MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl26

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011261	AT	3	6	266	271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011261	AT	3	6	647	652	50 %	50 %	0 %	0 %	203288833
3	NC_011261	AG	3	6	1194	1199	50 %	0 %	50 %	0 %	203288834
4	NC_011261	AT	3	6	1216	1221	50 %	50 %	0 %	0 %	203288834
5	NC_011261	GA	3	6	1296	1301	50 %	0 %	50 %	0 %	203288834
6	NC_011261	TA	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	203288834
7	NC_011261	AT	3	6	1597	1602	50 %	50 %	0 %	0 %	203288834
8	NC_011261	AT	3	6	1848	1853	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
9	NC_011261	TA	3	6	2028	2033	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
10	NC_011261	TA	3	6	2343	2348	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
11	NC_011261	AT	3	6	3053	3058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011261	AT	3	6	3089	3094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011261	AG	3	6	4209	4214	50 %	0 %	50 %	0 %	203288837
14	NC_011261	AT	3	6	4589	4594	50 %	50 %	0 %	0 %	203288837
15	NC_011261	GA	3	6	5158	5163	50 %	0 %	50 %	0 %	203288838
16	NC_011261	TA	3	6	5473	5478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011261	AT	3	6	5491	5496	50 %	50 %	0 %	0 %	203288839
18	NC_011261	AT	3	6	6268	6273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011261	TA	3	6	6300	6305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011261	AT	3	6	6492	6497	50 %	50 %	0 %	0 %	203288840
21	NC_011261	TA	4	8	7122	7129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011261	TC	3	6	7171	7176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011261	GA	3	6	7346	7351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011261	TG	3	6	7740	7745	0 %	50 %	50 %	0 %	203288841
25	NC_011261	AT	3	6	8006	8011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011261	GA	5	10	8476	8485	50 %	0 %	50 %	0 %	203288842
27	NC_011261	AT	3	6	8664	8669	50 %	50 %	0 %	0 %	203288843
28	NC_011261	TA	3	6	10036	10041	50 %	50 %	0 %	0 %	203288844
29	NC_011261	AG	3	6	10127	10132	50 %	0 %	50 %	0 %	203288844
30	NC_011261	TA	3	6	10653	10658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011261	TA	3	6	10744	10749	50 %	50 %	0 %	0 %	203288845
32	NC_011261	TG	3	6	10999	11004	0 %	50 %	50 %	0 %	203288845
33	NC_011261	AT	3	6	11035	11040	50 %	50 %	0 %	0 %	203288845
34	NC_011261	AT	3	6	11113	11118	50 %	50 %	0 %	0 %	203288845
35	NC_011261	GA	3	6	11470	11475	50 %	0 %	50 %	0 %	203288845
36	NC_011261	AT	3	6	16937	16942	50 %	50 %	0 %	0 %	203288854
37	NC_011261	GT	3	6	17029	17034	0 %	50 %	50 %	0 %	203288854
38	NC_011261	TA	4	8	17667	17674	50 %	50 %	0 %	0 %	203288855
39	NC_011261	AC	4	8	18988	18995	50 %	0 %	0 %	50 %	203288857
40	NC_011261	AT	3	6	19167	19172	50 %	50 %	0 %	0 %	203288857
41	NC_011261	AC	3	6	19435	19440	50 %	0 %	0 %	50 %	203288858
42	NC_011261	AT	3	6	19591	19596	50 %	50 %	0 %	0 %	203288858
43	NC_011261	AT	3	6	19699	19704	50 %	50 %	0 %	0 %	203288859
44	NC_011261	GC	3	6	20156	20161	0 %	0 %	50 %	50 %	203288859
45	NC_011261	TA	3	6	20578	20583	50 %	50 %	0 %	0 %	203288859
46	NC_011261	GT	3	6	21249	21254	0 %	50 %	50 %	0 %	203288860
47	NC_011261	TA	3	6	22000	22005	50 %	50 %	0 %	0 %	203288861
48	NC_011261	TA	3	6	22017	22022	50 %	50 %	0 %	0 %	203288861
49	NC_011261	TA	3	6	22103	22108	50 %	50 %	0 %	0 %	203288861
50	NC_011261	TA	3	6	22515	22520	50 %	50 %	0 %	0 %	203288861
51	NC_011261	AT	3	6	22752	22757	50 %	50 %	0 %	0 %	203288861
52	NC_011261	TA	3	6	23262	23267	50 %	50 %	0 %	0 %	203288862
53	NC_011261	CA	3	6	23322	23327	50 %	0 %	0 %	50 %	203288862
54	NC_011261	AC	3	6	24192	24197	50 %	0 %	0 %	50 %	203288864
55	NC_011261	AT	3	6	24754	24759	50 %	50 %	0 %	0 %	203288864
56	NC_011261	AG	3	6	26242	26247	50 %	0 %	50 %	0 %	203288866
57	NC_011261	TA	3	6	26313	26318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011261	AT	3	6	26330	26335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011261	TA	3	6	26666	26671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011261	GA	3	6	26875	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.