MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	ATTC	2	8	268	275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011260	TCCT	2	8	326	333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011260	AAAT	2	8	543	550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011260	ATTA	2	8	667	674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011260	GATT	2	8	675	682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011260	TTTA	2	8	1540	1547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011260	ATAA	2	8	1580	1587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011260	TAAA	2	8	1678	1685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011260	GCTT	2	8	1990	1997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011260	AATC	2	8	2308	2315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011260	ATTA	2	8	2624	2631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011260	GTCA	2	8	3334	3341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011260	CAAA	2	8	3739	3746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011260	ATAA	2	8	3762	3769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011260	ACCT	2	8	4064	4071	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011260	AAAT	2	8	4092	4099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011260	TTTA	2	8	4716	4723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011260	TTAA	2	8	8846	8853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011260	GAAG	2	8	9206	9213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011260	TAAG	2	8	9271	9278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011260	ATCA	2	8	9584	9591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011260	TTTC	2	8	9799	9806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011260	TCTT	2	8	10120	10127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011260	TATT	2	8	10145	10152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011260	ACAA	2	8	10185	10192	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011260	ATTA	2	8	10336	10343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011260	GATT	2	8	10344	10351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011260	AATA	2	8	10413	10420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011260	TAGA	2	8	10500	10507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011260	AATA	2	8	11136	11143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011260	ATTC	2	8	11796	11803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011260	ATAA	2	8	12124	12131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011260	AATT	2	8	12939	12946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011260	AACA	2	8	13330	13337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011260	ATTT	2	8	13404	13411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011260	AAAG	2	8	13437	13444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011260	ATTG	2	8	13543	13550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011260	GTAA	2	8	13736	13743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011260	GAAG	2	8	13771	13778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011260	AAAG	2	8	13818	13825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011260	AAAG	2	8	13992	13999	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011260	TGAA	2	8	14137	14144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011260	AAAT	2	8	14472	14479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011260	ATAA	2	8	14500	14507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011260	AATG	2	8	14814	14821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011260	CAAT	2	8	14877	14884	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011260	CATT	2	8	15139	15146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011260	AGAT	2	8	18988	18995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011260	ATTA	2	8	19000	19007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011260	GTCT	2	8	19248	19255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011260	ATTT	2	8	20983	20990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011260	TTCT	2	8	21081	21088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011260	TTTA	2	8	21209	21216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011260	CTTT	2	8	21247	21254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011260	TTGT	2	8	21853	21860	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011260	CTTT	2	8	21910	21917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011260	ATCT	2	8	22032	22039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011260	ATTA	2	8	22158	22165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011260	GGAA	2	8	22184	22191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011260	TATT	2	8	22255	22262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011260	ATTT	2	8	22376	22383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011260	AATG	2	8	22716	22723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011260	ATGT	2	8	22774	22781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011260	TTTA	2	8	22975	22982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011260	AATA	2	8	23230	23237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011260	AATT	2	8	23266	23273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011260	TTAT	2	8	23331	23338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011260	ATAA	2	8	24813	24820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011260	TAAT	2	8	24910	24917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011260	AAAG	2	8	25076	25083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011260	AGAA	2	8	25093	25100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011260	AATT	2	8	25563	25570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011260	CTAA	2	8	25577	25584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011260	CTAG	2	8	25586	25593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011260	GCTT	2	8	25792	25799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011260	AGTA	2	8	26147	26154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011260	AAAT	2	8	26259	26266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011260	TTTA	2	8	26314	26321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011260	AAGA	2	8	26413	26420	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011260	AACA	2	8	26452	26459	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011260	ATTC	2	8	26477	26484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011260	GAAA	2	8	26929	26936	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011260	TGAT	2	8	27144	27151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011260	CTTA	2	8	27455	27462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011260	CTTC	2	8	27520	27527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011260	AACA	2	8	27717	27724	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011260	TTAA	2	8	27884	27891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011260	ATTA	2	8	27894	27901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011260	CTTT	2	8	28284	28291	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011260	CCTT	2	8	28419	28426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011260	TCCT	2	8	28441	28448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011260	TCCT	2	8	28570	28577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011260	CAAA	2	8	28657	28664	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011260	AATA	2	8	28671	28678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011260	TAAA	2	8	28721	28728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011260	CTTC	2	8	29823	29830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011260	CTAT	2	8	29888	29895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011260	AGTA	2	8	30132	30139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011260	ATCA	2	8	30143	30150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011260	TGAA	2	8	30231	30238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011260	AGCA	2	8	31486	31493	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011260	AAAT	2	8	31509	31516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011260	CTAA	2	8	31598	31605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011260	TCAT	2	8	32275	32282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011260	ATTT	2	8	32421	32428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011260	AAAC	2	8	32715	32722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011260	ATTT	2	8	32899	32906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011260	ATAA	2	8	33418	33425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011260	TTTA	2	8	33718	33725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011260	ATTT	2	8	35878	35885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011260	GAAA	2	8	36913	36920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011260	ATTC	2	8	38402	38409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011260	TTTG	2	8	38414	38421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011260	TTAT	2	8	39348	39355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011260	ATTC	2	8	39357	39364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011260	TCTT	2	8	39375	39382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011260	AATT	2	8	40599	40606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011260	AAAC	2	8	40740	40747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011260	AAGA	2	8	40800	40807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011260	GTAA	2	8	41520	41527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011260	TAAA	2	8	41769	41776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011260	TAAA	2	8	41952	41959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011260	AAAG	2	8	42238	42245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011260	GAGT	2	8	42687	42694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011260	TAAA	2	8	42699	42706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011260	AATA	2	8	44994	45001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011260	AATT	2	8	45645	45652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011260	TTAG	2	8	45709	45716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011260	AGTA	2	8	46134	46141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011260	TAAA	2	8	46270	46277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011260	AATT	2	8	46617	46624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011260	TAAT	2	8	46650	46657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011260	TGAT	2	8	46917	46924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011260	ATGG	2	8	46943	46950	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011260	TAAA	2	8	47296	47303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011260	AAAG	2	8	47653	47660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011260	AGAA	2	8	48346	48353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011260	GAAG	2	8	48592	48599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011260	TTAA	2	8	48982	48989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011260	TGAG	2	8	49314	49321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011260	GTAA	2	8	49767	49774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011260	AAAG	2	8	49911	49918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011260	CAAT	2	8	50009	50016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011260	ATAA	2	8	50035	50042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011260	AGGT	2	8	50650	50657	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011260	AGGT	2	8	50767	50774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011260	AGGA	2	8	50950	50957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011260	AGTG	2	8	51188	51195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011260	TAAA	2	8	51292	51299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011260	AAAG	2	8	51491	51498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011260	AAGA	2	8	51637	51644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011260	GTAT	2	8	52099	52106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011260	TTAC	2	8	52278	52285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_011260	AATA	2	8	52375	52382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011260	ATTT	2	8	52612	52619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011260	TAAA	2	8	52709	52716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.