MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl26

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011261	TGT	2	6	110	115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011261	TAT	2	6	145	150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011261	TGT	2	6	158	163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011261	TTC	2	6	164	169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011261	TAA	2	6	307	312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011261	TTA	3	9	322	330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011261	TTA	3	9	340	348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011261	ATA	2	6	349	354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011261	AGG	2	6	367	372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011261	TGA	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011261	TTG	2	6	3156	3161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011261	GTA	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011261	GTT	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011261	TAT	2	6	3352	3357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011261	TTA	2	6	3410	3415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011261	GAT	2	6	4821	4826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011261	TAA	2	6	4835	4840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011261	TAA	2	6	4850	4855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011261	ATT	2	6	4900	4905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011261	TAT	2	6	5922	5927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011261	ATT	2	6	5932	5937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011261	TAT	2	6	5940	5945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011261	CTC	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011261	CTT	2	6	6245	6250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011261	GTA	2	6	6262	6267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011261	GCA	2	6	7241	7246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011261	ATT	2	6	8016	8021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011261	TCT	2	6	10537	10542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011261	TTA	2	6	10590	10595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011261	ATT	2	6	10627	10632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011261	AGG	2	6	14013	14018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011261	AGG	2	6	18936	18941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011261	TAT	2	6	23512	23517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011261	TTA	2	6	23526	23531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011261	AGG	2	6	24770	24775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011261	TTA	2	6	26376	26381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011261	ATT	2	6	26450	26455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011261	CTA	2	6	26609	26614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011261	ATA	2	6	26648	26653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011261	ACA	2	6	26764	26769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011261	ACA	2	6	26843	26848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011261	ATT	2	6	26867	26872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.