MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	CT	3	6	315	320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011260	CT	4	8	436	443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011260	CT	4	8	446	453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011260	TC	3	6	457	462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011260	TC	3	6	478	483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011260	CT	3	6	595	600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011260	AT	3	6	649	654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011260	TA	3	6	830	835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011260	TA	3	6	1398	1403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011260	AT	3	6	1564	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011260	TA	4	8	1638	1645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011260	AT	3	6	2507	2512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011260	CA	3	6	2586	2591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011260	AT	3	6	2704	2709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011260	AT	3	6	3247	3252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011260	AG	3	6	3477	3482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011260	AT	3	6	3837	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011260	TA	3	6	4004	4009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011260	AT	4	8	4112	4119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011260	TA	3	6	4157	4162	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
21	NC_011260	AT	3	6	4415	4420	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
22	NC_011260	AT	3	6	4625	4630	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
23	NC_011260	TA	3	6	5219	5224	50 %	50 %	0 %	0 %	203288439
24	NC_011260	AT	3	6	5312	5317	50 %	50 %	0 %	0 %	203288439
25	NC_011260	AG	3	6	5542	5547	50 %	0 %	50 %	0 %	203288439
26	NC_011260	GA	3	6	5833	5838	50 %	0 %	50 %	0 %	203288440
27	NC_011260	TA	3	6	6047	6052	50 %	50 %	0 %	0 %	203288440
28	NC_011260	AT	3	6	6423	6428	50 %	50 %	0 %	0 %	203288441
29	NC_011260	TA	3	6	6571	6576	50 %	50 %	0 %	0 %	203288441
30	NC_011260	AG	3	6	6759	6764	50 %	0 %	50 %	0 %	203288441
31	NC_011260	TA	4	8	7187	7194	50 %	50 %	0 %	0 %	203288442
32	NC_011260	AT	3	6	7263	7268	50 %	50 %	0 %	0 %	203288442
33	NC_011260	AG	3	6	7445	7450	50 %	0 %	50 %	0 %	203288442
34	NC_011260	TA	4	8	7635	7642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011260	AT	3	6	8097	8102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011260	AG	3	6	8136	8141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011260	TA	3	6	9065	9070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011260	AG	3	6	9314	9319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011260	AG	3	6	9430	9435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011260	TC	3	6	10893	10898	0 %	50 %	0 %	50 %	203288444
41	NC_011260	AT	3	6	11712	11717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011260	TA	4	8	12355	12362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011260	TC	5	10	12542	12551	0 %	50 %	0 %	50 %	203288445
44	NC_011260	AC	3	6	13244	13249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011260	AT	3	6	13302	13307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011260	AT	3	6	13527	13532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011260	AT	3	6	13673	13678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011260	AT	3	6	14036	14041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011260	AT	3	6	14273	14278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011260	AT	3	6	15166	15171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011260	TA	3	6	15397	15402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011260	TA	3	6	15881	15886	50 %	50 %	0 %	0 %	203288446
53	NC_011260	AT	3	6	16056	16061	50 %	50 %	0 %	0 %	203288446
54	NC_011260	TC	3	6	16172	16177	0 %	50 %	0 %	50 %	203288447
55	NC_011260	AT	3	6	16192	16197	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
56	NC_011260	TA	3	6	16211	16216	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
57	NC_011260	AT	3	6	16367	16372	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
58	NC_011260	AT	4	8	16700	16707	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
59	NC_011260	AC	3	6	17058	17063	50 %	0 %	0 %	50 %	203288448
60	NC_011260	TA	3	6	17086	17091	50 %	50 %	0 %	0 %	203288448
61	NC_011260	AT	3	6	17649	17654	50 %	50 %	0 %	0 %	203288449
62	NC_011260	AG	3	6	18007	18012	50 %	0 %	50 %	0 %	203288449
63	NC_011260	TC	3	6	18312	18317	0 %	50 %	0 %	50 %	203288449
64	NC_011260	TA	3	6	18481	18486	50 %	50 %	0 %	0 %	203288449
65	NC_011260	AG	3	6	18772	18777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011260	AT	3	6	18885	18890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011260	AT	3	6	18951	18956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011260	TA	3	6	19052	19057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011260	TA	4	8	19165	19172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011260	AT	3	6	19853	19858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011260	AT	3	6	20044	20049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011260	TA	3	6	20076	20081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011260	AT	3	6	20268	20273	50 %	50 %	0 %	0 %	203288450
74	NC_011260	TC	3	6	20948	20953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011260	GA	3	6	21122	21127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011260	TC	3	6	21130	21135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011260	AT	3	6	21748	21753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011260	TA	3	6	22113	22118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011260	AT	3	6	22346	22351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011260	AT	3	6	22359	22364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011260	AT	3	6	22493	22498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011260	AT	3	6	22569	22574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011260	AT	4	8	23191	23198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011260	TA	3	6	24209	24214	50 %	50 %	0 %	0 %	203288452
85	NC_011260	TA	3	6	24233	24238	50 %	50 %	0 %	0 %	203288452
86	NC_011260	CT	3	6	24989	24994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011260	AG	3	6	25135	25140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011260	AG	3	6	25152	25157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011260	GA	3	6	25161	25166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011260	GA	3	6	25168	25173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011260	AT	3	6	26346	26351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011260	AT	3	6	26423	26428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011260	TG	3	6	26531	26536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011260	CT	3	6	27298	27303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011260	CT	3	6	27414	27419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011260	TC	3	6	28530	28535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011260	TC	4	8	28554	28561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011260	TC	3	6	28587	28592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011260	TA	3	6	28700	28705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011260	TC	3	6	28829	28834	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
101	NC_011260	AT	3	6	29174	29179	50 %	50 %	0 %	0 %	203288453
102	NC_011260	TC	4	8	29507	29514	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
103	NC_011260	TC	3	6	29558	29563	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
104	NC_011260	TG	3	6	29946	29951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011260	TC	3	6	31620	31625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011260	AT	3	6	32247	32252	50 %	50 %	0 %	0 %	203288455
107	NC_011260	AC	3	6	32951	32956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011260	AT	3	6	33404	33409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011260	CT	3	6	33629	33634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011260	AT	3	6	33663	33668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011260	AT	3	6	33712	33717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011260	AT	3	6	33751	33756	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
113	NC_011260	AT	3	6	33864	33869	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
114	NC_011260	AT	3	6	33949	33954	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
115	NC_011260	TA	3	6	33989	33994	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
116	NC_011260	AT	3	6	34235	34240	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
117	NC_011260	TA	3	6	34642	34647	50 %	50 %	0 %	0 %	203288457
118	NC_011260	TA	3	6	34681	34686	50 %	50 %	0 %	0 %	203288457
119	NC_011260	AT	3	6	35437	35442	50 %	50 %	0 %	0 %	203288458
120	NC_011260	TA	3	6	35530	35535	50 %	50 %	0 %	0 %	203288458
121	NC_011260	TG	4	8	35771	35778	0 %	50 %	50 %	0 %	203288458
122	NC_011260	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011260	AG	4	8	37064	37071	50 %	0 %	50 %	0 %	203288459
124	NC_011260	GA	3	6	37183	37188	50 %	0 %	50 %	0 %	203288459
125	NC_011260	AG	3	6	38049	38054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011260	CT	3	6	38063	38068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011260	AT	3	6	38193	38198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011260	AG	4	8	38522	38529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011260	AG	3	6	38533	38538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011260	GA	3	6	38695	38700	50 %	0 %	50 %	0 %	203288460
131	NC_011260	TA	3	6	39206	39211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011260	AG	3	6	39491	39496	50 %	0 %	50 %	0 %	203288461
133	NC_011260	AG	3	6	39503	39508	50 %	0 %	50 %	0 %	203288461
134	NC_011260	AT	3	6	40158	40163	50 %	50 %	0 %	0 %	203288461
135	NC_011260	CT	3	6	40640	40645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011260	TA	3	6	40672	40677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011260	AG	3	6	40790	40795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011260	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011260	GA	3	6	40958	40963	50 %	0 %	50 %	0 %	203288462
140	NC_011260	GA	3	6	41337	41342	50 %	0 %	50 %	0 %	203288462
141	NC_011260	AT	3	6	41490	41495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011260	TA	3	6	42822	42827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011260	AG	3	6	42859	42864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011260	CT	3	6	42873	42878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011260	TA	3	6	42906	42911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011260	AG	3	6	43314	43319	50 %	0 %	50 %	0 %	203288463
147	NC_011260	GA	3	6	44044	44049	50 %	0 %	50 %	0 %	203288463
148	NC_011260	AG	3	6	44139	44144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011260	CT	3	6	44156	44161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011260	AG	3	6	44259	44264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011260	AG	3	6	44292	44297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011260	AG	4	8	44302	44309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011260	AG	5	10	44313	44322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011260	GT	3	6	45057	45062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_011260	AT	3	6	45234	45239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_011260	TA	3	6	45352	45357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.