9419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
113	NC_011264	CAT	3	9	9423	9431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
114	NC_011264	CAT	2	6	9435	9440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
115	NC_011264	TAT	2	6	9441	9446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288893
116	NC_011264	CTT	2	6	9464	9469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288893
117	NC_011264	TTC	2	6	9485	9490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288893
118	NC_011264	CTT	2	6	12286	12291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
119	NC_011264	AGT	2	6	12294	12299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288894
120	NC_011264	TTA	2	6	12340	12345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288894
121	NC_011264	TCA	2	6	12361	12366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288894
122	NC_011264	CTT	2	6	12368	12373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
123	NC_011264	CTT	2	6	12461	12466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
124	NC_011264	ATT	2	6	12549	12554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288894
125	NC_011264	CAA	2	6	12576	12581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288894
126	NC_011264	CAA	2	6	12659	12664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288894
127	NC_011264	CCA	2	6	12667	12672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288894
128	NC_011264	TCA	2	6	12709	12714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288894
129	NC_011264	CTT	2	6	12737	12742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
130	NC_011264	CTT	2	6	12819	12824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
131	NC_011264	ATT	2	6	12858	12863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288894
132	NC_011264	CAT	3	9	12882	12890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288894
133	NC_011264	ATC	2	6	12892	12897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288894
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135	NC_011264	TGC	2	6	13292	13297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288895
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.