MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl6

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011263	CAA	2	6	193	198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288466
2	NC_011263	AAC	3	9	280	288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288466
3	NC_011263	GAA	2	6	302	307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288466
4	NC_011263	TAA	2	6	330	335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288466
5	NC_011263	ATA	2	6	356	361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288466
6	NC_011263	CTA	2	6	428	433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288466
7	NC_011263	TTA	2	6	533	538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288466
8	NC_011263	TCC	2	6	569	574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288466
9	NC_011263	AGC	2	6	849	854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288467
10	NC_011263	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288467
11	NC_011263	TTC	2	6	936	941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288467
12	NC_011263	ATA	2	6	960	965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
13	NC_011263	TAA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
14	NC_011263	AAC	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288467
15	NC_011263	TAG	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288467
16	NC_011263	ATC	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288467
17	NC_011263	TAA	2	6	1097	1102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
18	NC_011263	TTA	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288467
19	NC_011263	TTC	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288467
20	NC_011263	AAT	2	6	1197	1202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
21	NC_011263	ATC	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288467
22	NC_011263	AAG	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288467
23	NC_011263	AGA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288467
24	NC_011263	ATT	2	6	1441	1446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288467
25	NC_011263	ATT	2	6	1504	1509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288467
26	NC_011263	CAA	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288468
27	NC_011263	CAT	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288468
28	NC_011263	TAT	2	6	2481	2486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288468
29	NC_011263	AGA	2	6	2574	2579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288468
30	NC_011263	ATT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288468
31	NC_011263	AGA	2	6	2622	2627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288468
32	NC_011263	TAG	2	6	2670	2675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288468
33	NC_011263	ATA	3	9	2693	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288468
34	NC_011263	ATA	2	6	2705	2710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288468
35	NC_011263	ACA	2	6	2733	2738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288468
36	NC_011263	ACA	2	6	2742	2747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288468

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.