MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	TAATTT	2	12	919	930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
2	NC_011260	AAATAA	2	12	5518	5529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288439
3	NC_011260	ATAAAA	2	12	5697	5708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288440
4	NC_011260	ATTGCA	2	12	6354	6365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288441
5	NC_011260	TAAAAA	2	12	6993	7004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288442
6	NC_011260	AGTAGC	2	12	8791	8802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	203288443
7	NC_011260	TTCTAA	2	12	12585	12596	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288445
8	NC_011260	ATTAAT	2	12	16670	16681	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
9	NC_011260	TTCTCT	2	12	17923	17934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288449
10	NC_011260	GATTTA	2	12	20729	20740	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203288450
11	NC_011260	AAATTA	2	12	24653	24664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288452
12	NC_011260	TAGCAT	2	12	30434	30445	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288454
13	NC_011260	TCACCA	2	12	30850	30861	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	203288454
14	NC_011260	TTTATG	2	12	35368	35379	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	203288458
15	NC_011260	CTAAAA	2	12	38956	38967	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288460
16	NC_011260	AAGGAA	2	12	39453	39464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288461
17	NC_011260	TGGTGA	2	12	39546	39557	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	203288461
18	NC_011260	TGATGG	2	12	40862	40873	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	203288462

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.