MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl26

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011261	GAAT	2	8	376	383	50 %	25 %	25 %	0 %	203288833
2	NC_011261	TCAA	2	8	480	487	50 %	25 %	0 %	25 %	203288833
3	NC_011261	AAAT	2	8	665	672	75 %	25 %	0 %	0 %	203288833
4	NC_011261	GTCA	2	8	831	838	25 %	25 %	25 %	25 %	203288833
5	NC_011261	TAAA	2	8	1080	1087	75 %	25 %	0 %	0 %	203288833
6	NC_011261	ATTT	2	8	1331	1338	25 %	75 %	0 %	0 %	203288834
7	NC_011261	TTAA	2	8	2367	2374	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
8	NC_011261	ATTA	2	8	2388	2395	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
9	NC_011261	GTAA	2	8	3586	3593	50 %	25 %	25 %	0 %	203288837
10	NC_011261	GAAT	2	8	3633	3640	50 %	25 %	25 %	0 %	203288837
11	NC_011261	AATT	2	8	3749	3756	50 %	50 %	0 %	0 %	203288837
12	NC_011261	TATT	2	8	3864	3871	25 %	75 %	0 %	0 %	203288837
13	NC_011261	TGGT	2	8	3981	3988	0 %	50 %	50 %	0 %	203288837
14	NC_011261	AATA	2	8	6475	6482	75 %	25 %	0 %	0 %	203288840
15	NC_011261	TATT	2	8	6567	6574	25 %	75 %	0 %	0 %	203288840
16	NC_011261	TCTG	2	8	6875	6882	0 %	50 %	25 %	25 %	203288840
17	NC_011261	TAAA	2	8	6931	6938	75 %	25 %	0 %	0 %	203288840
18	NC_011261	ATTC	2	8	7720	7727	25 %	50 %	0 %	25 %	203288841
19	NC_011261	ATGT	2	8	8219	8226	25 %	50 %	25 %	0 %	203288842
20	NC_011261	AGAA	2	8	8561	8568	75 %	0 %	25 %	0 %	203288842
21	NC_011261	TAAA	2	8	8793	8800	75 %	25 %	0 %	0 %	203288843
22	NC_011261	TTAT	2	8	8896	8903	25 %	75 %	0 %	0 %	203288843
23	NC_011261	TTAT	2	8	9156	9163	25 %	75 %	0 %	0 %	203288843
24	NC_011261	AGAT	2	8	10361	10368	50 %	25 %	25 %	0 %	203288844
25	NC_011261	AGAT	2	8	10415	10422	50 %	25 %	25 %	0 %	203288844
26	NC_011261	TTAT	2	8	10796	10803	25 %	75 %	0 %	0 %	203288845
27	NC_011261	AATT	2	8	10953	10960	50 %	50 %	0 %	0 %	203288845
28	NC_011261	AGAT	2	8	11210	11217	50 %	25 %	25 %	0 %	203288845
29	NC_011261	ACTT	2	8	11553	11560	25 %	50 %	0 %	25 %	203288845
30	NC_011261	CAAA	2	8	12122	12129	75 %	0 %	0 %	25 %	203288846
31	NC_011261	AGAA	2	8	12472	12479	75 %	0 %	25 %	0 %	203288846
32	NC_011261	GGTT	2	8	13027	13034	0 %	50 %	50 %	0 %	203288847
33	NC_011261	AGAA	2	8	13411	13418	75 %	0 %	25 %	0 %	203288848
34	NC_011261	TTGG	2	8	16472	16479	0 %	50 %	50 %	0 %	203288853
35	NC_011261	CCAT	2	8	16931	16938	25 %	25 %	0 %	50 %	203288854
36	NC_011261	AAGT	2	8	17426	17433	50 %	25 %	25 %	0 %	203288855
37	NC_011261	ATTC	2	8	17911	17918	25 %	50 %	0 %	25 %	203288855
38	NC_011261	TGCA	2	8	18300	18307	25 %	25 %	25 %	25 %	203288855
39	NC_011261	TCAA	2	8	18537	18544	50 %	25 %	0 %	25 %	203288856
40	NC_011261	TAGT	2	8	18634	18641	25 %	50 %	25 %	0 %	203288856
41	NC_011261	AACA	2	8	19101	19108	75 %	0 %	0 %	25 %	203288857
42	NC_011261	TCTA	2	8	19605	19612	25 %	50 %	0 %	25 %	203288858
43	NC_011261	GAAA	2	8	19778	19785	75 %	0 %	25 %	0 %	203288859
44	NC_011261	CAAA	2	8	19802	19809	75 %	0 %	0 %	25 %	203288859
45	NC_011261	GAAA	2	8	21223	21230	75 %	0 %	25 %	0 %	203288860
46	NC_011261	TCAA	2	8	21234	21241	50 %	25 %	0 %	25 %	203288860
47	NC_011261	TTCA	2	8	21329	21336	25 %	50 %	0 %	25 %	203288860
48	NC_011261	TTAG	2	8	21479	21486	25 %	50 %	25 %	0 %	203288860
49	NC_011261	TAAC	2	8	21576	21583	50 %	25 %	0 %	25 %	203288860
50	NC_011261	AAAG	2	8	21590	21597	75 %	0 %	25 %	0 %	203288860
51	NC_011261	ACTA	2	8	22040	22047	50 %	25 %	0 %	25 %	203288861
52	NC_011261	AGTT	2	8	22805	22812	25 %	50 %	25 %	0 %	203288861
53	NC_011261	CTAT	2	8	24174	24181	25 %	50 %	0 %	25 %	203288864
54	NC_011261	TCAT	2	8	25062	25069	25 %	50 %	0 %	25 %	203288865
55	NC_011261	CATT	2	8	25174	25181	25 %	50 %	0 %	25 %	203288865
56	NC_011261	GAAT	2	8	25370	25377	50 %	25 %	25 %	0 %	203288865
57	NC_011261	ATCA	2	8	25680	25687	50 %	25 %	0 %	25 %	203288866
58	NC_011261	ACAG	2	8	26043	26050	50 %	0 %	25 %	25 %	203288866

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.