MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl26

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011261	TTGA	2	8	58	65	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011261	TTGT	2	8	129	136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011261	ATTT	2	8	195	202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011261	TAAA	2	8	283	290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011261	GAAT	2	8	376	383	50 %	25 %	25 %	0 %	203288833
6	NC_011261	TCAA	2	8	480	487	50 %	25 %	0 %	25 %	203288833
7	NC_011261	AAAT	2	8	665	672	75 %	25 %	0 %	0 %	203288833
8	NC_011261	GTCA	2	8	831	838	25 %	25 %	25 %	25 %	203288833
9	NC_011261	TAAA	2	8	1080	1087	75 %	25 %	0 %	0 %	203288833
10	NC_011261	ATTT	2	8	1331	1338	25 %	75 %	0 %	0 %	203288834
11	NC_011261	TTAA	2	8	2367	2374	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
12	NC_011261	ATTA	2	8	2388	2395	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
13	NC_011261	TTTA	2	8	3128	3135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011261	ATGC	2	8	3244	3251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011261	GTAA	2	8	3586	3593	50 %	25 %	25 %	0 %	203288837
16	NC_011261	GAAT	2	8	3633	3640	50 %	25 %	25 %	0 %	203288837
17	NC_011261	AATT	2	8	3749	3756	50 %	50 %	0 %	0 %	203288837
18	NC_011261	TATT	2	8	3864	3871	25 %	75 %	0 %	0 %	203288837
19	NC_011261	TGGT	2	8	3981	3988	0 %	50 %	50 %	0 %	203288837
20	NC_011261	TTAT	2	8	5977	5984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011261	ATGT	2	8	6056	6063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011261	ACAT	2	8	6105	6112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011261	AATA	2	8	6475	6482	75 %	25 %	0 %	0 %	203288840
24	NC_011261	TATT	2	8	6567	6574	25 %	75 %	0 %	0 %	203288840
25	NC_011261	TCTG	2	8	6875	6882	0 %	50 %	25 %	25 %	203288840
26	NC_011261	TAAA	2	8	6931	6938	75 %	25 %	0 %	0 %	203288840
27	NC_011261	TTCT	2	8	7305	7312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011261	CTTT	2	8	7472	7479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011261	ATTT	2	8	7512	7519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011261	ATTC	2	8	7720	7727	25 %	50 %	0 %	25 %	203288841
31	NC_011261	TATT	2	8	8027	8034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011261	AATT	2	8	8081	8088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011261	ATGT	2	8	8219	8226	25 %	50 %	25 %	0 %	203288842
34	NC_011261	AGAA	2	8	8561	8568	75 %	0 %	25 %	0 %	203288842
35	NC_011261	TAAA	2	8	8793	8800	75 %	25 %	0 %	0 %	203288843
36	NC_011261	TTAT	2	8	8896	8903	25 %	75 %	0 %	0 %	203288843
37	NC_011261	TTAT	2	8	9156	9163	25 %	75 %	0 %	0 %	203288843
38	NC_011261	AGAT	2	8	10361	10368	50 %	25 %	25 %	0 %	203288844
39	NC_011261	AGAT	2	8	10415	10422	50 %	25 %	25 %	0 %	203288844
40	NC_011261	ATAA	2	8	10609	10616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011261	TTAT	2	8	10796	10803	25 %	75 %	0 %	0 %	203288845
42	NC_011261	AATT	2	8	10953	10960	50 %	50 %	0 %	0 %	203288845
43	NC_011261	AGAT	2	8	11210	11217	50 %	25 %	25 %	0 %	203288845
44	NC_011261	ACTT	2	8	11553	11560	25 %	50 %	0 %	25 %	203288845
45	NC_011261	CAAA	2	8	12122	12129	75 %	0 %	0 %	25 %	203288846
46	NC_011261	AGAA	2	8	12472	12479	75 %	0 %	25 %	0 %	203288846
47	NC_011261	GGTT	2	8	13027	13034	0 %	50 %	50 %	0 %	203288847
48	NC_011261	AGAA	2	8	13411	13418	75 %	0 %	25 %	0 %	203288848
49	NC_011261	TCAA	2	8	14588	14595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011261	TTGG	2	8	16472	16479	0 %	50 %	50 %	0 %	203288853
51	NC_011261	CCAT	2	8	16931	16938	25 %	25 %	0 %	50 %	203288854
52	NC_011261	AAGT	2	8	17426	17433	50 %	25 %	25 %	0 %	203288855
53	NC_011261	ATTC	2	8	17911	17918	25 %	50 %	0 %	25 %	203288855
54	NC_011261	TGCA	2	8	18300	18307	25 %	25 %	25 %	25 %	203288855
55	NC_011261	TCAA	2	8	18537	18544	50 %	25 %	0 %	25 %	203288856
56	NC_011261	TAGT	2	8	18634	18641	25 %	50 %	25 %	0 %	203288856
57	NC_011261	AACA	2	8	19101	19108	75 %	0 %	0 %	25 %	203288857
58	NC_011261	TCTA	2	8	19605	19612	25 %	50 %	0 %	25 %	203288858
59	NC_011261	GAAA	2	8	19778	19785	75 %	0 %	25 %	0 %	203288859
60	NC_011261	CAAA	2	8	19802	19809	75 %	0 %	0 %	25 %	203288859
61	NC_011261	GAAA	2	8	21223	21230	75 %	0 %	25 %	0 %	203288860
62	NC_011261	TCAA	2	8	21234	21241	50 %	25 %	0 %	25 %	203288860
63	NC_011261	TTCA	2	8	21329	21336	25 %	50 %	0 %	25 %	203288860
64	NC_011261	TTAG	2	8	21479	21486	25 %	50 %	25 %	0 %	203288860
65	NC_011261	TAAC	2	8	21576	21583	50 %	25 %	0 %	25 %	203288860
66	NC_011261	AAAG	2	8	21590	21597	75 %	0 %	25 %	0 %	203288860
67	NC_011261	ACTA	2	8	22040	22047	50 %	25 %	0 %	25 %	203288861
68	NC_011261	AGTT	2	8	22805	22812	25 %	50 %	25 %	0 %	203288861
69	NC_011261	CTAT	2	8	24174	24181	25 %	50 %	0 %	25 %	203288864
70	NC_011261	TCAT	2	8	25062	25069	25 %	50 %	0 %	25 %	203288865
71	NC_011261	CATT	2	8	25174	25181	25 %	50 %	0 %	25 %	203288865
72	NC_011261	GAAT	2	8	25370	25377	50 %	25 %	25 %	0 %	203288865
73	NC_011261	ATCA	2	8	25680	25687	50 %	25 %	0 %	25 %	203288866
74	NC_011261	ACAG	2	8	26043	26050	50 %	0 %	25 %	25 %	203288866
75	NC_011261	ATTA	2	8	26411	26418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011261	ATGG	2	8	26796	26803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.