MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl6

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011263	ATTC	2	8	18	25	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011263	ACTT	2	8	113	120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011263	TAAA	2	8	2023	2030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011263	AAAT	2	8	2055	2062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011263	AAAC	2	8	2215	2222	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011263	TAAA	2	8	2804	2811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011263	CAAA	2	8	2879	2886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011263	AGCA	2	8	2916	2923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011263	AATA	2	8	3350	3357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011263	TAAA	2	8	4111	4118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011263	ATGA	2	8	4143	4150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011263	ATCC	2	8	4316	4323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011263	TATT	2	8	4583	4590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011263	TTCT	2	8	4797	4804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011263	GAAT	2	8	4847	4854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011263	TATT	2	8	4910	4917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011263	GAGC	2	8	5014	5021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011263	TTAT	2	8	5067	5074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011263	CTGC	2	8	5514	5521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011263	CCCT	2	8	5709	5716	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_011263	CGGC	2	8	6030	6037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.