MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	TATTTT	2	12	503	514	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011260	TAATTT	2	12	919	930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
3	NC_011260	TCAAAA	2	12	2960	2971	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011260	AAATAA	2	12	3453	3464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011260	TTATTT	2	12	4773	4784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011260	AAATAA	2	12	5518	5529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288439
7	NC_011260	ATAAAA	2	12	5697	5708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288440
8	NC_011260	ATTGCA	2	12	6354	6365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288441
9	NC_011260	TAAAAA	2	12	6993	7004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288442
10	NC_011260	TGAAGG	2	12	7899	7910	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011260	AGTAGC	2	12	8791	8802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	203288443
12	NC_011260	TGGTGC	2	12	9389	9400	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011260	TGGTTT	2	12	12272	12283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011260	TTCTAA	2	12	12585	12596	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288445
15	NC_011260	TAAAAA	2	12	14090	14101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011260	TATCCA	2	12	14985	14996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011260	ATTAAT	2	12	16670	16681	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
18	NC_011260	TTCTCT	2	12	17923	17934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288449
19	NC_011260	AAGAGA	2	12	18822	18833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011260	GATTTA	2	12	20729	20740	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203288450
21	NC_011260	TAATAT	2	12	23633	23644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011260	AAATTA	2	12	24653	24664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288452
23	NC_011260	GCACCA	2	12	27333	27344	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011260	GCTACT	2	12	27935	27946	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011260	TTAAAT	2	12	30030	30041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011260	TAGCAT	2	12	30434	30445	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288454
27	NC_011260	TCACCA	2	12	30850	30861	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	203288454
28	NC_011260	TGTTTT	2	12	32371	32382	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011260	TCATCT	2	12	32567	32578	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011260	TTTGTT	2	12	35072	35083	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011260	TTTATG	2	12	35368	35379	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	203288458
32	NC_011260	CTAAAA	2	12	38956	38967	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288460
33	NC_011260	AAGGAA	2	12	39453	39464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288461
34	NC_011260	TGGTGA	2	12	39546	39557	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	203288461
35	NC_011260	TGATGG	2	12	40862	40873	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	203288462
36	NC_011260	GTTTTT	2	12	41577	41588	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011260	GCAAGT	2	12	42302	42313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011260	GTGATG	3	18	44339	44356	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011260	TGCTGG	2	12	46861	46872	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011260	AAATAA	3	18	47388	47405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011260	ATTGCT	2	12	49861	49872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011260	AGGAGA	2	12	51068	51079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011260	AATGAT	2	12	51243	51254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011260	GTTAAA	2	12	51727	51738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011260	ATTAAA	2	12	51850	51861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.