MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl6

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011263	TAT	2	6	46	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011263	TAT	3	9	130	138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011263	CAA	2	6	193	198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288466
4	NC_011263	AAC	3	9	280	288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288466
5	NC_011263	GAA	2	6	302	307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288466
6	NC_011263	TAA	2	6	330	335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288466
7	NC_011263	ATA	2	6	356	361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288466
8	NC_011263	CTA	2	6	428	433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288466
9	NC_011263	TTA	2	6	533	538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288466
10	NC_011263	TCC	2	6	569	574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288466
11	NC_011263	AGC	2	6	849	854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288467
12	NC_011263	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288467
13	NC_011263	TTC	2	6	936	941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288467
14	NC_011263	ATA	2	6	960	965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
15	NC_011263	TAA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
16	NC_011263	AAC	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288467
17	NC_011263	TAG	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288467
18	NC_011263	ATC	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288467
19	NC_011263	TAA	2	6	1097	1102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
20	NC_011263	TTA	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288467
21	NC_011263	TTC	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288467
22	NC_011263	AAT	2	6	1197	1202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
23	NC_011263	ATC	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288467
24	NC_011263	AAG	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288467
25	NC_011263	AGA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288467
26	NC_011263	ATT	2	6	1441	1446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288467
27	NC_011263	ATT	2	6	1504	1509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288467
28	NC_011263	ATT	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011263	GAG	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011263	TTA	2	6	1778	1783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011263	ATT	2	6	1794	1799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011263	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011263	AGA	2	6	1876	1881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011263	AAG	2	6	1926	1931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011263	TCC	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011263	ATC	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011263	TAT	2	6	2083	2088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011263	CAT	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011263	CAA	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288468
40	NC_011263	CAT	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288468
41	NC_011263	TAT	2	6	2481	2486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288468
42	NC_011263	AGA	2	6	2574	2579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288468
43	NC_011263	ATT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288468
44	NC_011263	AGA	2	6	2622	2627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288468
45	NC_011263	TAG	2	6	2670	2675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288468
46	NC_011263	ATA	3	9	2693	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288468
47	NC_011263	ATA	2	6	2705	2710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288468
48	NC_011263	ACA	2	6	2733	2738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288468
49	NC_011263	ACA	2	6	2742	2747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288468
50	NC_011263	TTA	2	6	2905	2910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011263	TAA	2	6	3078	3083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011263	CAA	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011263	ATT	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011263	ATA	2	6	3582	3587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011263	TAA	2	6	3619	3624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011263	ATT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011263	ATT	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011263	TAT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011263	AAT	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011263	ATT	2	6	4125	4130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011263	ATA	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011263	TCA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011263	TCA	2	6	4451	4456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011263	CAA	2	6	4494	4499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011263	CAA	2	6	4620	4625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011263	CAT	2	6	4723	4728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011263	ATT	2	6	4750	4755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011263	ATT	2	6	4823	4828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011263	ATA	2	6	4829	4834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011263	TAA	2	6	4894	4899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011263	AAG	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011263	CTT	2	6	5035	5040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011263	TAT	3	9	5046	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011263	ATA	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011263	ATA	2	6	5200	5205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011263	AAT	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011263	TAA	3	9	5216	5224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011263	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011263	TAA	2	6	5261	5266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011263	TCC	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011263	CCG	3	9	5297	5305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011263	CCT	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011263	AAC	2	6	5531	5536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011263	CGA	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011263	CTC	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011263	GCC	2	6	5729	5734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_011263	CTC	2	6	5748	5753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011263	CGG	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.