MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	TAA	2	6	868	873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288437
2	NC_011260	TAA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288437
3	NC_011260	TTA	2	6	1028	1033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
4	NC_011260	TAG	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288437
5	NC_011260	CTT	2	6	1118	1123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288437
6	NC_011260	TTA	2	6	1136	1141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
7	NC_011260	TAT	2	6	1158	1163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288437
8	NC_011260	CTA	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
9	NC_011260	TTC	2	6	1180	1185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288437
10	NC_011260	ATC	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
11	NC_011260	TAC	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
12	NC_011260	CAT	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288437
13	NC_011260	GTT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288438
14	NC_011260	AAT	2	6	4273	4278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288438
15	NC_011260	GAA	2	6	4303	4308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288438
16	NC_011260	ATA	2	6	4442	4447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288438
17	NC_011260	TGG	2	6	4470	4475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288438
18	NC_011260	TAA	2	6	4605	4610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288438
19	NC_011260	GAT	2	6	5108	5113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288439
20	NC_011260	AAC	2	6	5122	5127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288439
21	NC_011260	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288439
22	NC_011260	TAA	2	6	5236	5241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288439
23	NC_011260	AAC	2	6	5252	5257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288439
24	NC_011260	TTA	2	6	5267	5272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288439
25	NC_011260	ATG	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288439
26	NC_011260	TAT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288439
27	NC_011260	ATA	2	6	5415	5420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288439
28	NC_011260	AGA	2	6	5512	5517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288439
29	NC_011260	TTA	2	6	5608	5613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288439
30	NC_011260	CAA	2	6	5691	5696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288440
31	NC_011260	TTA	2	6	5721	5726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288440
32	NC_011260	TAT	2	6	5912	5917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288440
33	NC_011260	AAT	2	6	5941	5946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288440
34	NC_011260	ATG	2	6	5961	5966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288440
35	NC_011260	GTA	2	6	6185	6190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288440
36	NC_011260	AAT	2	6	6213	6218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288440
37	NC_011260	GTG	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288441
38	NC_011260	ATA	3	9	6574	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288441
39	NC_011260	AAT	2	6	6613	6618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288441
40	NC_011260	ATT	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288441
41	NC_011260	TAA	2	6	6689	6694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288441
42	NC_011260	ATA	2	6	6784	6789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288441
43	NC_011260	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288441
44	NC_011260	GAT	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288441
45	NC_011260	ATT	2	6	6896	6901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288441
46	NC_011260	AAT	2	6	6925	6930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288441
47	NC_011260	GAT	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288442
48	NC_011260	GTA	2	6	7120	7125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288442
49	NC_011260	GAT	2	6	7126	7131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288442
50	NC_011260	TAA	2	6	7137	7142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288442
51	NC_011260	TAT	2	6	7296	7301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288442
52	NC_011260	AAT	2	6	7321	7326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288442
53	NC_011260	ATA	2	6	7493	7498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288442
54	NC_011260	GGA	3	9	8276	8284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288443
55	NC_011260	GTA	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288443
56	NC_011260	TGA	2	6	8422	8427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288443
57	NC_011260	TGA	2	6	8476	8481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288443
58	NC_011260	TGG	2	6	8482	8487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288443
59	NC_011260	CAG	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288443
60	NC_011260	AAC	2	6	8559	8564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288443
61	NC_011260	TGA	2	6	8680	8685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288443
62	NC_011260	TTG	2	6	8745	8750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288443
63	NC_011260	TGA	2	6	8767	8772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288443
64	NC_011260	GTT	2	6	8773	8778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288443
65	NC_011260	TCT	2	6	8828	8833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288443
66	NC_011260	AAT	2	6	8834	8839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288443
67	NC_011260	TAA	2	6	10538	10543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288444
68	NC_011260	TAA	2	6	10561	10566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288444
69	NC_011260	TTA	2	6	10719	10724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288444
70	NC_011260	TAA	2	6	10756	10761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288444
71	NC_011260	TTC	2	6	10763	10768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288444
72	NC_011260	TAG	2	6	10843	10848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288444
73	NC_011260	ATT	2	6	10991	10996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288444
74	NC_011260	AAT	2	6	11001	11006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288444
75	NC_011260	TCC	2	6	12375	12380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288445
76	NC_011260	TTC	2	6	12421	12426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288445
77	NC_011260	TCT	2	6	12457	12462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288445
78	NC_011260	TCT	2	6	12491	12496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288445
79	NC_011260	CTA	2	6	12511	12516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288445
80	NC_011260	ATT	2	6	12600	12605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288445
81	NC_011260	AGT	2	6	12717	12722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288445
82	NC_011260	TAT	2	6	12740	12745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288445
83	NC_011260	TAC	2	6	12773	12778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288445
84	NC_011260	CAT	2	6	12845	12850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288445
85	NC_011260	CTT	2	6	12860	12865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288445
86	NC_011260	TTC	2	6	15621	15626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288446
87	NC_011260	CAA	2	6	15792	15797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288446
88	NC_011260	ACA	2	6	15841	15846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288446
89	NC_011260	TAA	2	6	15952	15957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288446
90	NC_011260	TAT	2	6	16049	16054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288446
91	NC_011260	TTA	2	6	16221	16226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288447
92	NC_011260	TCT	2	6	16266	16271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288447
93	NC_011260	CAA	2	6	16319	16324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288447
94	NC_011260	TAA	2	6	16409	16414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288447
95	NC_011260	ACT	2	6	16466	16471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288447
96	NC_011260	AAC	2	6	16472	16477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288447
97	NC_011260	TAT	2	6	16520	16525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288447
98	NC_011260	TAA	2	6	16547	16552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288447
99	NC_011260	CTT	2	6	16646	16651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288447
100	NC_011260	ATT	2	6	16682	16687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288447
101	NC_011260	ACA	2	6	16716	16721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288447
102	NC_011260	TAA	2	6	16747	16752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288447
103	NC_011260	TAG	2	6	16759	16764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288447
104	NC_011260	CAA	2	6	16814	16819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288447
105	NC_011260	ATT	2	6	16881	16886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288447
106	NC_011260	CCT	2	6	16919	16924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288448
107	NC_011260	TAA	2	6	16927	16932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288448
108	NC_011260	TCT	2	6	17201	17206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288448
109	NC_011260	CAA	2	6	17248	17253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288448
110	NC_011260	TTA	2	6	17291	17296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288448
111	NC_011260	CTA	2	6	17345	17350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288448
112	NC_011260	CAA	2	6	17457	17462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288449
113	NC_011260	CTC	2	6	17473	17478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288449
114	NC_011260	TAA	2	6	17522	17527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288449
115	NC_011260	ATT	2	6	17533	17538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288449
116	NC_011260	AAT	2	6	17577	17582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288449
117	NC_011260	TTC	2	6	17621	17626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288449
118	NC_011260	TCT	2	6	17675	17680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288449
119	NC_011260	TAT	2	6	17725	17730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288449
120	NC_011260	TAC	2	6	17751	17756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288449
121	NC_011260	CTT	2	6	17838	17843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288449
122	NC_011260	TTG	2	6	17887	17892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288449
123	NC_011260	TCT	2	6	17942	17947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288449
124	NC_011260	TTC	2	6	17948	17953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288449
125	NC_011260	TTA	2	6	17958	17963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288449
126	NC_011260	TGT	2	6	17986	17991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288449
127	NC_011260	ATC	2	6	18019	18024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288449
128	NC_011260	CTT	2	6	18037	18042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288449
129	NC_011260	TTC	2	6	18095	18100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288449
130	NC_011260	TTA	4	12	18101	18112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288449
131	NC_011260	TAT	3	9	18114	18122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288449
132	NC_011260	ATT	2	6	18169	18174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288449
133	NC_011260	GAT	2	6	18189	18194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288449
134	NC_011260	GTT	2	6	18207	18212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288449
135	NC_011260	TCT	2	6	18221	18226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288449
136	NC_011260	ATT	2	6	18412	18417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288449
137	NC_011260	TTA	3	9	18425	18433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288449
138	NC_011260	ATT	2	6	20103	20108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288450
139	NC_011260	TAT	2	6	20352	20357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288450
140	NC_011260	TCT	2	6	20441	20446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288450
141	NC_011260	TTA	2	6	20469	20474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288450
142	NC_011260	TAT	2	6	20544	20549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288450
143	NC_011260	TCA	2	6	20570	20575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288450
144	NC_011260	CTC	2	6	20598	20603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288450
145	NC_011260	TAA	2	6	20758	20763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288450
146	NC_011260	ATT	2	6	21294	21299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288451
147	NC_011260	TAC	2	6	21360	21365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288451
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149	NC_011260	CTT	2	6	21566	21571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288451
150	NC_011260	TTG	2	6	21594	21599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288451
151	NC_011260	TAT	3	9	21641	21649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288451
152	NC_011260	ACT	2	6	21660	21665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288451
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154	NC_011260	ATT	2	6	24193	24198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288452
155	NC_011260	TAA	2	6	24202	24207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288452
156	NC_011260	TGA	2	6	24313	24318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288452
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159	NC_011260	ATA	2	6	24594	24599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288452
160	NC_011260	TAT	2	6	24685	24690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288452
161	NC_011260	CTG	2	6	29015	29020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288453
162	NC_011260	TAT	2	6	29022	29027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288453
163	NC_011260	CTT	2	6	29061	29066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288453
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169	NC_011260	CTT	2	6	29315	29320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288453
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.