MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	TTC	2	6	7	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011260	AGG	2	6	96	101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011260	CCA	2	6	122	127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011260	TCC	2	6	226	231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011260	AAG	2	6	246	251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011260	AAT	2	6	284	289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011260	TCC	3	9	338	346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011260	CAC	2	6	359	364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011260	ATC	4	12	366	377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011260	ATT	2	6	381	386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011260	TAT	2	6	412	417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011260	CCT	2	6	497	502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011260	TAA	2	6	558	563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011260	ATA	2	6	627	632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011260	ATT	2	6	752	757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011260	ATT	2	6	763	768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011260	GAA	2	6	836	841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011260	ATT	2	6	1404	1409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011260	ATA	2	6	1658	1663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011260	ATC	2	6	1669	1674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011260	ACA	2	6	1689	1694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011260	CTT	2	6	1750	1755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011260	ATC	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011260	TAA	3	9	1863	1871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011260	TTG	2	6	1980	1985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011260	CAC	2	6	2038	2043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011260	ATA	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011260	ATA	2	6	2414	2419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011260	TTA	2	6	2529	2534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011260	TAT	2	6	2549	2554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011260	TAA	2	6	2602	2607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011260	ATA	2	6	2694	2699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011260	TTA	2	6	2766	2771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011260	AAT	2	6	2811	2816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011260	ATT	2	6	2875	2880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011260	GGA	2	6	2925	2930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011260	ATC	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011260	TTA	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011260	AAC	2	6	3057	3062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011260	ATT	2	6	3109	3114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011260	AAC	2	6	3187	3192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011260	TTA	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011260	ATG	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011260	TAT	2	6	3342	3347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011260	ATA	2	6	3350	3355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011260	AGA	2	6	3447	3452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011260	TTA	2	6	3542	3547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011260	GAT	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011260	ATA	2	6	3662	3667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011260	ATT	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011260	AAT	2	6	3697	3702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011260	GTT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011260	GTA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011260	TAG	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011260	TTA	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011260	CTA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011260	TAG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011260	ATT	2	6	4140	4145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011260	TAA	2	6	4664	4669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011260	TTA	2	6	4792	4797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011260	TGC	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011260	AAT	2	6	4873	4878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011260	TAT	2	6	4905	4910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011260	AGG	2	6	7760	7765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011260	GTT	2	6	7849	7854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011260	TTA	2	6	7858	7863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011260	TCA	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011260	GAT	2	6	7969	7974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011260	GAA	2	6	8047	8052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011260	GTT	2	6	8183	8188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011260	TGT	2	6	8948	8953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011260	GAC	2	6	9057	9062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011260	AAT	2	6	9141	9146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011260	GAA	2	6	9285	9290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011260	TAG	2	6	9358	9363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011260	GCA	2	6	9478	9483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011260	CAG	2	6	9502	9507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011260	CAG	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011260	CAC	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011260	CAG	2	6	9541	9546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011260	AAC	2	6	9611	9616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011260	CAG	2	6	9634	9639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011260	GCA	2	6	9645	9650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011260	CAG	2	6	9652	9657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011260	CTT	2	6	9682	9687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011260	CAA	2	6	9697	9702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011260	TTC	2	6	9834	9839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011260	TAT	2	6	9883	9888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011260	TTC	2	6	9999	10004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011260	CTC	3	9	10027	10035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011260	CAT	3	9	10059	10067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011260	ATC	2	6	10072	10077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011260	CAT	2	6	10080	10085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011260	TAC	2	6	10089	10094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011260	CTT	2	6	10112	10117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011260	TTC	2	6	10130	10135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011260	CCT	2	6	10139	10144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011260	ATG	2	6	10205	10210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011260	ATT	2	6	10223	10228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011260	ACA	2	6	10232	10237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011260	AAT	2	6	10297	10302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011260	ATT	2	6	10432	10437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011260	AAT	2	6	11055	11060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011260	TGC	2	6	11080	11085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011260	TAA	2	6	11086	11091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011260	CAT	3	9	11103	11111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011260	ACT	2	6	11161	11166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011260	TAA	2	6	11173	11178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011260	TAA	2	6	11206	11211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011260	ATC	2	6	11329	11334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011260	ATT	2	6	11374	11379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011260	ATA	2	6	11395	11400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011260	ATA	2	6	11442	11447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011260	TAT	2	6	11483	11488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011260	CAC	2	6	11489	11494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011260	AAT	2	6	11550	11555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011260	CAT	2	6	11576	11581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011260	GTA	2	6	11603	11608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011260	TCT	2	6	11644	11649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011260	TTA	2	6	11722	11727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011260	AAT	2	6	11747	11752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011260	GAT	2	6	11759	11764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011260	ATA	2	6	11782	11787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011260	CTT	2	6	11819	11824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011260	GTT	2	6	11845	11850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011260	CAG	2	6	11872	11877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011260	CCA	2	6	11919	11924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_011260	ATT	2	6	12071	12076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011260	ATT	2	6	12188	12193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011260	GTT	2	6	12220	12225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011260	CAA	2	6	12262	12267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011260	TAC	3	9	12346	12354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011260	AGA	2	6	13065	13070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011260	ATT	2	6	13282	13287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011260	AGA	2	6	13320	13325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011260	GAC	2	6	13369	13374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011260	AGA	2	6	13489	13494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011260	AAT	2	6	13555	13560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011260	TCT	2	6	13948	13953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011260	TAA	2	6	14054	14059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011260	ATT	2	6	14068	14073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011260	TAA	2	6	14077	14082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011260	ACA	2	6	14148	14153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011260	AAT	2	6	14293	14298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_011260	TAC	2	6	26234	26239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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