MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	ATAAA	2	10	740	749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011260	TCTTT	2	10	2200	2209	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011260	TCTTT	2	10	2679	2688	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011260	ACAAA	2	10	3285	3294	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011260	TGTGA	2	10	4030	4039	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011260	TATTT	2	10	4233	4242	20 %	80 %	0 %	0 %	203288438
7	NC_011260	ACAAA	2	10	5350	5359	80 %	0 %	0 %	20 %	203288439
8	NC_011260	ATTGT	2	10	7663	7672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011260	GTATA	2	10	8515	8524	40 %	40 %	20 %	0 %	203288443
10	NC_011260	TTAAA	2	10	8937	8946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011260	TATTT	2	10	8979	8988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011260	CAAAA	2	10	9028	9037	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011260	CATAA	2	10	12434	12443	60 %	20 %	0 %	20 %	203288445
14	NC_011260	TATAA	2	10	15237	15246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011260	TAAAA	2	10	15371	15380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011260	AAAAT	2	10	15476	15485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011260	CTTTT	2	10	18064	18073	0 %	80 %	0 %	20 %	203288449
18	NC_011260	TATTT	2	10	18445	18454	20 %	80 %	0 %	0 %	203288449
19	NC_011260	CATTA	2	10	19328	19337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011260	ATGTT	2	10	20057	20066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011260	TTAAA	2	10	22628	22637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011260	TAAAG	2	10	22676	22685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011260	TTAAA	2	10	23160	23169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011260	ATTGA	2	10	24623	24632	40 %	40 %	20 %	0 %	203288452
25	NC_011260	TAAAA	2	10	27747	27756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011260	TTTAA	2	10	27791	27800	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011260	TATAC	2	10	28213	28222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011260	ATTAT	2	10	29293	29302	40 %	60 %	0 %	0 %	203288453
29	NC_011260	ATTCT	2	10	29801	29810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011260	AAATA	2	10	30263	30272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011260	TTATT	3	15	30349	30363	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011260	TTATC	2	10	31079	31088	20 %	60 %	0 %	20 %	203288454
33	NC_011260	TTCTT	2	10	31144	31153	0 %	80 %	0 %	20 %	203288454
34	NC_011260	TTCAT	2	10	31156	31165	20 %	60 %	0 %	20 %	203288454
35	NC_011260	ATAAA	2	10	32110	32119	80 %	20 %	0 %	0 %	203288455
36	NC_011260	TATAT	2	10	33509	33518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011260	ATTTT	2	10	33537	33546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011260	CAAAT	2	10	33736	33745	60 %	20 %	0 %	20 %	203288456
39	NC_011260	TCTTT	2	10	35292	35301	0 %	80 %	0 %	20 %	203288458
40	NC_011260	TAAAA	2	10	35921	35930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011260	AATTA	2	10	36463	36472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011260	TAAAG	2	10	36925	36934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011260	GTTTT	2	10	38422	38431	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011260	GAGAA	2	10	38510	38519	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011260	AAGAA	2	10	38992	39001	80 %	0 %	20 %	0 %	203288460
46	NC_011260	AAGAT	2	10	39265	39274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011260	TTACT	2	10	41780	41789	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011260	GAAAG	2	10	44688	44697	60 %	0 %	40 %	0 %	203288464
49	NC_011260	TTTTA	2	10	45045	45054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011260	AAATG	2	10	45506	45515	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011260	AATAA	2	10	48614	48623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011260	AGGTA	2	10	49519	49528	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011260	TATAA	2	10	50181	50190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011260	CAAAA	2	10	51358	51367	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011260	AATAA	2	10	51403	51412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011260	TAGTT	2	10	51463	51472	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011260	TGTCT	2	10	51821	51830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011260	AAGAA	2	10	52128	52137	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011260	ATTAG	2	10	52144	52153	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011260	ATTAT	2	10	52622	52631	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.